这种事情经常见,很令人头痛。有个问题是:你是两对引物一起P,还是每对引物单独P,如果一起P,两对引物的退火温度一样吗?- l0 o4 R- S( _# G
还有就是你单独P那个EGFP能P出来吗?P的时候一定要做好各种对照。就是说已经明确鉴定过的EGFP小鼠DNA,还有不带EGFP的小鼠的DNA。还有P不出来是因为这种小鼠就是没有EGFP。% H4 S6 U: B, k, ^- T
* e3 P6 v. A, }' L7 Y, u最笨的解决方案:首先是确定PCR用的酶、buffer、dNTP都没有问题,然后就是确保引物序列没有合成错误。剩下的就是痛苦的PCR条件摸排了,比如退火温度,最好是梯度温度,还有PCR时间。 8 X* y& |% x' d& U. f& n7 s; q有的时候还要加DMSO等帮助PCR。
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非常感谢moluxingke,我用的是2x的Mix,用了四种,退火温度也试过很多次,后来都只做阳性对照了,不管分开还是一起扩增,都是只有内参,目的基因的引物序列是没有问题的,我自己也设计了,得到相同的序列。实在没有办法了,现在换了一家公司,重新合成引物看看。不过我从来没用过DMSO,我也试试。继续奋斗!