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本帖最后由 runsong 于 2011-9-12 22:18 编辑
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这是一个预测转录因子在DNA序列上结合位点的网络工具，可以预测与启动子区域结合的转录因子。
/ A( J% c8 U, w( Q6 ~4 U6 @" Y) ?我是在 tonyp0720 的介绍下用了这个网站，虽然刚刚入门，但感觉不错，希望与大家分享，也在此抛砖引玉，望老手不吝赐教，同辈交流切磋。, r6 d; R# B4 G u
TESS是宾夕法尼亚大学的转录因子搜索系统 网址：http://www.cbil.upenn.edu/cgi-bin/tess/tess
3 J# r/ K; i5 R+ x' ]) J5 N9 y+ g最简单的用法如下
, b$ c: ^4 {. k. O7 L& q3 U如图1：打开网址后，点击 site search/ P; W3 \7 `* Q8 A
如图2：我是以CMV启动子为例说明用法，在2-1上输入序列名称；2-2上输入CMV启动子的序列；2-3中是网站保存预测结果的时间；2-4中输入你的邮箱地址，预测结果是发送到你的邮箱中的。点击 submit& S" V% h* c) {( s, b
如图3：之后的界面，此时预测结果已发送到你的邮箱中，如图4.有两个链接，第一个打开网站上的结果，第二个是结果的excel版本。
2 y7 q+ K& U$ U% y( X如图5：打开链接的界面，是预测结果的基本信息。我们一般最关心的结果在 Poisson Significance ，点击它，界面如图6。上面就列出了与CMV启动子结合的转录因子。
$ `' H0 F: f6 L3 T. e6 h9 g0 n7 ?! r+ h: b8 b% g
其实网站上还有很多功能，我只会这么一点。详细用法可见附件文章。 |
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发表于 2011-9-12 21:49
