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[讨论] David芯片分析软件 [复制链接]

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金话筒 优秀会员

楼主
发表于 2012-4-1 00:39 |只看该作者 |倒序浏览 |打印
芯片数据的生物学分析是大家都感到头疼的问题,对着大量差异表达的基因无从下手,不知这些基因的功能,不知参与了哪些pathway,DAVID可在这些方面可以提供许多有价值的信息。我现在在学习生物学软件David,想利用它来对miRNA预测到的多个靶基因进行一个功能分类,为下一步实验做准备。但是一个人孤军奋战,实在是收效甚微,现在发个帖子,寻战友一起学习。5 P0 D/ k! {8 C3 x
主页:http://david.abcc.ncifcrf.gov/home.jsp
# M  G4 @4 w0 I& p; e8 D" ^不知道哪位对于这个熟悉那?
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优秀版主 优秀会员 金话筒

沙发
发表于 2012-4-1 15:35 |只看该作者
以前利用David做过表达谱的分析,但只是简单的分析,包括差异基因的GO和KEGG分析,然后就是ID convert。具体还有什么其他的功能没有学会啊。
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金话筒 优秀会员

藤椅
发表于 2012-4-3 11:08 |只看该作者
标记一下、、

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金话筒 优秀会员

板凳
发表于 2012-4-3 13:13 |只看该作者
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挺好的web tool 但是现在似乎不能出漂亮的图了尤其GO BPchart。。。
! \; Y: _/ `- P0 _2 @
7 I' ?& Q1 Z2 k- F8 H/ z参考:http://www.dxy.cn/bbs/thread/1479787#22645096
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报纸
发表于 2012-4-4 05:35 |只看该作者
dengji

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金话筒 优秀会员 帅哥研究员

地板
发表于 2013-7-11 10:39 |只看该作者
用过DAVID 但我聚类出来的不是特集中 不知道是样本有问题还是怎么样* j. v2 L$ A' X3 c% j: \% `. y
桑不起啊 很少的基因在一条通路上
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