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求助:CD133在流式中标记不上肿瘤干细胞   [复制链接]

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包包
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楼主
发表于 2011-9-23 23:57 |只看该作者 |倒序浏览 |打印
各位前辈:我用美天妮的CD133/2(293c3)-PE抗体标记胰腺癌肿瘤干细胞,重复了3次,一直标记不上,流式显示为阴性。操作过程按抗体说明书进行,不知哪里出了问题?请各位大侠救命呀!!!按照文献所测的细胞肿瘤干细胞含量在10%以上,应该不是细胞本身阴性表达。
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沙发
发表于 2011-9-24 11:58 |只看该作者
copy昨天晚上的一个回复:" J' e# A; I3 K1 B& ?
International Journal of Cancer上的两篇读者来信你可以看看
* E- Y; R- E: ^  y2 C3 eit has been observed that HCT-116 cells are described as either lacking or fully expressing CD133 glycoprotein.在其他细胞系上也有类似的现象。影响CD133表达的因素有很多。两篇读者来信标题如下(wiley上可以下载到):0 D; {: q' C2 ?
Divergent expression of CD133 in different studies on HCT-116 cell line
& Q7 @. |% f9 m# }% f+ @Divergent expression of CD133 in different studies: the need for a consensus panel?
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藤椅
发表于 2011-9-24 12:03 |只看该作者
有没有做阳性对照?如果阳性对照也检测不出来就是系统问题了。另外阴性对照也要做。4 _! T9 ?: y7 O/ U
你用的流失细胞仪是哪家的,仪器操作要设好门,如果圈定的细胞不对,结构分析当然出不来。. n7 g+ k1 g7 W7 z9 `
此外,以上都没有问题的话,建议增加抗体使用浓度,延长孵化时间,提高仪器的检测限。# y, l, K" P3 W/ x  L+ n2 ^% _3 S
有一点我提出疑问,你看的哪里的文献报道说胰腺癌肿瘤干细胞含量在10%以上?我很质疑!肿瘤干细胞有这么高的含量现在针对它的研究还会这么困难么?我们以前用CD133标记分离过肝癌细胞系的肿瘤干细胞,顶多1%。所以你要加大分析的细胞数量,让流失细胞仪数10万个细胞以上,可能会得到阳性结果。
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板凳
发表于 2011-9-24 13:55 |只看该作者
干细胞之家微信公众号
我处理的是胰腺癌细胞ASPC-1,按照华科的一篇文章(http://so.med.wanfangdata.com.cn/ViewHTML/DegreePaper_D088873.aspx),该细胞SP细胞的比例为16.88%,我猜想该细胞CD133高表达。。。我还同时测了其他4种胰腺癌细胞株,结果都一样。用的机器是BD FACS Aria,样本有三种:未处理的肿瘤细胞,用同型对照孵育过的肿瘤细胞,用CD133/2(293c3)-PE抗体孵育过的肿瘤细胞。buffer用的是PBS+10%胎牛,孵育条件增加到室温30min,细胞量约在3x10e5个。
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报纸
发表于 2011-9-24 17:21 |只看该作者
你的阳性对照能够检测出来吧,这样才能排除检测实验系统的问题。
; r  ^* q' H4 b# D$ Y) _' e8 ?问一下,你标记细胞之前用的是什么试剂来封闭细胞的?这个很重要。
, q, r+ B% s! a" e% \! A' J还有,配抗体的Buffer里面为什么要加10%胎牛血清,我以前做流式没有加过这个。直接是收细胞-封闭-抗体孵育-清洗-检测。
3 o" O( Y4 j' x加入血清会不会影响抗体结合到细胞?血清中和了大部分的抗体,因而标记不到细胞上?我严重怀疑这一点!6 W0 d2 N, ~# T/ T/ R. ^  u" H
孵育时间30min足够,你怕标记不上也可以延长到1小时。
/ i% |* }, ]' y& Q: @9 S目前根据你的描述,我能提出的问题就这些,希望对你有用。
6 m6 T  ^) y, X( s0 F* o) e1 W0 @还有就是楼上那位说不同细胞表达CD133的差异很大,培养条件等影响因素很多,也是值得思考的。
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地板
发表于 2011-9-24 22:11 |只看该作者
非常感谢!!!
% l& z  j: t6 M! N! @) S请问你封闭用的什么?buffer是怎么配的?" c3 W, C/ j( |
我是按照抗体说明书操作的:7 N, F# o( {% B& [; U8 _6 f+ K
Buffer: Prepare a solution containing phosphate buffered saline: E) i1 I# u5 U' Z0 y
(PBS) pH 7.2, 0.5% bovine serum albumin (BSA) and 2 mM
  }+ b; y: x7 hEDTA by diluting MACS BSA Stock Solution (# 130-091-376)6 L2 n; X4 }" k- B/ t8 |
1:20 with autoMACS™ Rinsing Solution (# 130-091-222). Keep8 H" s5 r) w  U
buffer cold (4−8 °C).' p$ a! U2 T+ C7 p7 F
▲ Note: EDTA can be replaced by other supplements such as anticoagulant$ ?6 M6 I: D1 \$ Y2 ?* l
citrate dextrose formula-A (ACD-A) or citrate phosphate dextrose (CPD).; X4 \$ V3 i2 z% r
BSA can be replaced by other proteins such as human serum albumin, human& F% _. L/ I7 ~' I) C% F9 P
serum, or fetal calf serum. Buffers or media containing Ca2+ or Mg2+ are not$ }1 x* j' P' |) {
recommended for use.
' f* A8 H$ M. }. z% O' n+ K General protocol for immunofluorescent staining:- g. X; `# s# G: l- I, T4 E, a4 H
1. Resuspend up to 10⁷ nucleated cells per 80 μL of buffer.
4 O" I! Z' S; c2. Add 20 μL of FcR Blocking Reagent.
! G5 P) F5 L) k% ~# a3. Add 10 μL of the CD133/2 (293C3) antibody.
+ Y7 h. X  v% S7 ]9 y+ l% D4. Mix well and refrigerate for 10 minutes in the dark (4−8 °C).
, J3 V% G1 D+ Y▲ Note: Working on ice requires increased incubation times. Higher temperatures
& r2 K2 }! C+ aand/or longer incubation times lead to non-specific cell labeling.& j8 B& j, S8 m4 v5 Q
5. Wash cells by adding 1−2 mL of buffer per 10⁷ cells and) p' @7 P% `  t0 l9 i/ p2 R# u
centrifuge at 300×g for 10 minutes. Aspirate supernatant
4 l! W& o: Z  @: o/ ]completely./ T; U! a$ m- ?/ z. K: Q
6. (Optional) If CD133/2 (293C3)-Biotin was used, resuspend the
8 \9 r8 z/ T( jcell pellet in 100 μL of buffer, add 10 μL of anti-biotin antibody  K& K3 P# q7 K" N- M5 O2 |
(Anti-Biotin-FITC # 130-090-857, Anti-Biotin-PE # 130-090-$ P, x6 h4 u/ e
756, or Anti-Biotin-APC # 130-090-856), and continue as2 h& }- X$ I2 l4 D" C
described in steps 4 and 5.* c4 ?% W/ H% F" k- A& N
7. Resuspend cell pellet in a suitable amount of buffer for analysis
% `- Y( B7 c/ m; o3 Z- h4 ?by flow cytometry or fluorescence microscopy.
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包包
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发表于 2011-9-24 22:20 |只看该作者
https://www.miltenyibiotec.com/en/PG_595_203_CD133_2_293C3_.aspx
: d2 v. d4 d' Q: |该网站右下角有CD133/2(293c3)-PE抗体的说明书

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发表于 2011-9-25 20:57 |只看该作者
我以前用的配抗体的buffer都是用的普通的PBS,没有说明书用的那么复杂。建议简化实验步骤,不要引进太多影响实验结果的因素。' n$ Q) m& y$ v9 X  h
封闭液用的是1-3%的FBS,也是用PBS配制的。
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发表于 2011-9-29 08:55 |只看该作者
排除你实验操作的问题后,我比较同意昨天晚上那人的回复。有些干细胞就是不表达CD133的。CD133 is not restricted to somatic stem cells and cancer stem cells.
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发表于 2011-10-9 20:52 |只看该作者
建议再标一个CD34看看~
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