主成分分析图怎么读啊 - 实验室综合讨论区干细胞之家



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查看: 47390\|回复: 8	go [请教] 主成分分析图怎么读啊 [复制链接]

a279915845

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小小研究员

楼主

发表于 2014-11-5 20:59 |只看该作者 |倒序浏览 |打印

本帖最后由 a279915845 于 2014-11-5 21:04 编辑 : h3 j& y7 I) _ z
! p Z3 u( S( M! L9 u2 S
求助大神，

图B和C怎么看啊，求帮助，谢谢，来自于文献Reprogramming to Pluripotency through a Somatic Stem0 f& Q# @2 W/ J+ G# c2 H$ ?& c
Cell Intermediate 7 `( _. u& [1 Y: U1 Q, g# ` W* W
Fig.2 （C）中，

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沙发

发表于 2014-11-5 23:44 |只看该作者

B是分级聚类分析（Hierarchical clustering），C是主成分分析（principal component analysis）都是数学软件处理的结果，只用看关系远近即可

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dabai22222

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藤椅

发表于 2014-11-5 23:52 |只看该作者

请参考附件华联公司的PCA分析描述

PCA 华联.pdf

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a279915845

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板凳

发表于 2014-11-6 10:29 |只看该作者

回复 dabai22222 的帖子" K' h$ _: u5 X6 [- @% U
5 C% f/ H- _& `, M9 z
非常感谢您的帮助，谢谢，另外D图的成对比较怎么看啊，求再指导一下，谢谢

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a279915845

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小小研究员

报纸

发表于 2014-11-6 10:31 |只看该作者

回复 FreeCell 的帖子
/ o) b$ Y1 u, G/ \. O4 Y" Z
非常感谢您的帮助，另外再请教一下，C图和D图具体怎么看啊 b2 W' d, C) c2 A

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FreeCell

版主

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地板

发表于 2014-11-6 13:09 |只看该作者

C图表示主成分相似的聚在一起，可以看出iNdiPSCs与ESC多能性高度相似，重编程成功
D E F是成对散点图，表示共表达信号水平一致的落在对角线区域，
D——iNdiPSCs与MEF有两个因子表达水平相当，7 c4 [0 s0 @/ \) b; `
E——iNdiPSCs与iNSC只有SOX2一个因子表达水平相当，$ h5 `5 \' O; i. y6 @
F——iNdiPSCs与ESC有四个因子表达水平相当，