有关慢病毒感染后对细胞的鉴定

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我有几个问题想请教大家
- s( R6 [8 g, I6 I1 P1）lentivirus感染细胞，整合的序列是哪部分？是从目的基因载体的LTR到LTR？还是也包含包装质粒部分呢？
0 _7 J) C' R1 {) X2）为什么可以提取被感染细胞的基因组来检测病毒整合情况？是因为目的基因直接整合，不存在内含子的问题么？
( A6 k, b9 \( U1 B1 ], d3）有的人用RT-PCR来做，是为什么呢？如果提取基因组就可以检测的话。. |1 g: e  s' z4 R4 r; q
4）还有一个问题，如果我提取基因组，我的引物可不可以上游是载体序列，下游是基因序列？1 i6 L! n: }! e

) V) l2 o# }& @7 ]" d( T; I多谢！
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zmfang555

1.lentivirus 其表达载体5'LTR到3‘LTR的序列整合到宿主基因组中成为前病毒基因组，并不含有辅助包装的遗传物质，否则就成了野生型病毒。+ _4 T( h! K$ S4 V: y
2.提取基因组的目的是为了做定性检测病毒基因组是否整合。
3 q1 ^( l' H/ @2 F' W3.realtime 的目的是检测目的基因在宿主中的表达水平。
7 ]. V( p! d/ f) E4.引物设计时你要充分考虑你的引物特异性，既目的基因中选取的片段是否有非特异性结合。