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求一篇正儿八经的专门讲如何用lentivirus转染ES或者SSC的文献 [复制链接]

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金话筒 优秀会员

楼主
发表于 2012-2-28 11:40 |只看该作者 |倒序浏览 |打印
整个板块号称是研究如何转染ES,但看起来全都是讲如何包装病毒、如何做感受态之类的很基本的东西。有哪位达人手上有专门讲如何转染干细胞特别是ES或者SSC的文章?希望能包括如下一些内容:6 w( K: e) m* g7 ?/ S$ |$ o
1,需要的病毒滴度;( F0 ?, x) V( M; Q: x8 _  ]
2,ES(或SSC)的转染的目的基因(或RNA)promoter的选取的特殊性,和各个promoter的强弱关系(CMV,EF1a,CAG,H1,U6等)和它们的适用情况;
6 y3 b/ o, I1 L) @) k; F5 b' ?3,与基因表达后被细胞沉默相关的知识,比如说CMV转到ES之后会沉默但细胞分化后会重新开启吗?
! p  `7 v  f' S) Q, @7 X& S4,用何种protocol转染,具体程序,包括如何铺细胞,加不加MEF做feeder,加不加polybrane,转染几个小时,转后何时换液,最后何时检测阳性细胞,第一次转染一种ES的时候各种条件怎么摸(哪些条件要摸个小梯度),如何用药物筛选阳性(包括如何做药物浓度的曲线);
! u8 }8 p4 ]" Y( [& t5,各种trouble shooting。7 a1 o2 ~& m7 k6 a2 a
期盼各位达人的指导。我是做SSC的,需要转染lentivirus。昨天在这里也看到一位网友要做这个实验。; g+ A: L/ k4 L( W" n! L& d
我对做这一块非常没有经验,从文献和各个同学的反映来看,这一行的水也很深,鄙人觉得亚历山大~
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金话筒 优秀会员

沙发
发表于 2012-2-28 12:54 |只看该作者
这个问题太大了,没看到有这么全的文章,你从公司买的话,倒可以仔细问问。
$ O% n  i+ {; u; [. D9 {1:需要的滴度和细胞类型有关,一般给出的有效滴度都是以包装细胞如293T之类为靶细胞感染测量的,不同的靶细胞需要先测试下感染效率。以90%以上的阳性率为达标。0 c/ N) _# K  T! W, c, E
2:除非有文献报道说某个启动子不能使用,一般CMV,EF1a之类都是常用的。可以通过报道基因来看一下效率。
0 q7 y- p7 w3 _: X; M3:不清楚,CMV被沉默好像也不是百分百的,只是表达量稍低吧?# k2 v/ q- p. t. \& `! I
4:病毒进入靶细胞,不能叫转染了,应该叫感染。转染是前期包装病毒时的操作。至于feeder cell,最好在无饲养细胞的时候操作。polybrene是用来增加感染能力的,有一定细胞毒性,需要试试浓度,不加就能感染的话,就不要加了。药物筛选和普通细胞一样。; M& p5 O( Q$ T* L  G+ [1 s$ A! y
# h  \# |0 F1 F/ x
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藤椅
发表于 2012-2-29 01:57 |只看该作者
同求 帮顶

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金话筒 优秀会员

板凳
发表于 2012-2-29 10:54 |只看该作者
干细胞之家微信公众号
ES中会感染病毒的,至于CMV沉默也有人提过,这方面的文献还没看到。。。
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报纸
发表于 2012-6-9 09:28 |只看该作者
ES中不同promoter 活性文献
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地板
发表于 2012-6-9 10:03 |只看该作者
前几天刚慢病毒做了个干扰,CMV驱动荧光,荧光有强有弱,选强的就行了,荧光看起来也挺好。
+ v- Z+ H$ K1 T; m  ^0 {1 O1,需要的病毒滴度;
1 d3 O; D& O  l3 \; ~---------------直接病毒液转,不测滴度
3 u5 y( f  U; r1 r. }9 C2.和各个promoter的强弱关系(CMV,EF1a,CAG,H1,U6等)和它们的适用情况;
0 D2 B7 P, ]- D& u( R1 A----------个人以为绝对的强弱可能并不明显,可能跟插入位置有关,当然有人说EF1比较强。& A% k$ n) p* ^1 w& b+ N
3.与基因表达后被细胞沉默相关的知识,比如说CMV转到ES之后会沉默但细胞分化后会重新开启吗?)
1 V+ y+ P4 w# W----------沉默为什么会影响分化呢
' [" e. R3 Y9 E) ]4,用何种protocol转染,具体程序,包括如何铺细胞,加不加MEF做feeder,加不加polybrane,转染几个小时,转后何时换液,最后何时检测阳性细胞,第一次转染一种ES的时候各种条件怎么摸(哪些条件要摸个小梯度),如何用药物筛选阳性(包括如何做药物浓度的曲线)
8 M6 h1 H& q% g; {& I------------------加mef,不加polybrene,当然推荐加  i8 ?" Q2 N7 @8 T% Z$ W8 n
5 各种trouble shooting。. s" F3 v9 }- u" _/ K
------------------没什么trouble
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