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[原创] 如何降低内毒素 [复制链接]

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楼主
发表于 2014-4-2 10:45 |只看该作者 |倒序浏览 |打印
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本帖最后由 石山巨石 于 2014-4-2 10:55 编辑
: J# ]) J8 c; n1 g
8 r! M/ }+ k7 V. e4 M细菌内毒素一般会污染 细菌做载体的质粒DNA扩增产物 或者工业级别生产的蛋白质 (根据下游做什么 以下几点可省略 如果下游非常敏感 就稍微多注意一下)
$ x, Q7 ~2 N% H0 m; y6 R我们公司有配方去除内毒素 但是不是很方便
  `- B2 y) o- \8 ~不过 我可以提供一些思路 供大家参考 以及一些降低内毒素污染的操作细节1 |+ R, t3 o; G5 @
1, 内毒素为细胞壁内脂多糖 在细菌裂解后大量释放于环境中 因此 细菌培养(伴随细菌死亡) 细菌离心(有条件 除内毒后的步骤换离心机 没有就用HCLO 酒精擦擦) 以及“细胞裂解”过程的房间 最好能和过柱子的房间分开
$ C7 w3 X. }8 v) g3 Y- F0 T$ [2, 细菌裂解液的容器 和后续的一定不能混 一定要换新的
0 V7 H) J8 F# f" C8 _' n3, 即使如此 空气中还是大量存在内毒素的(可以 做对照试验elisa测,一个水有盖,一个无盖,过夜,elisa)过柱子的时候如果有条件在超净工作台(后续步骤 需要另外换一个超净台) 或者无菌室做就在无菌室做  没有条件 应该尽量避免空气流动 (比如这个时候 扫地 吸尘器 开空调) 虽然不开空调会很热- W: A' v& S2 g- K. X
4, 过柱子之后洗涤过程 以及所有后续步骤的tips 容器 一定要事先elisa 测量 并且在超净台内进行  即使同一个厂家生产的东西 由于batch不一样 质量差异也会很大(我们公司被坑过几次,不过也看情况 有的可以接受 有的不行)) g& p5 _- j& ^9 F9 `9 a+ m
5,使用的时候也要注意保持tips 离心管等洁净(事实上 保持器材洁净要比防止试验污染还要重要 器材脏了毁一堆试验  所以 我的东西是不能让别人用的 别人用了 我不放心 就会换新的) 保持洁净 不是去擦拭 而是防止被污染 (擦拭 有时候会更脏)! @: c3 j2 a% e* H7 p9 ?3 h
6, 关于内毒素的去除, 脂多糖为疏水性分子 质粒DNA带负电 所以在污染/产率要求不高的时候 可以多用酒精洗
3 i! q3 [+ f( {6 m8 v  o  H                                                                  如果样品少或者要求特别干净  用类似于肥皂的detergent (不是真的肥皂)不过要注意过柱子之后的酒精洗涤 浓度不能太高(容易污染) 也不能太低(去不干净) 避免污染样品
( w8 ~, x1 E9 ^7, 如果要用自己配的BUFFER, 一定要事先测量内毒含量,如果存放时间久,要定期测量,注意密封# H9 Z) `! y! X% Y. T: m8 y. ^
8, 水。 水是最容易脏的,买来的机器净化 也不能完全相信,一定要定期检测,更换指定部件。买来的净化水也是需要测量的。 (除非你买医用蒸馏水,不过我们公司在转存医用蒸馏水之后 还是会测一下的)" E' J7 E& Z; P1 D" A) q: Z
9, 祝大家实验顺利 早日毕业。
6 T, q- G' P+ u; x! ^* |
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沙发
发表于 2014-4-2 11:21 |只看该作者
Hint: & a( D$ P$ b5 L% O# }. f
大部分endotoxin removal 都要求incubate on ice 这个过程 事实上是增加detergent在水里的溶解度 低温增加溶解度的detergent  

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藤椅
发表于 2014-4-2 14:20 |只看该作者
感谢!
: w% y  z/ c1 y; S/ r看来我们买了无内毒素的质粒大提试剂盒,还是等于在走廊里做单细胞qPCR
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板凳
发表于 2014-4-3 10:34 |只看该作者
回复 Tivah 的帖子! E/ y' V) P  A' S- g
, N; [" G% W; L3 Q: A5 i; P' D
其实 大于0.1mg DNA 扩增的的时候 PCR效率就太低了 细菌的来的快 但是带内毒素
& `% p* i! z" A) v
: _3 L) e4 t* b6 `& k1 d试剂盒一般都有endotoxin removal 如过没有 完全可以买beads 自己做 或者用笨(毒死人不偿命). N# \- P: @/ M8 ?

5 K3 P) v! q6 s
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报纸
发表于 2014-4-16 11:18 |只看该作者
写得较为全面,很受用呀,一般我们都是摇菌间和抽提间分开,然后后续的一些步骤都在超净台(预照三十分钟)中进行,拿出来离心时要注意封口就好了。因为前面许多步都有无水乙醇,所以前面的步骤不用太过担心。最后加的水一定要是事先分装好的高压消毒的无菌水,只要够细心一般都不会有问题的。毕竟是从细菌中抽提,还是要注意摇菌的质量,别有杂菌就好。
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地板
发表于 2014-4-28 15:20 |只看该作者
学习了,很好
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