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[请教] RNA探针合成问题咨询 [复制链接]

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楼主
发表于 2011-12-6 23:06 |显示全部帖子 |倒序浏览 |打印
现要合成RNA探针,用SP6转录。但是操作过几次效果都不好。2 v2 h1 O. X; ?. m
分析原因有:DNA模板不纯,后经过试剂盒纯化处理(两次)260/230能到1.8以上。感觉应该合格。- k* {' K) T+ u
但是我查到一些论坛,说用来做RNA探针的DNA模板最好也去除RNASE。
3 _5 k" P) t2 }但纯化试剂盒的elution buffer应该就是普通的超纯水吧,不是RNAse-free的水,如之奈何?用这种DNA模板做出来的RNA探针,电泳图有好多散带且主带不亮,不知道是降解的原因还是啥原因。
1 m" X7 J- U2 S请问怎么纯化DNA模板至RNASE-FREE又纯度很高?是不是在最后一步加DEPC处理的水就行了,感觉还是不合适,因为试剂盒本不是为RNA所作。(我是想知道有什么传统方法?), {7 V$ [% l& p' l* w; c' u
还有,需不需要再纯化RNA探针之后才能用来做杂交呢?
: |( {3 k4 B2 Y8 r, W3 f谢谢!
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