有关慢病毒感染后对细胞的鉴定

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我有几个问题想请教大家
; }7 e3 h8 e. `" G+ `1）lentivirus感染细胞，整合的序列是哪部分？是从目的基因载体的LTR到LTR？还是也包含包装质粒部分呢？
+ Q3 `2 `, V; w- u3 m0 |2）为什么可以提取被感染细胞的基因组来检测病毒整合情况？是因为目的基因直接整合，不存在内含子的问题么？# l8 d$ M4 L" A- A- `
3）有的人用RT-PCR来做，是为什么呢？如果提取基因组就可以检测的话。
" _% ]* n3 A8 b9 c4）还有一个问题，如果我提取基因组，我的引物可不可以上游是载体序列，下游是基因序列？: s  s1 c& G3 k

5 f* A2 ~* S& ]& |; l) \* b多谢！
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zmfang555

1.lentivirus 其表达载体5'LTR到3‘LTR的序列整合到宿主基因组中成为前病毒基因组，并不含有辅助包装的遗传物质，否则就成了野生型病毒。6 E% P# Z$ `& D& f5 g8 X/ i5 R- W
2.提取基因组的目的是为了做定性检测病毒基因组是否整合。
# C4 I0 B8 Q) I$ V' ~3.realtime 的目的是检测目的基因在宿主中的表达水平。  D! r+ C- ^* Z' w+ W
4.引物设计时你要充分考虑你的引物特异性，既目的基因中选取的片段是否有非特异性结合。