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求助:CD133在流式中标记不上肿瘤干细胞   [复制链接]

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包包
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楼主
发表于 2011-9-23 23:57 |只看该作者 |倒序浏览 |打印
各位前辈:我用美天妮的CD133/2(293c3)-PE抗体标记胰腺癌肿瘤干细胞,重复了3次,一直标记不上,流式显示为阴性。操作过程按抗体说明书进行,不知哪里出了问题?请各位大侠救命呀!!!按照文献所测的细胞肿瘤干细胞含量在10%以上,应该不是细胞本身阴性表达。
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沙发
发表于 2011-9-24 11:58 |只看该作者
copy昨天晚上的一个回复:
! i8 m0 Z) A; w5 @2 n1 D. u/ yInternational Journal of Cancer上的两篇读者来信你可以看看
1 y+ g# V1 A: K# Oit has been observed that HCT-116 cells are described as either lacking or fully expressing CD133 glycoprotein.在其他细胞系上也有类似的现象。影响CD133表达的因素有很多。两篇读者来信标题如下(wiley上可以下载到):
. U9 M. t8 a7 ~4 l4 A) f2 dDivergent expression of CD133 in different studies on HCT-116 cell line6 \: ~" R' Z" I3 r, O
Divergent expression of CD133 in different studies: the need for a consensus panel?
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藤椅
发表于 2011-9-24 12:03 |只看该作者
有没有做阳性对照?如果阳性对照也检测不出来就是系统问题了。另外阴性对照也要做。" n! i. X# M% t& \1 G
你用的流失细胞仪是哪家的,仪器操作要设好门,如果圈定的细胞不对,结构分析当然出不来。
$ p& n5 S8 \1 u/ g3 R; t此外,以上都没有问题的话,建议增加抗体使用浓度,延长孵化时间,提高仪器的检测限。
2 U. V: k% Y* C. y2 O! x有一点我提出疑问,你看的哪里的文献报道说胰腺癌肿瘤干细胞含量在10%以上?我很质疑!肿瘤干细胞有这么高的含量现在针对它的研究还会这么困难么?我们以前用CD133标记分离过肝癌细胞系的肿瘤干细胞,顶多1%。所以你要加大分析的细胞数量,让流失细胞仪数10万个细胞以上,可能会得到阳性结果。
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板凳
发表于 2011-9-24 13:55 |只看该作者
干细胞之家微信公众号
我处理的是胰腺癌细胞ASPC-1,按照华科的一篇文章(http://so.med.wanfangdata.com.cn/ViewHTML/DegreePaper_D088873.aspx),该细胞SP细胞的比例为16.88%,我猜想该细胞CD133高表达。。。我还同时测了其他4种胰腺癌细胞株,结果都一样。用的机器是BD FACS Aria,样本有三种:未处理的肿瘤细胞,用同型对照孵育过的肿瘤细胞,用CD133/2(293c3)-PE抗体孵育过的肿瘤细胞。buffer用的是PBS+10%胎牛,孵育条件增加到室温30min,细胞量约在3x10e5个。
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报纸
发表于 2011-9-24 17:21 |只看该作者
你的阳性对照能够检测出来吧,这样才能排除检测实验系统的问题。
3 b6 A, T0 g$ q* ?) M& T! p问一下,你标记细胞之前用的是什么试剂来封闭细胞的?这个很重要。
3 T* r! e" i0 Q" y! O  w还有,配抗体的Buffer里面为什么要加10%胎牛血清,我以前做流式没有加过这个。直接是收细胞-封闭-抗体孵育-清洗-检测。# [8 w+ t0 ]$ M+ r  c
加入血清会不会影响抗体结合到细胞?血清中和了大部分的抗体,因而标记不到细胞上?我严重怀疑这一点!2 \  |" `1 c0 F4 _3 i# p+ I$ r2 ?
孵育时间30min足够,你怕标记不上也可以延长到1小时。- Q# ^  ~" P- a- @
目前根据你的描述,我能提出的问题就这些,希望对你有用。
* f/ {' [" S, N1 K/ L7 q7 [  k还有就是楼上那位说不同细胞表达CD133的差异很大,培养条件等影响因素很多,也是值得思考的。
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地板
发表于 2011-9-24 22:11 |只看该作者
非常感谢!!!$ ]% V% D8 G9 ^+ C  x- @
请问你封闭用的什么?buffer是怎么配的?7 J( F8 H8 G" t+ p! Z4 |
我是按照抗体说明书操作的:
. _5 A2 @1 d5 z0 o* d. Z" jBuffer: Prepare a solution containing phosphate buffered saline
1 @3 ]6 Y* H& b9 T1 W(PBS) pH 7.2, 0.5% bovine serum albumin (BSA) and 2 mM& L3 K8 s. u6 {' s1 u& L: V1 n1 n! Q
EDTA by diluting MACS BSA Stock Solution (# 130-091-376)( P% U2 E0 t* n) {) h
1:20 with autoMACS™ Rinsing Solution (# 130-091-222). Keep
9 N! O) l/ \/ wbuffer cold (4−8 °C).
- A. P3 X5 N: v% y. F* Y▲ Note: EDTA can be replaced by other supplements such as anticoagulant, Z; t$ K; U. A) U, D* D  Q
citrate dextrose formula-A (ACD-A) or citrate phosphate dextrose (CPD)." ~4 v8 z6 _8 K$ J8 f9 K' j& L+ s, L
BSA can be replaced by other proteins such as human serum albumin, human, f( H; h, x) D0 ]
serum, or fetal calf serum. Buffers or media containing Ca2+ or Mg2+ are not
/ _2 ^4 q. Q* Q* X0 drecommended for use.  `& z! o; D: K& |7 B) g
General protocol for immunofluorescent staining:
7 H6 W: C4 \+ G% }1. Resuspend up to 10⁷ nucleated cells per 80 μL of buffer.
- N  U" E3 z2 W/ ^. m" `! j2. Add 20 μL of FcR Blocking Reagent.
, t, i1 i8 K( t+ [3. Add 10 μL of the CD133/2 (293C3) antibody.
7 d6 \) N7 S1 k6 X" a' d' i1 ?  C4. Mix well and refrigerate for 10 minutes in the dark (4−8 °C).
+ h4 V: d5 |' R2 U' o▲ Note: Working on ice requires increased incubation times. Higher temperatures/ z% V" T+ P- k4 |
and/or longer incubation times lead to non-specific cell labeling.
) r5 F2 p2 X& W5. Wash cells by adding 1−2 mL of buffer per 10⁷ cells and+ u; b6 P: e1 h+ E( r4 X- E( f
centrifuge at 300×g for 10 minutes. Aspirate supernatant
9 d$ G8 a% }( {+ _0 scompletely.
$ x0 S3 H# F) @3 }' U9 I5 M! g2 ?6. (Optional) If CD133/2 (293C3)-Biotin was used, resuspend the$ L3 a! o- w$ v0 Z
cell pellet in 100 μL of buffer, add 10 μL of anti-biotin antibody4 s; M( _' Y& c; }
(Anti-Biotin-FITC # 130-090-857, Anti-Biotin-PE # 130-090-3 V9 a; Y$ z: k* c( d8 o( \
756, or Anti-Biotin-APC # 130-090-856), and continue as
* j" g, W2 r/ P1 Sdescribed in steps 4 and 5.
7 ]) c. {" d# A: g3 g7. Resuspend cell pellet in a suitable amount of buffer for analysis2 i, @! Q* F1 E
by flow cytometry or fluorescence microscopy.
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发表于 2011-9-24 22:20 |只看该作者
https://www.miltenyibiotec.com/en/PG_595_203_CD133_2_293C3_.aspx
# u+ Y! y2 O+ {: c该网站右下角有CD133/2(293c3)-PE抗体的说明书

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发表于 2011-9-25 20:57 |只看该作者
我以前用的配抗体的buffer都是用的普通的PBS,没有说明书用的那么复杂。建议简化实验步骤,不要引进太多影响实验结果的因素。. T3 w/ S( }% _* A8 S
封闭液用的是1-3%的FBS,也是用PBS配制的。
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发表于 2011-9-29 08:55 |只看该作者
排除你实验操作的问题后,我比较同意昨天晚上那人的回复。有些干细胞就是不表达CD133的。CD133 is not restricted to somatic stem cells and cancer stem cells.
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发表于 2011-10-9 20:52 |只看该作者
建议再标一个CD34看看~
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