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[原创] 如何降低内毒素 [复制链接]

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楼主
发表于 2014-4-2 10:45 |只看该作者 |倒序浏览 |打印
本帖最后由 石山巨石 于 2014-4-2 10:55 编辑
1 ~+ j0 @) O  L/ W
  U1 s& \8 p3 n8 Q" P4 |8 Q细菌内毒素一般会污染 细菌做载体的质粒DNA扩增产物 或者工业级别生产的蛋白质 (根据下游做什么 以下几点可省略 如果下游非常敏感 就稍微多注意一下)
/ F# ]9 C5 B# O5 M; h我们公司有配方去除内毒素 但是不是很方便2 W* U6 o, D6 v, W. W# v: L  p" S
不过 我可以提供一些思路 供大家参考 以及一些降低内毒素污染的操作细节( [' j2 ~8 t8 S& B; F# N/ w- }
1, 内毒素为细胞壁内脂多糖 在细菌裂解后大量释放于环境中 因此 细菌培养(伴随细菌死亡) 细菌离心(有条件 除内毒后的步骤换离心机 没有就用HCLO 酒精擦擦) 以及“细胞裂解”过程的房间 最好能和过柱子的房间分开/ X5 A. ]( f6 E$ \& s
2, 细菌裂解液的容器 和后续的一定不能混 一定要换新的1 J3 R$ |+ o, U
3, 即使如此 空气中还是大量存在内毒素的(可以 做对照试验elisa测,一个水有盖,一个无盖,过夜,elisa)过柱子的时候如果有条件在超净工作台(后续步骤 需要另外换一个超净台) 或者无菌室做就在无菌室做  没有条件 应该尽量避免空气流动 (比如这个时候 扫地 吸尘器 开空调) 虽然不开空调会很热
, W5 g" y0 E0 R5 z4 ?% Q  Y4, 过柱子之后洗涤过程 以及所有后续步骤的tips 容器 一定要事先elisa 测量 并且在超净台内进行  即使同一个厂家生产的东西 由于batch不一样 质量差异也会很大(我们公司被坑过几次,不过也看情况 有的可以接受 有的不行). ~. d! N" G4 Q% T
5,使用的时候也要注意保持tips 离心管等洁净(事实上 保持器材洁净要比防止试验污染还要重要 器材脏了毁一堆试验  所以 我的东西是不能让别人用的 别人用了 我不放心 就会换新的) 保持洁净 不是去擦拭 而是防止被污染 (擦拭 有时候会更脏)+ |, Y) B: |" L1 D3 n
6, 关于内毒素的去除, 脂多糖为疏水性分子 质粒DNA带负电 所以在污染/产率要求不高的时候 可以多用酒精洗$ f3 z1 t8 o5 u, K
                                                                  如果样品少或者要求特别干净  用类似于肥皂的detergent (不是真的肥皂)不过要注意过柱子之后的酒精洗涤 浓度不能太高(容易污染) 也不能太低(去不干净) 避免污染样品3 B0 ?# @" ], R( ~
7, 如果要用自己配的BUFFER, 一定要事先测量内毒含量,如果存放时间久,要定期测量,注意密封' @# [9 }0 ]( Y  f4 o1 K! z# G7 `) O
8, 水。 水是最容易脏的,买来的机器净化 也不能完全相信,一定要定期检测,更换指定部件。买来的净化水也是需要测量的。 (除非你买医用蒸馏水,不过我们公司在转存医用蒸馏水之后 还是会测一下的)" z3 @/ I8 V5 {: U% I
9, 祝大家实验顺利 早日毕业。; h1 M$ v  b( Q' Z% v6 j
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沙发
发表于 2014-4-2 11:21 |只看该作者
Hint:
5 A. O5 H! C4 k8 J1 ~! ~大部分endotoxin removal 都要求incubate on ice 这个过程 事实上是增加detergent在水里的溶解度 低温增加溶解度的detergent  

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藤椅
发表于 2014-4-2 14:20 |只看该作者
感谢!! z* g4 a) R+ U/ F* {: x) i
看来我们买了无内毒素的质粒大提试剂盒,还是等于在走廊里做单细胞qPCR
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板凳
发表于 2014-4-3 10:34 |只看该作者
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回复 Tivah 的帖子
' q* ~- \: b+ v) M; o4 \! O; H# ~/ ]( X3 l. s
其实 大于0.1mg DNA 扩增的的时候 PCR效率就太低了 细菌的来的快 但是带内毒素 3 Q- E; c$ H0 |, d$ {

3 N9 l7 ~" i" _, c( a/ n试剂盒一般都有endotoxin removal 如过没有 完全可以买beads 自己做 或者用笨(毒死人不偿命)
8 t2 e6 O& V2 f- m9 e# i- R* r$ q+ G  y$ q: S& t5 S% X
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报纸
发表于 2014-4-16 11:18 |只看该作者
写得较为全面,很受用呀,一般我们都是摇菌间和抽提间分开,然后后续的一些步骤都在超净台(预照三十分钟)中进行,拿出来离心时要注意封口就好了。因为前面许多步都有无水乙醇,所以前面的步骤不用太过担心。最后加的水一定要是事先分装好的高压消毒的无菌水,只要够细心一般都不会有问题的。毕竟是从细菌中抽提,还是要注意摇菌的质量,别有杂菌就好。
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地板
发表于 2014-4-28 15:20 |只看该作者
学习了,很好
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