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干细胞之家 - 中国干细胞行业门户第一站 干细胞之家论坛 东农生命专区 重磅:生物学家必备知识-RPKM和RMA的定量关系
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重磅:生物学家必备知识-RPKM和RMA的定量关系 [复制链接]

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发表于 2016-8-13 08:57 |只看该作者 |倒序浏览 |打印
小编发现生物学家特别关系基因的表达情况,但一般而言目前的表达数据主要有两种(芯片和测序),芯片数据采用的是RMA值表示表达的高低,但是测序数据常常采用RPKM表示。问题来了,那么RMA和PPKM在数值上的经验关系如何呢?
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现在清楚怎么解读测序数据的表达结果了吧,再举个例子:
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如图所示的这个基因UBQLN2 在大脑中呈现明显的高表达,在其他组织中是中高表达。在刚刚发表的Cell文章中,显示UBQLN2的功能缺失直接导致老年痴呆症,如此以来,大家就都明白了吧。6 m, C- M5 c1 g4 r. `' r

- J5 F7 L& l6 X5 u转自微信号:表观遗传学快讯$ |. [) t6 o; I. R, e5 U

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