iPSC感慨（我现在有点Chaos）

Tivah

我是2013年开始接触somatic cell reprogramming的。之前的publication只是大致浏览了一下，之后才开始认真看。
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% _3 P2 k3 G* V- b0 F6 p还是先感慨进展。12年能发Cell stem cell的，拖到13年就要发Stem cells了。从一开始的ES/iPS comparation, disease modeling, iPS from various species, immuno/onco-genesis, genome abnormality, direct lineage transformation到mechanism, efficiency, reprogramming methods, extent of rejuvenation, more mature disease modeling and direct lineage transformation...之后的路线会主要向着哪些方向走呢？从phenotype走到concept，大概”实力/务实派“还是会从concept再走回phenotype？% ?( F4 f+ X/ n" C2 H0 W6 E% t

; h0 p/ ^8 K# Q; {: m/ H6 o不是很支持Yamanaka提的超大规模药物筛选。即使不算诱导产生iPS的过程，human细胞诱导之前和诱导之后那几个月的培养要是上了规模……就算日本人玩命，这玩的可不止是命-_-||我说血清会涨价啊。（请允许我做一个邪恶的表情）& q* q+ `2 t, G9 \* C% a4 i. `3 F/ n

+ c& V8 l1 C9 Y8 l5 O重编程的机理……这个不说啥了。不过也算是分两种吧，一种是用自己筛出来的东西做，一种是“to recapitulate the canonical function of a defined molecule in reprogramming system"。但即使前者，如果只focus到reprogramming本身上，也已经不大容易做出很attractive的东西了。并且，”重编程机理“这个说法本身，也有点不靠谱（虽然，怎么说，这个结论-或者说意识-是通过很多比较靠谱的研究得来的）。
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我现在是比较偏好于看到更focus的paper，比如丁盛的肝脏相关的，或者做生殖细胞的，或者通过仔细研究一个谱系发生的表达谱变化，然后做直接转分化的……总之是对某一类细胞或者谱系特别了解积淀又比较深的。也不为什么，就是感觉这类的study看起来比较踏实点。4 c. K+ B$ e  ?" O% g  `, O! G

) C; a+ N, E( _+ B8 d3 a, t另外就是令人耳目一新的……唉我不说小保了。我的心好像重编程到D6就被扔液氮里冻着了，估计复苏之后也找不回感觉了……. \; N) E3 E+ S( x/ h( H# q

  G: w9 W7 }# ^% _4 G……好吧，这样。

Tivah

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* o3 f4 t7 K7 p& b! Q( z8 L- ?; n, N; ^回复 marrowstem 的帖子3 k( L- s0 {$ Y. i
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前几天Cell Stem Cell上拿人成体细胞做SCNT获得ES细胞的那篇挺不错。
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iPS太多方面不尽人意了……远了不说，拿它做机理，还真不是什么好model。能用ES就用ES了。, c7 i( C# Y  a
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唉我醒悟得晚多了。

Tivah

回复 markllq 的帖子7 E! ]( t. E5 ?% F
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……我对这个领域以后怎么发展的关注程度和对文章和马伊琍的进展的关心一样……只是说说。/ p+ i: w( S& Z
就是因为没课题才在这瞎嚷嚷灌水啊（嘿嘿）。有课题做起来自然是另外一回事了。热恋和看爱情片是两种感觉啊。{:3_58:}

Tivah

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( S' z6 {5 P! A9 B8 r7 f（虽然我现在也在努力灌水但是我依然这么认为）……{:3_55:}9 ^6 H1 ?9 J! C7 K
) ]; g: H+ C2 y% j+ u! z
反正想要做自己真正想做的，按现在这状况不也得先迂回一大通？要我说，读生物专业的，读一年课本知识然后大二直接拉进实验室去是最好的选择（当然学校不乐意了）。看学校里刚进来的研究生，有的连PCR都不会做，跟着师兄师姐后边跑半年，去导师办公室谈个话，课题定了，于是就稀里糊涂开始做，也有做得挺好的。, n3 p+ Z( }& y7 H  u: C

1 ^2 r( |7 K! t/ O& s0 n我都不知道大学四年学啥了。

Tivah

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; z# B: k1 ]. p& @, H6 Z混乱……我用这个词只是这么想的。
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不是很能分清楚比较现实的想法和比较不靠谱的想法。价值观上有点双重取向。（说白了，就好像看别人实验室发的cell是一个评判标准，看自己实验室发的JBC是另一个评判标准。……呃，这么说怎么有点儿像骂别人怎么不去见义勇为但自己的手还抄在兜里……）

Tivah

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“机会提供了什么可干的，要干到极致，一定会有收获。”这句话很同意。有感觉之后，那种“神秘又朦胧”的感觉没有了，激情也和开始盲目的激情不一样了，虽然走的路和之前想的不一样，但看得是更清了。不过是有点讽刺的是，非得自己走到那一步，才能感悟到那一步；别人说都是没用的，自己还是得重复走一遍那个阶段，花费那么一个阶段的时间才罢休。
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只不过，有时不得不为自己想做的，走上一大圈的迂回路。有些迂回是奋斗所必须经过的，但还有一些是出于无奈了。有一个师姐，研一的时候老板让她养金鱼，她就养。但是一直有绿藻，金鱼身上长绿毛。她告诉老板，老板让她网上查，她查了是用高锰酸钾泡。于是基本整个研一的时间，她就在用不同浓度梯度的高锰酸钾泡金鱼，工作报告内容就是这周又用多少浓度高锰酸钾处理，有多少金鱼死了多少没长绿毛……研一快结束了，老板告诉她，不用养金鱼了，不用了。于是金鱼扔了%……￥#&@……*……￥#
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高中报专业的时候我想的还是拿个照相机跟在斑马屁股后面跑呢。现在是想找个不是在玩的老板，做个能让自己有些sense of belonging的课题。

Tivah

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回复 Andyhigh 的帖子3 I& _1 d1 y/ w$ r' t* \
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呃，我没说清……我的意思是，phenotype比如Yamanaka最初的鼠iPS的paper，有这么种细胞；或者加个什么分子敲个什么分子，有这么个高效率。玩concept的比如lineage specifier，我有这么个概念，我认为这个促进重编程，看，我有表型支持。（当然两者相辅相成，只不过说的方式和偏重点不一样）
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+ A( I; g9 j5 [( }* \- m) \转分化或者iPS分化，我的确不是很清楚。微感觉坑人，但模糊感觉还可以。不满意的是，比如都是分化成hepatocyte吧，先出来个A paper，说我分化成hepato-like cells，看，有abc三种酶都很好；第二年，再发个B paper，说我们做的hepatocell，有abc三种酶都很好，并且A paper中不好的d酶，我们的细胞也很好。……但这个A paper里是不会说的。有时候我会认为，对相应的领域应该强制要求展示一些数据，或者至少做出什么限制，而不是想说什么就说什么，想不说就不说。我说转分化或者iPS分化有意思是觉得这个如果用来做疾病机理，倒是不错。（但是像你说的那样，优势在逐渐被取代，但劣势却盖不住。Cell Stem Cell上那篇用成人细胞SCNT获得ES的那篇，就把iPS迄今一直标榜的能够获得成人的难获得的病理组织的优势给说下去了）
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! T/ c0 N7 c# D5 R至于做机理的，呃，问题是即使他们想做downstream work，做啥？我还真想把一直用来形容reprogramming的stoichasitc给换成chaos呢-_-||  iPS现在定位略尴尬啊。如果一个“机理研究”弄到加不加Vc铺不铺feeder都有影响，那影响力自然是大打折扣了。

Tivah

回复 markllq 的帖子. s5 i) w' @% f) w+ ]) k0 b: q

0 }7 G' B( I. n* x, J! L/ v% t”最初什么都不懂的时候你觉得最有意思的问题就是最好的课题，真能跟着感觉而能不受其他的束缚那就对了。“
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! N4 q. S, s" C8 F' {# T& J# |2 H同意啊！一开始跟着师姐做进化，那时是真的相信自己做的东西很有意义的，做的时候，心里充满底气（我就不说那种微妙的自豪感了）。做物理的一货在希格斯波色子结果公布前夕说的好，”如果你都不相信会发生什么，那就真的什么也不会发生了“。9 p* F  _6 V- U8 t

) p) F9 g6 V2 J, O( e8 Q我相信我找得回这种感觉。玩个游戏都能上瘾通宵刷装备呢。那可是除了一堆代码代表的等级和装备啥都不给我。（猥琐地笑，这个论坛表情都太正经了）

Tivah

回复 zhen022 的帖子* i3 @( _) l5 c" p5 N

& Z; v6 c* \5 m. Q- w/ e我鼓励自己说这就像是初恋失败，受伤了之后就成长了。路还很长啊。