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质粒浓缩 自己的小尝试 [复制链接]

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优秀会员 金话筒

楼主
发表于 2011-11-18 16:29 |只看该作者 |倒序浏览 |打印
我想把提出的质粒,直接加上酒精,然后混匀,过柱,完了之后直接加水(一半体积的水),这样能使质粒浓缩么?  i1 p$ ^5 S( W% u

: [; D9 }1 ~; @. z' z补充内容 (2011-11-18 16:30):
  [5 p- r8 C- {9 {酒精体积为质粒体积的三倍
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沙发
发表于 2011-11-18 19:11 |只看该作者
+两倍体积无水乙醇,和1/10体积5M NaCl,离心即可沉淀  }  D  j! F3 n8 A$ d1 d; }  v
用水溶解就行
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藤椅
发表于 2011-11-18 19:37 |只看该作者
我这有一套浓缩的步骤,而且可以消除蛋白。
$ I! T" v6 l% c( X# m: b
3 Y: s, T  L/ o  z( T. I无菌处理(对DNA进行浓缩和无菌处理,可直接用于后期细胞的转染实验)  c6 t- J3 \3 Y8 e  _
通常最后溶解用500ul灭菌超纯水(不足时用水补足)1V,转移至EP管
' w& w: @" U" q; z3 Z
- `# {$ w& D" m. K加1/10V 3M NaAc(50ul)+2V无水乙醇(1ml), V2 V4 d. ]& k2 E+ n
7 I0 K: B- v4 a& P) X
-80℃,15~20min
* p8 B7 v/ E- d( i/ P* e
$ d% A. n1 \2 z# u≧13000rpm,15min- r+ R- g/ d1 W6 C7 s+ {" g; ~
8 T! o; R0 p# z- E
小心吸弃上清,加入 1 ml 70%乙醇洗涤沉淀及整个管子内壁(可以把沉淀弹起) ;然后13000×g 离心1min 收集质粒沉淀。吸弃上清,注意不要把沉淀吸走;
; v; `7 Y6 P- ^  g0 c- U. U7 l; F  j, M; O% A2 V- z
   (可重复洗涤一次) ' Y9 R0 Z) q3 C4 T

$ o- ?" s8 z* p: h把离心管置于离心机稍为甩一下(离心几秒) ,把管壁的残留乙醇离下,然后用小枪吸走管底的乙醇液体。
: t( W$ B' u5 J' ~8 p$ U
) [) ^7 @& ~, d% N- H$ E$ v# r开盖干燥,让其风干,直至看到一层薄膜状(透明) (10~15min); e% ?! u' p% n3 `6 f- p3 m

/ |! f* H6 u8 W1 l即可加入(40~60ul)超纯水溶解,由开始的沉淀团块大小决定。
, r# w8 G( m* X& }(取2ul至78ulddH2O测其浓度及OD)
$ a4 {% {7 I$ u& T
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板凳
发表于 2011-11-18 22:35 |只看该作者
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楼主有没有用过omiga大题的盒子,里面有浓缩的步骤啊!可以搜索一下,直接用酒精会不会损失太大啊,好像中间要用到NaHAc的!
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报纸
发表于 2011-11-19 11:30 |只看该作者
QIAGEN的说明书关于浓缩的步骤是这样的:(15mlQF洗脱后)1 z9 s) s0 w% N$ K' e; ?8 B
1,10.5ml异丙醇加入,4度离心15000g,30分钟,1 B8 ]* @! @9 t3 O( r& K* _# |& p
2,弃上清,加入5ml 70%乙醇重悬沉淀,离心15000g,10分钟( l- ~" }: Z4 ^6 ~
3,弃上清,风干
3 K) x: h& t9 e3 ~这时,你可以根据你想要的浓度,加入适量TE或纯水溶解沉淀。
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地板
发表于 2011-11-20 16:50 |只看该作者
用真空浓缩机也行的。
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发表于 2011-11-22 04:20 |只看该作者
这个要看你原来的质粒浓度多大了,如果是大提的,浓度很高,那么上面浓缩的方法都可以,如果你的质粒浓度很低,那么用上面的方法浓缩(除了用真空浓缩机),最后估计什么都没有了。因为任何一种浓缩方法都会出现损失,一般情况下起始浓度越大,损失率越低。
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发表于 2011-11-22 08:57 |只看该作者
回复 张也行 的帖子
5 y- S( x& l! N4 Q/ T8 |4 s$ u7 I9 L4 q, {0 U
大提浓度高?应该是不高吧?经验告诉我们,大提量比较大,但是一般浓度不高吧?起始浓度越大,损失率越低,这个是为什么呢?
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发表于 2011-11-23 02:28 |只看该作者
回复 huangcong1988 的帖子
) B* S! s, ]' u! A$ Q' {5 h  o! L9 Y$ K" I
你们实验室小提浓度比大提高?!估计和你们用的试剂盒有关吧,我们这边都是大提浓度高~/ t! D; u% {/ x

" t; f* s2 D% X7 _6 ?; q9 b至于起始浓度大,损失率低这个也是我的个人经验。你可以试试。
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发表于 2011-11-23 08:51 |只看该作者
回复 张也行 的帖子
5 G5 s& _* M- i; F7 E1 K
  {2 I( A+ K' V( W+ Z+ E恩,我们用omega的,一般情况下是小提质粒浓度比大提要高,但是小提的量是没法跟大提比的
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