请教质谱图片的解析

懵懂干细胞

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2013-6-3 09:00 上传

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0 z0 I* m4 v+ i7 b1 |* T4G10是检测酪氨酸磷酸化的的抗体。
7 M. `9 H# D, R8 @. i* q7 P+ G+ b图片下方文字从分析出来的结果说ago2  tyr393就是唯一的磷酸化位点，m/z值在600多的地方有个峰值很高的现象，是看这个吗？
% ~4 ?' P" V3 e( z) q$ i能发麻解释一下图片中的m/z是什么吗？ 图片中质谱的原理是什么？ 峰值的意义是什么？" Q2 V/ |2 U! @, T% `! B! |' M1 z5 t
谢谢了

DNAngle_RNA

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9 n8 d2 R7 q" J& b0 o% v  q8 u1 t/ s- h9 k; `8 H- f; S
横坐标m/z是质子电荷比，代表基团，纵坐标是相对丰度，峰值越高代表离子流强度越大（这还是当年考有机化学时看过的，只能帮你到这了）

懵懂干细胞

回复 DNAngle_RNA 的帖子5 X/ t8 ]: T) U8 }* V0 c
. I5 n+ w0 p8 A5 o* O

cyberpig

應該是裂解的過程中其中兩個對應tyrosine residue峰的 m/z相差為一個phosphate group

懵懂干细胞

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& }/ \5 P! Y4 V! [2 y. s1 B3 ~% Z+ K6 Q% ^+ E; X" \/ s
哪怎么看出来峰值最高的磷酸基团就是try 393呢

eley

打二级质谱的话，如果这个氨基酸上面有磷酸化修饰，那么这个氨基酸对应的峰值就会多出90左右（具体我忘了，可能是92KDa），这样你就会知道这个氨基酸是发生了磷酸化的修饰，其他的修饰也是同样的道理，只要和没有修饰的峰值进行比较，就可以知道发生了什么修饰。

cyberpig

懵懂干细胞 发表于 2013-6-3 11:37 % n; P/ C/ ^# N( x+ W. S, F
回复 cyberpig 的帖子6 f) y2 b: ~/ f' u4 V, ?0 b5 W

3 O3 M8 Y: A! I. v" ?哪怎么看出来峰值最高的磷酸基团就是try 393呢

4 U, ?8 A5 X) P6 b
峰值最高只是代表abundance大而已，不代表是磷酸基团....
, f. F. F$ e2 e樓主請看y5和y4的peak. y5的m/z是729, y4的m/z是634。它們m/z的相差是95,也就是磷酸基团的大小（31+16x4=95)。

懵懂干细胞

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0 s: L% }. X5 k. a/ ]& O% X5 c
0 V4 b) ~% Z" B! p' c多谢解答！ 谢谢

懵懂干细胞

回复 eley 的帖子( i9 o; ~$ o7 Y' Q5 y
$ J$ l6 o" ]  H7 s4 U
感谢解答！ 谢谢

懵懂干细胞

回复 cyberpig 的帖子' k6 [1 i" {  s9 K. o

0 R. F6 o! m* F8 {. q- V- S能帮我详细的解说一下上面的图吗