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[请教] 请教:T载体连接原理 [复制链接]

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楼主
发表于 2011-8-16 20:28 |只看该作者 |倒序浏览 |打印
21包包
        这是困扰我多时的问题,大家都知道用Taq酶扩增的PCR产物由于3‘端含有突出的A,可以连入T载体。但由于普通合成的引物的5’端没有磷酸基,致使用Taq酶扩增的PCR产物的5‘端是没有磷酸基的。现在我的问题是T载体试剂盒是如何实现处的连接的。
( H" Z  d9 z( w        我的看法是体系中含有5’磷酸化酶,PCR产物的5‘端先加上了磷酸基。大家有何看法呢?8 U8 Q. S$ k5 ?& M3 u& {9 V; i
6 [! A. a/ Z4 M- X  N
        如果是这样的话,那么我们用合成引物再退火的方法得到的片段是不是可以用T载体试剂盒提供的试剂进行连接,以简化实验流程。

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我认为将Taq 酶PCR聚合产物与T载体连接不需要磷酸酶,尽管我们普通合成的引物5‘端为-OH,而不是磷酸基团,但是T4 ligase之类的连接酶可以将PCR产物3’段-OH与T vector 5‘端磷酸基团连接形成3,5磷酸二酯键,然后剩下PCR产物5’端-OH与T vector 3‘端-OH无法连接,产生gap。当我们将这些带有gap的质粒转化E.coli后,细菌体内的DNA修复系统可以将PCR产物与T vector完整连接起来,成为名副其实的PLASMID.
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沙发
发表于 2011-8-16 20:28 |只看该作者
我认为将Taq 酶PCR聚合产物与T载体连接不需要磷酸酶,尽管我们普通合成的引物5‘端为-OH,而不是磷酸基团,但是T4 ligase之类的连接酶可以将PCR产物3’段-OH与T vector 5‘端磷酸基团连接形成3,5磷酸二酯键,然后剩下PCR产物5’端-OH与T vector 3‘端-OH无法连接,产生gap。当我们将这些带有gap的质粒转化E.coli后,细菌体内的DNA修复系统可以将PCR产物与T vector完整连接起来,成为名副其实的PLASMID.
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藤椅
发表于 2011-8-17 09:43 |只看该作者
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板凳
发表于 2011-8-17 17:35 |只看该作者
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不知道你所说的合成引物退火得到的片段是不是一个短片段。
% U+ h. [( l! \7 L- m) m转化大肠杆菌是只要你两个gap之间的序列够稳定,转化到大肠杆菌都可以自己修复的。
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报纸
发表于 2011-8-18 10:10 |只看该作者
二楼说的很对,不过若是载体再去磷酸化的话就不能再用未经处理的PCR产物进行连接了。或者说不能将两段PCR产物直接进行连接。
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地板
发表于 2011-8-20 20:45 |只看该作者
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发表于 2011-8-21 18:55 |只看该作者
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发表于 2011-8-21 18:55 |只看该作者
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发表于 2011-8-21 18:56 |只看该作者
论坛貌似有点小问题。。。。。
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