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逆转录病毒的包装   [复制链接]

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楼主
发表于 2011-11-17 08:04 |只看该作者 |倒序浏览 |打印
1.我有一个含目的基因的逆转录病毒质粒,想将该质粒包装成病毒后再感染细胞。由于之前从未做过病毒包装,我想请教一下群里的各位朋友,包装病毒的过程以及测病毒滴度难不难啊?是自己做好呢还是交给公司做? * a% |1 C7 m, J( p
2.如果这个逆转录病毒质粒不包装成病毒,可以直接拿来转染细胞嘛?
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沙发
发表于 2011-11-17 09:10 |只看该作者
包装病毒并不难,一般用293T或293FT做转染,生产病毒,再感染目的细胞,我给你上传一份慢病毒和逆转录病毒的protocol,你看看,很简单。测滴度也不难,病毒感染293T细胞后的48h测,步骤如下: ①. 15万293T细胞48h即可刚好长至90-100%满,此时即可固定细胞,计数确定病毒滴度。
5 O; g- U2 J) ?9 o% H0 { ②. 将培养基用真空泵吸去部分,务必不要将其吸净,由于293T细胞易飘,固定及DAPI染色整个过程请务必保持293T细胞处于液面之下。用PBS涮3次。加入4% PFA室温固定30min, 24孔板每孔200ul。* I9 F1 V3 `1 x
③.用PBT洗2次,每次3分钟。* g3 ^$ b/ e2 _" a, l8 F0 r& h
④.PBS将DAPI 1000倍稀释,每孔加入200ul,避光室温静置5min。
$ Y. T( w' U) I! W/ k/ Z' N⑤.PBS洗2次,每次5分钟,即可在荧光显微镜下计数,取2-3处取平均值。# d4 G1 g3 v+ S3 U* D
⑥.病毒滴度(IU/mL)=荧光细胞占总细胞数的百分比÷加入的病毒上清体积×1.5×10*5×10*3
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藤椅
发表于 2011-11-17 09:10 |只看该作者
Retrovirus / lentivirus infection protocol7 ?; m6 Y1 N8 e7 q1 W5 |1 v
D1: Seed HEK293T cells in 10cm dish (cell density should be ~80% confluency right before transfection) ) T5 E4 n7 {3 M4 O1 s$ n3 {
*** Handle HEK293T cells gently to avoid detaching from dishes
/ d; D9 m2 K7 S& `' k& @8 @D2: After O/N incubation, transfect the following vectors with proper reagents (Fugene 6, Lipofectamine 2000, polyjet et al) following their instruction8 g1 k/ f0 K% w) p4 J8 }
For retrovirus: 12ug of gene of interest, 6ug of Gag/pol, 1.5ug of VSVG
, B& ?: ~3 p, L/ K* Q( {For Lentivirus: 12ug of gene of interest, 6ug of Δ8.9, 1.5ug of VSVG " Z8 J! D( l# u" D
*** ~6 hours after transfection, change medium to fresh DMEM with 1% FBS supplied with P/S, and incubate at 37°C for ~48hs (two overnights)3 `; |5 b$ x* d7 t3 v
D3: Seed target cells for infection in 6-well plate (60~80% confluency before infection)" |$ C7 z* ^# x" a4 L, U
D4: Collect viral supernatant from HEK293T cells into 15ml tubes5 K6 r: E, ^7 t% R; A  D7 S2 J
↓ spin down at 2000RPM for 3mins to remove cell debris) Z5 D# t3 ]- g2 J. F
↓ pass the viral supernatant through 0.2um or 0.44um filter (called D1 virus)3 k7 Z" U; I3 t' y3 @
↓ Wash cell in 6-well plate with 1XPBS
  e- }9 o, g9 l- N  j6 a' {↓ Add 1.5ml of filtered viral supernatant to target cells in 6-well plate, then add 8ug/ml of polybrene (by adding 1.5ul of 8mg/ml stock) " c5 z: B/ U; C7 |. {9 @- k
↓ Incubate the cells in 6-well plate at 37°C for ~6hrs5 t, `4 J5 v% i% O
↓Add FBS or complete cell culture medium to make final FBS concentration close to ~10%
4 Z! r* [. Y& j) W5 u* L↓ Incubate at 37°C for overnight. A2 w, }0 L) o9 x; F! G7 ~
*** After collecting D1 virus, you can add more DMEM with 1%FBS into HEK293T cells and collect D2 virus after incubating overnight. But the D2 virus usually has lower viral concentration.  \$ i$ h, n9 H: O
*** For retrovirus, you may need to repeat the infection for three times; for lentivirus, one time infection is enough in most of the cases." {7 ]9 o. C4 ]% h! n; \9 y1 U) O' c
*** The leftover of the viral supernatant can be stored at -80°C.) K5 d- C3 `* c" y6 u
D5: You may start selection with antibiotics if your cells don’t need further infection
( X& D& h( n- L*** You need to titrate the antibiotic concentration for selection in your cells ahead% W$ }! J) M9 |' Z9 a% R5 U
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板凳
发表于 2011-11-17 09:57 |只看该作者
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回复 zhangtang 的帖子9 x* C: G4 U) V* L5 Q$ U! k) y, s
2 C  E- ]: |! P. L7 U
1如果有齐全的质粒,自己做病毒肯定没问题。
9 o! {8 Y2 |7 U2 z2,质粒本身就可以用来转染,效率没有病毒高
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发表于 2011-11-17 10:38 |只看该作者
回复 momocy 的帖子/ q8 u5 N; B. |2 M: L
7 M0 F8 x7 C2 @5 D8 E& [$ W0 p& U
你好,谢谢你给我的回答。我这个逆转录病毒质粒不含荧光,那如何在荧光镜下计数来测病毒滴度呀?
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地板
发表于 2011-11-17 10:47 |只看该作者
回复 momocy 的帖子
* D3 q0 N1 ?& _% m7 F! C' S' R9 p
- C0 j3 S4 U8 R8 |1 u3 p5 q- b如果逆转录病毒质粒不含荧光,如何在荧光镜下计数来测病毒滴度?

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发表于 2011-11-17 21:42 |只看该作者
回复 zhangtang 的帖子7 O5 P2 a$ \; W

% n. z6 Y* {( ~/ e你增加一个GFP的对照,通过GFP的来估算其他质粒
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发表于 2011-11-17 21:47 |只看该作者
回复 momocy 的帖子
$ \  |$ K# t+ A% S: [3 t5 I/ v% \
你好,你说增加一个GFP对照的话,是不是空白质粒flag也要包装啊?还GFP组就可以作为空白质粒对照组?
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发表于 2011-11-18 09:11 |只看该作者
回复 zhangtang 的帖子
4 g: l# \4 Y9 Q" C2 q7 T1 G" B: @8 a
你转染的时候,多转染一个GFP,也就是GFP和质粒同时做,算出GFP的滴度,然后你质粒的病毒和GFP加的量一样多,这样不就行了么
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发表于 2011-12-13 08:47 |只看该作者
我的就是这个样子的,本身质粒没荧光,加一个GFP作对照!可是问题是我的包装细胞状态总是不好,包出来的病毒去感染293t荧光很不亮 而且很少 可以告诉我怎么个情况吗?谢谢啦!# Q  q8 h  @4 m7 Y
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