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日本研发新技术可解析蛋白质二级结构
6 V/ c; @3 p0 {/ I1 g2 ~3 Y) [来源:科技世界网 / 作者: / 2016-08-02
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研发中使用的核磁共振装置
! ~2 o; ^9 n L9 O0 Y日本理化学研究所和日本电子公司的联合研究小组于2016年8月1日宣布,他们成功开发出一种核磁共鸣法(NMR法),能够在不使用同位素标记的情况下解析蛋白质的二级结构。 v* t+ Q; j/ w, L! U( n: ~
理化学研究所CLST-JEOL合作中心固体NMR技术开发小组的西山裕介组长带领团队完成了本次研发工作。具体成果已于8月1日刊载在英国知名科学杂志《PhysChemChemPhys》上。
6 o- s: R* Z6 z8 m+ G* s* ]蛋白质二级结构(secondary structure of protein)指它的多肽链中有规则重复的构象,是蛋白质整体形状的基础。蛋白质中的代表性二级结构为β-折叠(β-sheet),是由伸展的多肽链组成的,可分为平行式和反平行式两种类型。
* Z; l6 n; V* D/ ~在过往的研究中已经证实,β淀粉样蛋白的异常沉积是阿尔茨海默病主要发病机制之一,而β淀粉样蛋白中富含β-折叠构造。由于β-折叠构造非常凌乱,因此难以使用X射线衍射法和冷冻电子显微镜进行解析。此外,因为β淀粉样蛋白不溶于水,所以也无法使用溶液NMR测定法。为了解析β淀粉样蛋白这类的蛋白质,需要使用人工增加了碳同位素13C以及氮同位素15N含量的同位素标记样本,进行固体魔角旋转核磁共振,不过由于13C、15N的天然存在率仅为1.1%和0.36%,因此使用范围极为受限。
# ?( W, i; _, t+ P该研究小组在此前曾经研发过能够高速旋转样本的超小型NMR样本管,还成功开发出能够获得同位素丰度达99.64%的氮同位素14N原子间距离信息的14N/14N相关NMR测定法。
( U; \" I5 x: D6 \. z- p在本次的研究中,小组成员制作出分别拥有平行式β-折叠和反平行式β-折叠结构的两种丙氨酸三肽(Alanine tripeptide)微结晶样本,使用1毫克的样本来进行14N/14N相关核磁共振测定。实验发现,只有拥有反平行式β-折叠结构的丙氨酸三肽中,能够检测到β股(β-strand)间的14N/14N相关信号。这也就证明了,该方法可以辨别平行式β-折叠和反平行式β-折叠。
! p3 o' M! ~# A% n: ]0 K& ?西山组长表示,在今后将通过提高样本旋转速度、强化核磁共振中使用的磁石来进一步优化设备的性能,力争让蛋白质二级结构解析技术更上一层楼,并应用到制药领域。
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