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楼主: Andyhigh
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[请教] 如何验证蛋白是否进入细胞核,用immunocytochemistry,DAPI,ISH???   [复制链接]

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楼主
发表于 2013-7-30 20:12 |显示全部帖子
1、虽然没有做过这方面的工作,但是一般要进入细胞核的蛋白质都是具有NLS序列的,你可以看下自己的蛋白质是否存在这段序列;1 J, Z' v( p3 e% z% {- z
2、免疫荧光一般是不会用于蛋白质在细胞中的定位,而他们提到的 in situ hybridization主要是用于细胞内特异的DNA或者RNA的定性;
% ~- @0 C7 w6 ~2 W3、如果知道与其相互作用的细胞核内的可做内参的蛋白的话,FRET是一种很靠谱的方法,他可以避免关于切片引起的空间问题;
9 a% H1 Q5 k: I4、如果实验室有条件的话,我觉得放射自显影可以尝试一下,毕竟电镜的放射自显影效果还是很好的;
3 S4 O6 E$ x% R1 N% Z* O' @5、如果继续尝试你们的思路的话,我觉得分别对细胞骨架蛋白染色的效果更明显一些,可以把中间丝染色,然后可以看到很明显的核纤层,这是能够看到的比较清晰的细胞核的轮廓,这样是要比DAPI效果好点的,当然这时候是要用confocal的。
1 y& x3 A0 U# u9 l6、把你们构建的蛋白构建成GFP融合蛋白,微管和原纤维状蛋白用其他可分别的非绿色染料标记(如罗丹明B等),细胞进行有丝分裂时候,你会看到一个很明显也很漂亮的图。
' W4 m( z% r! \8 z# K2 X7 z7、除了这些定位外,还需要很多与蛋白质本身性质及生理相关的实验来进行证明的,所以你的问题是不存在的,不可能通过这一个步骤就证明你的蛋白在核中定位的,这是做实验的常识,一个生物学问题需要很多直接的和间接的证据来证明的。5 n& y0 I1 v! E; I& C  U, c( ]
8 t7 A$ y4 |" P* {. v1 e  G
(PS:个人觉得,你还是搞清楚你构建蛋白的性质对于这个问题的解决才是最关键的,蛋白质通过核孔复合物进入细胞核内是一个很复杂的过程,大致上可以分为被动扩散和主动运输两大类,由于核孔复合体是一个亲水通道,有效直径是9~10nm,对于球形蛋白而言,基本上分子量在40000~60000的蛋白质都能自由通过;主动运输需要信号识别与载体的介导,还是一个需要ATP的过程,如果你的蛋白质可能是主动运输的话,根据主动运输的机制就可以设计其他的动态鉴定方法了。)
: c6 }7 ~" Z8 e* p) {5 ]* L  t9 C! [. Q
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沙发
发表于 2013-8-1 05:13 |显示全部帖子
回复 Andyhigh 的帖子4 ~, h  h: h+ I, T3 a- v) q, ]$ p3 H
  q1 D4 t6 V7 {% y8 c. q% K/ Z
那个就是我说的FRET方法,方法很成熟,你可以到springer找下它的protocol。
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藤椅
发表于 2013-8-1 18:42 |显示全部帖子
回复 Andyhigh 的帖子
7 R3 f+ j* U5 q6 Q8 V# e
: N! w) b' k/ ]  n( w5 V$ B: D! k1 `这个我也不是很清楚的,都是实验室的技术员在做这些东西,我们只看最后的结果,自己的最后观察时用的是430nm激光激发GFP,受体的YFP接受CFP激发转移的能量,能看到530nm的荧光。
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