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楼主
发表于 2012-9-12 14:34 |显示全部帖子
首先,你这个primer设计也太简单了吧,现在市面上不是有很多引物合成软件吗?比如那个vector,primier,oligo等等。而且对于你设计出来的引物有很多要求,比如其GC含量以40-60%为宜,引物对应模版序列的Tm为72最好,选择引物二聚体及发夹结构能值最低的。引物3’端一定要与模版完全配对,不能出现3个连续碱基,末端避免使用A。" u+ L+ E' l7 r+ e5 i  r
还有,我不知道你的目的区域有多大,当你的目的区域小于200bp时扩序要加大,引物尽量向两边移,要挑两边特异性最好,Tm最适合的。
5 v# J+ d* A- \8 n4 A最后,一般PCR时在条带最下面可能会有两条杂带,一个是引物二聚体,还有就是dNTP。如果你还有其它杂带,那只能说明你的引物特异性差,p出其它部位的片段。
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沙发
发表于 2012-9-13 09:06 |显示全部帖子
回复 caifranklin 的帖子# n. f& e  L6 n
" d4 B! {: A% H: n1 c: y1 |
你可以试试两步法PCR,不用设退火温度。其它都一样。
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