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本帖最后由 runsong 于 2011-9-12 22:18 编辑
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/ ?) G- z7 u) Z/ i2 t2 a% b) w1 u: U这是一个预测转录因子在DNA序列上结合位点的网络工具,可以预测与启动子区域结合的转录因子。
* S8 L0 {- ^$ o# x6 A我是在 tonyp0720 的介绍下用了这个网站,虽然刚刚入门,但感觉不错,希望与大家分享,也在此抛砖引玉,望老手不吝赐教,同辈交流切磋。. n# a. u7 H. f" l/ d
TESS是宾夕法尼亚大学的转录因子搜索系统 网址:http://www.cbil.upenn.edu/cgi-bin/tess/tess
. W5 _+ ~. \2 a+ X1 R. C2 E最简单的用法如下1 N2 _* _- w4 W& b$ u7 L$ i" G
如图1:打开网址后,点击 site search6 R- o0 W8 | [* w2 i9 {
如图2:我是以CMV启动子为例说明用法,在2-1上输入序列名称;2-2上输入CMV启动子的序列;2-3中是网站保存预测结果的时间;2-4中输入你的邮箱地址,预测结果是发送到你的邮箱中的。点击 submit
2 u# k, J7 r0 O/ V, n Q如图3:之后的界面,此时预测结果已发送到你的邮箱中,如图4.有两个链接,第一个打开网站上的结果,第二个是结果的excel版本。0 b. Y2 {, ]7 ^7 t
如图5:打开链接的界面,是预测结果的基本信息。我们一般最关心的结果在 Poisson Significance ,点击它,界面如图6。上面就列出了与CMV启动子结合的转录因子。
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; Q: v/ W3 r$ r& ~; f* R# _3 g/ k其实网站上还有很多功能,我只会这么一点。详细用法可见附件文章。 |
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