近乎百分百重编程的牛文章

fgh1124

最新Nature online文章"Deterministic direct reprogramming of somatic cells to pluripotency" 通过knock out Mbd3 实现了近乎百分百的重编程效率，我和我的小伙伴都震惊了！  v; a2 T7 L& j; o/ N2 K

, j: \. Y7 U. ]& ^文章作者发现，将nucleosome remodelling complex 中的一个重要成员Mbd3 给knock out 以后可以极大提高重编程效率，机理是Mbd3 可以与OKSM 四因子结合，阻碍了某些基因的激活，过程类似于汽车的刹车装置，将这个刹车装置去除就可以实现细胞的高效重编程。
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文章发布以后，The scientist 还有专门的讨论文章"Inducing Pluripotency Every Time"，干细胞大牛“George Daley”之前也做了该gene 的knock out, 他们发现对重编程效率没有提高，所以对这篇文章的结果持保留意见。链接：http://www.the-scientist.com/?articles.view/articleNo/37492/title/Inducing-Pluripotency-Every-Time/7 C; L/ j. E8 F* N" l- m
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比较有意思的是这篇文章的通讯作者是Jacob H. Hanna, 他是以色列的一个年轻科学家，之前是Rudolf Jaenisch 的postdoc。
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markllq

( }/ T$ N) D' q7 U1 }. P' H  R

; F+ t" d  k  I6 q我认为这纯粹是炒作。大家可以仔细看原文，control（Mbd3+/+）的诱导效率都能达到20%以上，mbd3-/-只是将重编程效率提高了4-5倍，做iPS的人都知道传统的培养基做出来的iPS效率不到1%，因此100%的效率主要靠的是他们用了高效培养基。看图就知道了，不得不说Hanna真是聪明，玩概念很厉害。
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- N5 T! u& j" k, D: H3 ?

& [7 _$ e0 Z3 {, c. O# S$ j另外mbd3抑制重编程的文章在今年年初就发了，而且比Hanna这篇文章投稿日期还早几个月，见附件。

Yedan

这文章算reprogramming efficiency的方法就已经很trick了（Oct4 GFP positve cells/mCherry positive cells），凡是做iPS的人用流式统计GFP positive数的都知道，即使是OSKM已经很高了（我们实验室自己做是40%），他这个接近100%，撑死了就3倍，但是聪明就聪明在把概念说得很诱人，因为Nature发的就是这类文章，如果他投Cell 八成被editor就毙了

yaolinzhang

回复 markllq 的帖子* b; ^' B% B5 c
2 X# |7 c; ]6 W# O8 m( P" {) e  d
求Deterministic direct reprogramming of somatic cells to pluripotency全文

fgh1124

回复 yaolinzhang 的帖子  r" A- P0 j% N& U( f
. {& {) j" k3 J; z% f% T5 W
文章！！！！！

yaolinzhang

回复 fgh1124 的帖子8 V- }: h0 f9 V/ [% M

* \/ d' p* b+ L/ R4 Q4 T5 H非常感谢！

细胞海洋

Nature：诺奖之后，细胞重编程技术新突破
3 [# g. w5 o% R7 S, i) G  K. jhttp://www.stemcell8.cn/thread-72325-1-1.html
# s; g  Z: {* N" M/ |

murong

学习学习，多谢楼主。

bioon

Cell：剔除Jmjd3基因或可将成熟体细胞高效编程为干细胞
9 W5 F7 M9 |$ g4 P; V2013-3-4 0:18:13" |. B  ]! Y8 [
2013年3月4日 讯 /生物谷BIOON/ --近日，刊登在国际杂志Cell上的一篇研究报告中，来自卫理公会医学研究院的研究者通过研究揭示了，遗传障碍的去除可以将成熟体细胞转化为干细胞效率提高10倍至30倍。研究者Rongfu Wang表示，6年前研究者发现可以将成熟体细胞转化为诱导多能干细胞，即iPSCs，这样一来病人就可以使用自身的细胞...
: h3 _9 l3 E+ [! o$ h" E- r" A2013年3月发表的论文也有关于iPSCs提高效率的

bioon

doi:10.1016/j.cell.2013.02.006PMC:PMID:
9 l1 Y+ K  Y; k1 G; [( dJmjd3 Inhibits Reprogramming by Upregulating Expression of INK4a/Arf and Targeting PHF20 for Ubiquitination* p4 [  p. g- @& r# C$ f( `8 ]1 G
Wei Zhao, Qingtian Li, Stephen Ayers, Yifeng Gu, Zhong Shi, Qingyuan Zhu, Yidong Chen, Helen Y. Wang, Rong-Fu Wang
: w" f8 [9 _5 ]' F  G0 f. z; XAlthough somatic cell reprogramming to generate inducible pluripotent stem cells (iPSCs) is associated with profound epigenetic changes, the roles and mechanisms of epigenetic factors in this process remain poorly understood. Here, we identify Jmjd3 as a potent negative regulator of reprogramming. Jmjd3-deficient MEFs produced significantly more iPSC colonies than did wild-type cells, whereas ectopic expression of Jmjd3 markedly inhibited reprogramming. We show that the inhibitory effects of Jmjd3 are produced through both histone demethylase-dependent and -independent pathways. The latter pathway involves Jmjd3 targeting of PHF20 for ubiquitination and degradation via recruitment of an E3 ligase, Trim26. Importantly, PHF20-deficient MEFs could not be converted to fully reprogrammed iPSCs, even with knockdown of Jmjd3, Ink4a, or p21, indicating that PHF20 is required for reprogramming. Our findings demonstrate, to the best of our knowledge, a previously unrecognized role of Jmjd3 in cellular reprogramming and provide molecular insight into the mechanisms by which the Jmjd3-PHF20 axis controls this process.