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[原创] 如何降低内毒素 [复制链接]

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楼主
发表于 2014-4-2 10:45 |只看该作者 |倒序浏览 |打印
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本帖最后由 石山巨石 于 2014-4-2 10:55 编辑 . Y! a, v+ q# n. l" J
1 r# A- I* x. B& h% K1 D
细菌内毒素一般会污染 细菌做载体的质粒DNA扩增产物 或者工业级别生产的蛋白质 (根据下游做什么 以下几点可省略 如果下游非常敏感 就稍微多注意一下)0 O: s) p" W1 f3 I* Z) u1 R# W
我们公司有配方去除内毒素 但是不是很方便
5 f1 O) b0 i8 h# f' Y7 z不过 我可以提供一些思路 供大家参考 以及一些降低内毒素污染的操作细节* c1 j3 r6 N; h! Y+ u2 H
1, 内毒素为细胞壁内脂多糖 在细菌裂解后大量释放于环境中 因此 细菌培养(伴随细菌死亡) 细菌离心(有条件 除内毒后的步骤换离心机 没有就用HCLO 酒精擦擦) 以及“细胞裂解”过程的房间 最好能和过柱子的房间分开, F% A7 ]" p8 A
2, 细菌裂解液的容器 和后续的一定不能混 一定要换新的
0 e* Y9 P0 i: W0 a7 _3, 即使如此 空气中还是大量存在内毒素的(可以 做对照试验elisa测,一个水有盖,一个无盖,过夜,elisa)过柱子的时候如果有条件在超净工作台(后续步骤 需要另外换一个超净台) 或者无菌室做就在无菌室做  没有条件 应该尽量避免空气流动 (比如这个时候 扫地 吸尘器 开空调) 虽然不开空调会很热  Y( {5 [2 l  L3 R7 {* ?& s/ v5 m
4, 过柱子之后洗涤过程 以及所有后续步骤的tips 容器 一定要事先elisa 测量 并且在超净台内进行  即使同一个厂家生产的东西 由于batch不一样 质量差异也会很大(我们公司被坑过几次,不过也看情况 有的可以接受 有的不行)4 A) {* p, c0 k! A. i- P
5,使用的时候也要注意保持tips 离心管等洁净(事实上 保持器材洁净要比防止试验污染还要重要 器材脏了毁一堆试验  所以 我的东西是不能让别人用的 别人用了 我不放心 就会换新的) 保持洁净 不是去擦拭 而是防止被污染 (擦拭 有时候会更脏)8 w3 f3 p5 H$ M, g: E% i) r" s% p
6, 关于内毒素的去除, 脂多糖为疏水性分子 质粒DNA带负电 所以在污染/产率要求不高的时候 可以多用酒精洗
. R1 |. M: W* o& L+ X                                                                  如果样品少或者要求特别干净  用类似于肥皂的detergent (不是真的肥皂)不过要注意过柱子之后的酒精洗涤 浓度不能太高(容易污染) 也不能太低(去不干净) 避免污染样品
6 t# |: L  U! t. X0 z7, 如果要用自己配的BUFFER, 一定要事先测量内毒含量,如果存放时间久,要定期测量,注意密封
, H5 L9 d! ?2 |1 u8, 水。 水是最容易脏的,买来的机器净化 也不能完全相信,一定要定期检测,更换指定部件。买来的净化水也是需要测量的。 (除非你买医用蒸馏水,不过我们公司在转存医用蒸馏水之后 还是会测一下的)
! l; G( o9 v, r' S" ]2 B, d/ S9, 祝大家实验顺利 早日毕业。& d, H( A$ l6 u$ }5 j3 N# P
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沙发
发表于 2014-4-2 11:21 |只看该作者
Hint: , W1 F8 i) i' `4 d& ]
大部分endotoxin removal 都要求incubate on ice 这个过程 事实上是增加detergent在水里的溶解度 低温增加溶解度的detergent  

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藤椅
发表于 2014-4-2 14:20 |只看该作者
感谢!4 W8 g. U* x* u0 U0 q- t, u! h
看来我们买了无内毒素的质粒大提试剂盒,还是等于在走廊里做单细胞qPCR
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板凳
发表于 2014-4-3 10:34 |只看该作者
回复 Tivah 的帖子1 x0 s+ h3 i5 E. _( L7 j

, T% _4 T) [4 }$ s* h  z其实 大于0.1mg DNA 扩增的的时候 PCR效率就太低了 细菌的来的快 但是带内毒素 6 `& b! p! r* [" [& |# I

1 N; N% @' K  V( G9 _  W试剂盒一般都有endotoxin removal 如过没有 完全可以买beads 自己做 或者用笨(毒死人不偿命)0 N: V+ |. j) S& t5 P' u
: t5 Z( p7 d$ j/ }4 b7 T
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报纸
发表于 2014-4-16 11:18 |只看该作者
写得较为全面,很受用呀,一般我们都是摇菌间和抽提间分开,然后后续的一些步骤都在超净台(预照三十分钟)中进行,拿出来离心时要注意封口就好了。因为前面许多步都有无水乙醇,所以前面的步骤不用太过担心。最后加的水一定要是事先分装好的高压消毒的无菌水,只要够细心一般都不会有问题的。毕竟是从细菌中抽提,还是要注意摇菌的质量,别有杂菌就好。
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地板
发表于 2014-4-28 15:20 |只看该作者
学习了,很好
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