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求一篇正儿八经的专门讲如何用lentivirus转染ES或者SSC的文献 [复制链接]

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金话筒 优秀会员

楼主
发表于 2012-2-28 11:40 |只看该作者 |倒序浏览 |打印
整个板块号称是研究如何转染ES,但看起来全都是讲如何包装病毒、如何做感受态之类的很基本的东西。有哪位达人手上有专门讲如何转染干细胞特别是ES或者SSC的文章?希望能包括如下一些内容:6 l& ~; D' }# s( I! \7 l8 o
1,需要的病毒滴度;
- d2 a. \8 h2 o2 D. U1 t+ C/ ?2 G3 _2,ES(或SSC)的转染的目的基因(或RNA)promoter的选取的特殊性,和各个promoter的强弱关系(CMV,EF1a,CAG,H1,U6等)和它们的适用情况;
% ]+ v5 ?3 j4 c7 K2 A: `0 `3,与基因表达后被细胞沉默相关的知识,比如说CMV转到ES之后会沉默但细胞分化后会重新开启吗?: [, e( [) I6 u' t
4,用何种protocol转染,具体程序,包括如何铺细胞,加不加MEF做feeder,加不加polybrane,转染几个小时,转后何时换液,最后何时检测阳性细胞,第一次转染一种ES的时候各种条件怎么摸(哪些条件要摸个小梯度),如何用药物筛选阳性(包括如何做药物浓度的曲线);
& J3 L  @- ?7 h# J5,各种trouble shooting。' ~" X1 J# F/ J: ]; V; I( `
期盼各位达人的指导。我是做SSC的,需要转染lentivirus。昨天在这里也看到一位网友要做这个实验。
. f8 y: _. n( @! `我对做这一块非常没有经验,从文献和各个同学的反映来看,这一行的水也很深,鄙人觉得亚历山大~
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金话筒 优秀会员

沙发
发表于 2012-2-28 12:54 |只看该作者
这个问题太大了,没看到有这么全的文章,你从公司买的话,倒可以仔细问问。7 f7 g7 V; Y7 N. @* W: _% }$ j
1:需要的滴度和细胞类型有关,一般给出的有效滴度都是以包装细胞如293T之类为靶细胞感染测量的,不同的靶细胞需要先测试下感染效率。以90%以上的阳性率为达标。/ A# I: b6 n! ?- S& }
2:除非有文献报道说某个启动子不能使用,一般CMV,EF1a之类都是常用的。可以通过报道基因来看一下效率。0 h; x  T. _; H9 a; ^3 f
3:不清楚,CMV被沉默好像也不是百分百的,只是表达量稍低吧?
1 E- H$ o- i" A. F6 N% E; f4:病毒进入靶细胞,不能叫转染了,应该叫感染。转染是前期包装病毒时的操作。至于feeder cell,最好在无饲养细胞的时候操作。polybrene是用来增加感染能力的,有一定细胞毒性,需要试试浓度,不加就能感染的话,就不要加了。药物筛选和普通细胞一样。
) L' I2 x2 Q; @6 h+ g. D
' e6 m  j) U6 b. y! ?
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藤椅
发表于 2012-2-29 01:57 |只看该作者
同求 帮顶

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金话筒 优秀会员

板凳
发表于 2012-2-29 10:54 |只看该作者
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ES中会感染病毒的,至于CMV沉默也有人提过,这方面的文献还没看到。。。
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报纸
发表于 2012-6-9 09:28 |只看该作者
ES中不同promoter 活性文献
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地板
发表于 2012-6-9 10:03 |只看该作者
前几天刚慢病毒做了个干扰,CMV驱动荧光,荧光有强有弱,选强的就行了,荧光看起来也挺好。
; C9 i# ?' j) D3 q1,需要的病毒滴度;; L" Z# u# g# I0 r
---------------直接病毒液转,不测滴度- U# E5 r- n( U0 o- ~$ s
2.和各个promoter的强弱关系(CMV,EF1a,CAG,H1,U6等)和它们的适用情况;
% {7 `  N7 n4 S----------个人以为绝对的强弱可能并不明显,可能跟插入位置有关,当然有人说EF1比较强。" t0 p- u9 P+ ^8 r5 o4 c
3.与基因表达后被细胞沉默相关的知识,比如说CMV转到ES之后会沉默但细胞分化后会重新开启吗?) ; i# g% x) V3 Q) S) m, d( j
----------沉默为什么会影响分化呢- M4 z! l% r0 v% T
4,用何种protocol转染,具体程序,包括如何铺细胞,加不加MEF做feeder,加不加polybrane,转染几个小时,转后何时换液,最后何时检测阳性细胞,第一次转染一种ES的时候各种条件怎么摸(哪些条件要摸个小梯度),如何用药物筛选阳性(包括如何做药物浓度的曲线)
. Q& j: ?) Q  i% l) R" c------------------加mef,不加polybrene,当然推荐加8 Y  m* r' [0 {- E, X. U
5 各种trouble shooting。6 o7 n9 d% c9 i+ d
------------------没什么trouble
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