  
- 积分
- 24651
- 威望
- 24651
- 包包
- 144128
|
如何快速发现肿瘤特异性外泌体 RNA 分子标志物) e/ i! i1 j. u7 R
来源:表观生物 / 作者:杨学敏 / 2017-03-221 u( b) W/ ^# o9 K4 F( p0 \
在当前精准医学的大背景下,液体活检作为一项重要的创新技术,有望在癌症早期筛查与诊断、治疗方案指导、疗效评估及预后测评领域发挥作用,具有极高的临床应用价值和市场前景。液体活检主要包括检测血液中游离的循环肿瘤细胞 (circulating tumor cell,CTC)、循环肿瘤 DNA (circulating tumor DNA,ctDNA) 和外泌体等。
$ z. Q T$ c4 ]0 v1 Q. W外泌体为大小 30 ~100 nm 的细胞外泌性囊泡,具有脂质双层膜结构。近年研究显示,外泌体是细胞与细胞间通讯的重要的分子,参与诸多生理与病理过程。外泌体中不仅包含蛋白质成分,还包括一些 RNA 成分,如微小 RNA(microRNA,miRNA) 、长链非编码 RNA 和 mRNA、环状 RNA(circular RNA,circRNA)。外泌体所携带的这些 RNA 统称为外泌体来源 RNA, 具有完整的序列结构和生物活性,有望作为液体活检分子标志物诊,在精准医学发展上有着光明的前景。
. |8 O/ ]- n$ c& f3 W0 t; t相比与传统液体活检所检测的 cfDNA 和 CTC,外泌体具有以下优势:
1 ~0 K. o, ]7 V5 y) z3 F5 O8 L' Z外泌体在体液中具有更高的浓度含量,有利于肿瘤的早期诊断; d7 m9 z6 x4 H7 e/ E
外泌体的脂膜结构对所包含的核酸分子起到良好的保护作用,具有更高的稳定性;
8 {/ \/ f1 y1 n# w7 k. ?外泌体的粒径较小,通透性强,容易到达各种体液中,为液体活检提供重要的前提条件;外泌体包含丰富的核酸分子,从 mRNA、lncRNA 和 circRNA 等大 RNA 分子层面更容易发现肿瘤特异的分子标志物 [1][2]。
" e' v. Q( ~0 f* K+ r- e7 G
7 S# a! A9 E7 _- N表观生物通过反复比较测试多种外泌体的提取技术,最终择优采用 Qiagen exoRNeasy Serum/Plasma Maxi Kit 试剂盒,该试剂盒来源于首个通过 FDA 批准的外泌体诊断公司 -- 美国 Exosome Diagnostics, Inc. 的核心技术,能够在 25 分钟内快速纯化得到细胞外囊泡,并获得更为全面的高纯度 RNA 分子,适合用于检测外泌体中的环状 RNA 及其他长片段的线性 RNA。 表观生物技术团队结合最新的高通量测序技术和生物信息分析方案,倾力打造外泌体 RNA 分子标志物开发的转化医学整体解决方案! @* `* y+ R, t" f
7 [+ }4 a7 }8 ^; n9 `7 {1 O3 Q( [* [
$ m/ i+ A* I: f6 H! q
参考案例
+ Z8 m- O. `! ?& t来自复旦大学的科研人员首次发现了 exosomes 内含有大量 circRNA[3]。
/ D2 z l2 ?3 ]4 V' i0 g7 a3 I研究者从 MHCC-LM3 肝癌细胞以及此细胞来源的 exosomes 中分别提取总 RNA(去除核糖体 RNA),进行 RNA-seq 分析,发现 exosomes 中的 circRNA 比 exosomes 来源细胞中的 circRNA 丰富得多。
* i; @' f/ o2 e- i( T/ b" f4 `通过 exosomal RNA 测序方法,研究者发现人血清 exosomes 也含有大量完整稳定的 circRNA,并且结直肠癌病人血清 exosomes 中的 circRNA 与正常人差异明显,肿瘤来源的 exo-circRNA 有望成为癌症检测的潜在生物标志物。1 I8 J# Q( O% `+ ]3 r7 j
& K' R X! A4 W; D% ?: [
参考文献:
2 Q0 P; c3 Z; P( f! W" L& k[1] Zheng Q, Bao C, Guo W, et al. Circular RNA profiling reveals an abundant circHIPK3 that regulates cell growth by sponging multiple miRNAs[J]. Nature communications, 2016, 7.
- P; Y0 G$ d- ~' W[2] Guarnerio J, Bezzi M, Jeong J C, et al. Oncogenic role of fusion-circRNAs derived from cancer-associated chromosomal translocations[J]. Cell, 2016, 165(2): 289-302." Z; C4 ^2 O# A% [2 ?0 p6 H. y& l8 d# p
[3] Li Y, et al,.Circular RNA is enriched and stable in exosomes: a promising biomarker for cancer diagnosis.Cell Res. 2015 Aug;25(8):981-4.
! y5 N# N2 b" S, q' E u& ^ P" F1 |1 v$ G! {: e6 ]5 n8 [3 P
|
附件: 你需要登录才可以下载或查看附件。没有帐号?注册
-
总评分: 威望 + 2
包包 + 10
查看全部评分
|