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求助:CD133在流式中标记不上肿瘤干细胞   [复制链接]

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包包
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楼主
发表于 2011-9-23 23:57 |只看该作者 |倒序浏览 |打印
各位前辈:我用美天妮的CD133/2(293c3)-PE抗体标记胰腺癌肿瘤干细胞,重复了3次,一直标记不上,流式显示为阴性。操作过程按抗体说明书进行,不知哪里出了问题?请各位大侠救命呀!!!按照文献所测的细胞肿瘤干细胞含量在10%以上,应该不是细胞本身阴性表达。
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沙发
发表于 2011-9-24 11:58 |只看该作者
copy昨天晚上的一个回复:
9 b" y/ i+ ~" x4 Y5 T( _* K) gInternational Journal of Cancer上的两篇读者来信你可以看看8 d, A7 z5 {2 B8 G+ ^. r
it has been observed that HCT-116 cells are described as either lacking or fully expressing CD133 glycoprotein.在其他细胞系上也有类似的现象。影响CD133表达的因素有很多。两篇读者来信标题如下(wiley上可以下载到):
# Z5 w1 \( n* H0 {9 h* s) o9 jDivergent expression of CD133 in different studies on HCT-116 cell line
& x( ]( c; |3 D" BDivergent expression of CD133 in different studies: the need for a consensus panel?
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藤椅
发表于 2011-9-24 12:03 |只看该作者
有没有做阳性对照?如果阳性对照也检测不出来就是系统问题了。另外阴性对照也要做。
4 A0 u& z% V$ L4 G6 }! b: I/ u( z你用的流失细胞仪是哪家的,仪器操作要设好门,如果圈定的细胞不对,结构分析当然出不来。
' v' w% J: M6 W% J+ n- |' S( d9 s此外,以上都没有问题的话,建议增加抗体使用浓度,延长孵化时间,提高仪器的检测限。, ]7 c/ {/ _, i$ [" X  O
有一点我提出疑问,你看的哪里的文献报道说胰腺癌肿瘤干细胞含量在10%以上?我很质疑!肿瘤干细胞有这么高的含量现在针对它的研究还会这么困难么?我们以前用CD133标记分离过肝癌细胞系的肿瘤干细胞,顶多1%。所以你要加大分析的细胞数量,让流失细胞仪数10万个细胞以上,可能会得到阳性结果。
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板凳
发表于 2011-9-24 13:55 |只看该作者
干细胞之家微信公众号
我处理的是胰腺癌细胞ASPC-1,按照华科的一篇文章(http://so.med.wanfangdata.com.cn/ViewHTML/DegreePaper_D088873.aspx),该细胞SP细胞的比例为16.88%,我猜想该细胞CD133高表达。。。我还同时测了其他4种胰腺癌细胞株,结果都一样。用的机器是BD FACS Aria,样本有三种:未处理的肿瘤细胞,用同型对照孵育过的肿瘤细胞,用CD133/2(293c3)-PE抗体孵育过的肿瘤细胞。buffer用的是PBS+10%胎牛,孵育条件增加到室温30min,细胞量约在3x10e5个。
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报纸
发表于 2011-9-24 17:21 |只看该作者
你的阳性对照能够检测出来吧,这样才能排除检测实验系统的问题。' `8 p, H: P; V( l& w2 y0 T
问一下,你标记细胞之前用的是什么试剂来封闭细胞的?这个很重要。2 J  e- D' u8 ~% s0 i
还有,配抗体的Buffer里面为什么要加10%胎牛血清,我以前做流式没有加过这个。直接是收细胞-封闭-抗体孵育-清洗-检测。
! `: T( [( a4 a7 a加入血清会不会影响抗体结合到细胞?血清中和了大部分的抗体,因而标记不到细胞上?我严重怀疑这一点!% h( p* |) e! M) Y4 E
孵育时间30min足够,你怕标记不上也可以延长到1小时。! s; r' e* x  U
目前根据你的描述,我能提出的问题就这些,希望对你有用。
5 V9 \9 `, E; t2 a7 q% x  m还有就是楼上那位说不同细胞表达CD133的差异很大,培养条件等影响因素很多,也是值得思考的。
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地板
发表于 2011-9-24 22:11 |只看该作者
非常感谢!!!
/ d8 s) Y$ h2 h1 M请问你封闭用的什么?buffer是怎么配的?+ F2 g6 k2 _" {* S8 d
我是按照抗体说明书操作的:
8 V* n- \9 K" _' w/ y5 IBuffer: Prepare a solution containing phosphate buffered saline, u: |2 o4 f5 Z, o6 g
(PBS) pH 7.2, 0.5% bovine serum albumin (BSA) and 2 mM3 K. A, e. R  v; p! Z
EDTA by diluting MACS BSA Stock Solution (# 130-091-376)
! i* e6 J4 K' R1:20 with autoMACS™ Rinsing Solution (# 130-091-222). Keep
8 u) W; d7 c: _4 h# n) ?buffer cold (4−8 °C).8 Z$ P( x8 z( m  n: V2 I9 N
▲ Note: EDTA can be replaced by other supplements such as anticoagulant' m$ z% I" g- @' O5 u- U  a0 M
citrate dextrose formula-A (ACD-A) or citrate phosphate dextrose (CPD).
! v: ]% h" ^! ^: OBSA can be replaced by other proteins such as human serum albumin, human: E+ o' M" z* e% r' u" ^
serum, or fetal calf serum. Buffers or media containing Ca2+ or Mg2+ are not) Q7 W& C' f; Z# d* @1 i
recommended for use.* ~5 G! }9 \* O  Z( X# y: z7 ~- |
General protocol for immunofluorescent staining:" N" O1 B' ^8 o- ?6 C4 R7 N
1. Resuspend up to 10⁷ nucleated cells per 80 μL of buffer.5 S, v! A" @8 h4 }& w0 v& C
2. Add 20 μL of FcR Blocking Reagent.5 K0 R4 Q- w* N& H% S0 R5 Q9 v3 e4 E
3. Add 10 μL of the CD133/2 (293C3) antibody.
. D  y# q* k& ]! P% M4. Mix well and refrigerate for 10 minutes in the dark (4−8 °C).
! f$ D  i+ I% ~& b- b% ^9 k# ]▲ Note: Working on ice requires increased incubation times. Higher temperatures
4 _' |% `1 a( ~, Wand/or longer incubation times lead to non-specific cell labeling., m- W  N% B# T9 j3 E
5. Wash cells by adding 1−2 mL of buffer per 10⁷ cells and
) a( r% V6 ]4 g& w4 m! r7 K' [: S$ ?2 ?8 vcentrifuge at 300×g for 10 minutes. Aspirate supernatant" k, D& e; w% Q& i+ S7 w
completely.3 ]7 H5 g  S1 T* a6 X2 ?: ^3 L4 h  |
6. (Optional) If CD133/2 (293C3)-Biotin was used, resuspend the
" A7 j2 Z+ C+ X: T. T/ l; U3 Jcell pellet in 100 μL of buffer, add 10 μL of anti-biotin antibody
; y1 {+ J6 h# g8 M* h- y2 u5 O) H(Anti-Biotin-FITC # 130-090-857, Anti-Biotin-PE # 130-090-
' I% B' `2 S* B756, or Anti-Biotin-APC # 130-090-856), and continue as( n$ ~  i% @, H
described in steps 4 and 5.: N1 t# e: P, `2 N( X; {, }
7. Resuspend cell pellet in a suitable amount of buffer for analysis( g$ f# ]5 j, r2 k  d  o8 F5 ?
by flow cytometry or fluorescence microscopy.
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发表于 2011-9-24 22:20 |只看该作者
https://www.miltenyibiotec.com/en/PG_595_203_CD133_2_293C3_.aspx) P0 z+ ~% m" Q' U" w
该网站右下角有CD133/2(293c3)-PE抗体的说明书

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发表于 2011-9-25 20:57 |只看该作者
我以前用的配抗体的buffer都是用的普通的PBS,没有说明书用的那么复杂。建议简化实验步骤,不要引进太多影响实验结果的因素。
5 u- |2 P7 f' m: \2 G' \封闭液用的是1-3%的FBS,也是用PBS配制的。
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发表于 2011-9-29 08:55 |只看该作者
排除你实验操作的问题后,我比较同意昨天晚上那人的回复。有些干细胞就是不表达CD133的。CD133 is not restricted to somatic stem cells and cancer stem cells.
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发表于 2011-10-9 20:52 |只看该作者
建议再标一个CD34看看~
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