用等同“搜索与替换”基因来改变活体基因组

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用等同“搜索与替换”基因来改变活体基因组
8 L- V# y% b. C$ i. t% g( q0 v; ~来源：生物360 / 作者：coo / 2016-08-19
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包括George Church在内的研究人员在完全重新书写活体细菌基因组的道路上取得了新的进展。一旦能得到这样一种重新编码的有机体，通过结合非标准但却有用的氨基酸，该有机体能表现出自然界中看不到的特征。它还能让制药业和其它产业中培养的细菌对病毒具免疫力，从而省下因病毒污染造成的数十亿美元的损失。最后，研究人员指出，由于实验室外的编码限制，这种微生物中的改动遗传信息无法污染自然细胞，因此对其的创制可终止实验室设计的生物体污染野生型生物体的基因。在活体生物的DNA中，相同的氨基酸可由多种密码子编码；密码子是由3个核苷酸字母组成的DNA“词汇”。过去的研究证明，有可能用大肠杆菌中等同于“搜索与替换”的基因将单一密码子代之以另类密码子；现在，Nili Ostrov、Church和同事对取代整个基因组中多个密码子的可行性进行了探索。通过探索如何根除6万多例7种不同密码子，研究人员尝试将大肠杆菌编码中的密码子数量从64个减少至57个。他们系统性地用另类密码子替换了所有6万2214例的这些7种密码子。研究人员说，在研究人员组装并测试的再编码大肠杆菌片段中，所有7种密码子的情况都被替代，而受到基础氨基酸改变冲击的大多数基因能够正常表达。作者们写道，尽管他们无法制造一个能充分运行的57-密码子大肠杆菌，但“如此规模的功能改变的基因组还没有被探索过。”他们的结果对下一步在基因重写竞技场（即创制一种全部重新编码的生物体）中该怎么做提供了关键的线索。; y9 E& S' H! ]* ?3 f
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原文检索：Design, synthesis, and testing toward a 57-codon genome* A  D. I+ B5 W8 \( D
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