有关慢病毒感染后对细胞的鉴定

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我有几个问题想请教大家
" q- r  w) ~+ G, c+ ?1）lentivirus感染细胞，整合的序列是哪部分？是从目的基因载体的LTR到LTR？还是也包含包装质粒部分呢？( s# Y7 p: G/ `/ B
2）为什么可以提取被感染细胞的基因组来检测病毒整合情况？是因为目的基因直接整合，不存在内含子的问题么？5 |  U( S6 K; n- a3 i! e
3）有的人用RT-PCR来做，是为什么呢？如果提取基因组就可以检测的话。
: [0 A" r2 i) x2 u+ o/ t+ O4）还有一个问题，如果我提取基因组，我的引物可不可以上游是载体序列，下游是基因序列？
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. l. E( U5 ~9 ?  X, H2 G" ^多谢！" D+ u8 ~& m5 u6 B5 o

zmfang555

1.lentivirus 其表达载体5'LTR到3‘LTR的序列整合到宿主基因组中成为前病毒基因组，并不含有辅助包装的遗传物质，否则就成了野生型病毒。
' G  y+ o' p1 \2.提取基因组的目的是为了做定性检测病毒基因组是否整合。# ]( b& J2 W; ]0 T. U* E
3.realtime 的目的是检测目的基因在宿主中的表达水平。
0 V- b6 x" O3 }/ t4.引物设计时你要充分考虑你的引物特异性，既目的基因中选取的片段是否有非特异性结合。