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[请教] 请教大侠们,有关条件性cre重组酶基因敲入或敲出小鼠制备的机制、原理 [复制链接]

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楼主
发表于 2011-6-2 10:40 |只看该作者 |倒序浏览 |打印
请教大侠们,有关条件性cre重组酶基因敲入或敲出小鼠制备的机制、原理
! y6 C$ l" i. q/ O% T$ i& N网上看到的大多是knockout的示意,那knockin的与knockout的主要区别、方法有何不同,不是太了解,请各位赐教了,谢谢!
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沙发
发表于 2012-1-10 18:28 |只看该作者
本帖最后由 细胞海洋 于 2012-1-11 01:03 编辑 4 s( u7 q9 b* Z) W4 l
* s. e3 M8 S) s4 J" o
【方法】条件性基因敲除的基本原理Cre/loxP重组系统在神经科学研究中的应用 % Z) V+ p. H! Q% k) u9 m  p6 K
6 G% z0 U4 _# Y: O8 B% H
Cre重组酶和LoxP序列: w1 e& B- o: c* i
  Cre重组酶:于1981年从P1噬菌体中发现,属于λ Int酶超基因家族。Cre重组酶基因编码区序列全长1029bp(EMBL数据库登录号X03453),编码38kDa蛋白质。是一种位点特异性重组酶,能介导两个LoxP位点(序列)之间的特异性重组,使LoxP位点间的基因序列被删除或重组。8 k! t& O- Q$ W5 z9 d+ Q' t
  LoxP(locus of X-over P1)序列:来源于P1噬菌体,是有两个13bp反向重复序列和中间间隔的8bp序列共同组成,8bp的间隔序列同时也确定了LoxP的方向。Cre在催化DNA链交换过程中与DNA共价结合,13bp的反向重复序列是Cre酶的结合域。其序列如下:% l+ h1 Q7 o6 G( L
  5' - ATAACTTCGTATA - ATGTATGC - TATACGAAGTTAT - 3'% Z% G3 w4 }9 q9 `7 [
  3' - TATTGAAGCATAT - TACATACG - ATATGCTTCAATA - 5'  {+ C% c9 T0 |! j4 X
[编辑本段]Cre-LoxP系统的特性- y/ O4 E# t* w  r" p. k
  Cre重组酶介导两个LoxP位点间的重组是一个动态、可逆的过程,可以分成三种情况:
5 B7 _* _% N  m3 w3 b2 D9 I$ f  1、如果两个LoxP位点位于一条DNA链上,且方向相同,Cre重组酶能有效切除两个LoxP位点间的序列;& S" G0 v9 t1 I+ A5 h0 P2 v
  2、如果两个LoxP位点位于一条DNA链上,但方向相反,Cre重组酶能导致两个LoxP位点间的序列倒位;  e/ t% I5 o7 A  L7 U
  3、如果两个LoxP位点分别位于两条不同的DNA链或染色体上,Cre酶能介导两条DNA链的交换或染色体易位。' s: A, G2 W9 F4 q
  另外,Cre不仅可以识别LoxP的2个13bp的反向重复序列和8bp的间隔区域,而且当一个13bp的反向重复序列或者8bp的间隔区发生改变时仍能识别并发生重组。利用这一特点,人们在构建载体时可以根据需要改造LoxP位点序列,以用于特定的基因突变或修复,增加了该系统的应用范围。" p7 ]5 T# K1 B) ]' g* w) T0 V
[编辑本段]Cre-LoxP重组酶系统在基因打靶中的应用策略! ~& o8 K+ U4 _. \- k( _) B) p* Z
  基于Cre-LoxP的基因打靶要分两步来进行。首先要在胚胎干细胞的基因组中引入LoxP序列,这一步可以通过打靶载体的设计和对同源重组子的筛选来实现。下一步通过Cre介导的重组来实现靶基因的遗传修饰或改变。Cre-LoxP系统既可以在细胞水平上用Cre重组酶表达质粒转染中靶细胞,通过识别LoxP位点将抗性标记基因切除,又可以在个体水平上将重组杂合子小鼠与Cre转基因小鼠杂交,筛选子代小鼠就可得到删除外源标记基因的条件性敲除小鼠。或者将Cre基因置于可诱导的启动子控制下,通过诱导表达Cre重组酶而将LoxP位点之间的基因切除(诱导性基因敲除),实现特定基因在特定时间或者组织中的失活。 ) Q% T" H) L5 M( f/ R- ~
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藤椅
发表于 2012-1-11 11:06 |只看该作者
所用的原理都是同源重组,knock-out是同源重组后使目的基因失活,而knock-in是通过同源重组的方式将标志基因整合进目的基因的某个位置。在载体设计上knock-in和conditional knock-out比经典的敲除要麻烦一些,要考虑插入位置和promoter的问题
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板凳
发表于 2012-4-17 15:06 |只看该作者
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回复 llecstem 的帖子7 d: J$ T" V; j. o4 n
6 j4 ^% W0 M  X: x- y5 x- v3 t
你好,请问能具体说说插入位置,以及promotor考虑的原则吗?* |( O; C9 t4 y( R- k8 a  ^; M
我现在也在考虑做knock in,但是有好些不明白的地方,如果我想把cre放在某个基因的promotor控制下,那么该插入到哪里啊?有的文章说将cre插入到基因的起始密码子后面,这样的话是不是导致这个基因失活了啊?; E6 e" u+ h/ z( H8 T$ \
谢谢
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报纸
发表于 2012-4-19 16:17 |只看该作者
你到图书馆去借一本书看看不了解的更详细吗?或者自己去网上买一本
/ F6 b1 k/ a& V: L; c有专门讲转基因的书,中文的,图文并茂很不错的

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地板
发表于 2012-4-20 13:05 |只看该作者
回复 liangxiaolei 的帖子
! \! \- x9 V! M: f' v
$ ]) @, {% H5 U  W我没做过Cre的小鼠,Cre的小鼠都是买的。现在已经有非常多的不同基因下的Cre的小鼠了,一般都可以找到你需要的,除非你要的基因非常特殊。你可以到南京模式动物中心去搜一下看是否有你需要的小鼠
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发表于 2012-4-25 09:27 |只看该作者
谢谢各位!
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