请教质谱图片的解析

懵懂干细胞

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2013-6-3 09:00 上传

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% s% O( s& g, f, z4 V4G10是检测酪氨酸磷酸化的的抗体。
1 G' U' g& E/ `6 s2 q* I0 r- [图片下方文字从分析出来的结果说ago2  tyr393就是唯一的磷酸化位点，m/z值在600多的地方有个峰值很高的现象，是看这个吗？
' f4 C% b& s+ Q8 \) x8 U$ w能发麻解释一下图片中的m/z是什么吗？ 图片中质谱的原理是什么？ 峰值的意义是什么？
; h) E1 o' q2 S; K( Q( ~谢谢了

DNAngle_RNA

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% d; B( X8 a& |3 B2 j8 |
2 A6 p" t" b7 _横坐标m/z是质子电荷比，代表基团，纵坐标是相对丰度，峰值越高代表离子流强度越大（这还是当年考有机化学时看过的，只能帮你到这了）

懵懂干细胞

回复 DNAngle_RNA 的帖子5 B3 o+ g$ T; y# c: e6 d
6 {5 _9 e+ \3 b  C6 P( ^' H0 a

cyberpig

應該是裂解的過程中其中兩個對應tyrosine residue峰的 m/z相差為一個phosphate group

懵懂干细胞

回复 cyberpig 的帖子4 o. w5 V9 P& L9 A
, g' Q' x3 w( U! W& Y# Y/ C1 `
哪怎么看出来峰值最高的磷酸基团就是try 393呢

eley

打二级质谱的话，如果这个氨基酸上面有磷酸化修饰，那么这个氨基酸对应的峰值就会多出90左右（具体我忘了，可能是92KDa），这样你就会知道这个氨基酸是发生了磷酸化的修饰，其他的修饰也是同样的道理，只要和没有修饰的峰值进行比较，就可以知道发生了什么修饰。

cyberpig

懵懂干细胞 发表于 2013-6-3 11:37
/ O$ r4 e  ^! Y  m$ i1 g9 W, D回复 cyberpig 的帖子
$ m7 c  B& R' y$ A) q1 k4 r- b( j9 W
哪怎么看出来峰值最高的磷酸基团就是try 393呢

" w9 q9 h& H4 q* V& ?- h9 C
峰值最高只是代表abundance大而已，不代表是磷酸基团....% J3 l6 w8 K* l" @  i
樓主請看y5和y4的peak. y5的m/z是729, y4的m/z是634。它們m/z的相差是95,也就是磷酸基团的大小（31+16x4=95)。

懵懂干细胞

回复 cyberpig 的帖子1 Q) {- ~. ?$ c$ M- P

, {( \8 b9 T# m# [1 g4 U7 N多谢解答！ 谢谢

懵懂干细胞

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" n, ?* i, K! G/ l/ l
2 K/ U/ J- S& {感谢解答！ 谢谢

懵懂干细胞

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4 K* z1 g. L4 M* n+ W. _
% h* w4 a1 M: s+ b& t2 e能帮我详细的解说一下上面的图吗