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请教关于Oct4-GFP MEFs问题 [复制链接]

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楼主
发表于 2013-4-2 14:07 |只看该作者 |倒序浏览 |打印
想知道Oct4-GFP MEFs 背景.有人说是Oct4 启动子和GFP基因融合在一起,可是我在网上看到的是GFP基因在Ot4第5个外显子的下游.请教它的遗传背景. 还有,GFP是如何被调控表达的. 是内源的Oct4 调控还是外源的Oct4调控的?
0 `: U$ |& Q% X  _Yamanaka四因子(OKSM)都参与细胞重编程的过程,为什么用Oct4 的表达就能代表着重编程细胞集落的形成,其他的三个因子不能代表吗?' B: t& V8 {5 d" C' v
最后一个让我很纠结的问题:在重编程的过程中,到底是外源的四因子起作用还是内源的四因子?在iPSC形成过程中,外源的四因子和内源的到底什么关系?
& r. p9 D; C0 q/ f谢谢专家的指教。
1 _' D3 W) {) K) M2 G4 ^
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沙发
发表于 2013-4-2 22:38 |只看该作者
照你说的,好像是Jax的Oct4-GFP小鼠。这种小鼠的Oct4基因终止密码子之后敲入了IRES-GFP的编码序列。IRES序列的作用是形成多顺反子,即一条mRNA编码多个蛋白,上游的蛋白翻译完成之后,IRES序列可以使它下游的编码基因继续被翻译出来。这样一来,当细胞内Oct4表达时,就会有GFP跟着表达,visualize了Oct4的表达,起到iPS细胞产生的reporter作用。对于你的问题,可以这样讲,Yamanaka四因子(OKSM)导入细胞,可以启动细胞内的多潜能基因调控网络,其中Oct4也是多潜能基因的重要一员,内源性Oct4的表达标志着细胞向iPS状态的转变。外源因子完成使命后就应该“沉默”,否则影响iPS的稳定。
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藤椅
发表于 2013-4-2 23:28 |只看该作者
按理来说应该是OCT4 promoter drive的,knockin的位点在染色体上,所以和外源性没什么关系吧。至于它的准确位置信息,去查一下老鼠的出处,或者做个PCR southern来证明吧。重编程过程中,首先起作用的当然是外源性的基因,转进去的基因通过一系列复杂的过程,改变细胞的表观遗传方式,从而使细胞获得多能性,标志性的就是内源性的OCT4开始表达。楼主不妨想一下,要是GFP是外源性OCT驱动的,那转了之后数个小时就会表达了,重编程的过程何需那么久?关于从外源性的表达到内源性的启动,正是重编程的机制,已经有很多文章报道这一过程并给出自己的模型,楼主可以找找
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板凳
发表于 2013-4-3 03:18 |只看该作者
干细胞之家微信公众号
回复 damaoshu 的帖子8 G) V8 b8 A& I* j3 b/ U: {
9 |$ }% S, m% r6 o
谢谢你的回答.3 p, \* J7 H- c) E3 w8 \
OSKM四因子今人体细胞(MEF)后,启动多潜能基因网络,改变染色体结构,使基因处于开放状态,这样这些重编程因子就可以就可以和基因调控元件结合,促使多潜能基因的表达。外源因子完成使命后是如何沉默的?
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报纸
发表于 2013-4-3 03:30 |只看该作者
回复 w343989328 的帖子
0 @  Y0 R. y+ N1 U+ [
3 K/ C3 ?* [1 l谢谢你的回答。+ m! t. g) b$ _$ b2 z
既然是内源Oct4驱动GFP的表达,那么它是如何驱动的呢?8 f) J# a8 \! Q3 ]* `" J+ N
Oct4是自己可以驱动自己的表达也可以驱动其他的三个因子的表达的。; @0 W6 }* t. T
如果外援不能直接驱动内援的表达,那么外援就是驱动别的转录因子表达或者改变Oct4基因所在染色体结构然后促使Oct转录的因子结合在它的启动子上,内援的Oct连同GFP报告基因表达了。这种状态也是iPSC成熟的状态了.是这种可能吗?
; f: H/ k3 R  A关于重编程机制我没有看到一个明确的说到外援和内援关系的。
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地板
发表于 2013-4-3 03:31 |只看该作者
回复 chutu 的帖子
: K6 X. V) ~1 r; Y
2 Y: K$ r. V& P6 D; d. q2 V: d- f0 S谢谢你的回答.4 q7 J* L% S$ \" \
OSKM四因子今人体细胞(MEF)后,启动多潜能基因网络,改变染色体结构,使基因处于开放状态,这样这些重编程因子就可以就可以和基因调控元件结合,促使多潜能基因的表达。外源因子完成使命后是如何沉默的?
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发表于 2013-4-3 14:25 |只看该作者
早期做iPS用的是逆转录病毒载体将OSKM导入细胞,其启动子容易自发沉默,可能是被甲基化修饰的结果。
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发表于 2013-4-3 15:05 |只看该作者
回复 damaoshu 的帖子
  I- V- J, V1 e. Y! s, B3 W* _5 r8 [8 i
因为GFP是连在内源OCT4启动子下游嘛~那内源性OCT4表达的同时GFP也就表达了。至于这里的内源性和外源性OCT4,并不是简单的一对一的关系,内源性OCT4的表达是几个因子共同的结果,中间涉及的过程叫重编程。这一过程持续好多天,其终点是细胞获得多能性,这一多能性的标志就是内源性OCT4的表达,如果是OCT4-GFP的话,就直观体现在GFP表达。
9 }- J' e6 L7 y2 H1 r你如果要探讨从外源到内源的过程,可以找一下一些文章。
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