有关慢病毒感染后对细胞的鉴定

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我有几个问题想请教大家% o  N7 B6 O1 [" l9 u% A
1）lentivirus感染细胞，整合的序列是哪部分？是从目的基因载体的LTR到LTR？还是也包含包装质粒部分呢？1 b/ y. a1 h: A) ^1 i' _
2）为什么可以提取被感染细胞的基因组来检测病毒整合情况？是因为目的基因直接整合，不存在内含子的问题么？8 V6 G3 r/ y% C: H; @) k$ L
3）有的人用RT-PCR来做，是为什么呢？如果提取基因组就可以检测的话。# ?/ D4 ~" j% {4 }
4）还有一个问题，如果我提取基因组，我的引物可不可以上游是载体序列，下游是基因序列？
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多谢！2 A6 t& d6 B8 q! ~9 x

zmfang555

1.lentivirus 其表达载体5'LTR到3‘LTR的序列整合到宿主基因组中成为前病毒基因组，并不含有辅助包装的遗传物质，否则就成了野生型病毒。
3 c: ]/ G' ?- ?. [$ Z2.提取基因组的目的是为了做定性检测病毒基因组是否整合。
/ K5 }- B* Y2 c4 n3 I3.realtime 的目的是检测目的基因在宿主中的表达水平。
* \! p0 P% K: p0 g$ K! P  C4.引物设计时你要充分考虑你的引物特异性，既目的基因中选取的片段是否有非特异性结合。