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Nature:从功能上对将近4000种BRCA1基因变异体进行分类 [复制链接]

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发表于 2018-9-15 21:59 |只看该作者 |倒序浏览 |打印
Nature:从功能上对将近4000种BRCA1基因变异体进行分类. ^9 p2 y( J( @# ~. s
来源:本站原创 2018-09-14 23:49
" c( k- K$ e  X9 d2018年9月14日/生物谷BIOON/---肿瘤抑制基因BRCA1功能缺失能够导致乳腺癌和卵巢癌。在一项新的研究中,来自美国华盛顿大学的研究人员在功能上对近4000种BRCA1基因变异体进行分类。这些发现可能有助于将癌症风险归因于未知的BRCA1基因变异体。相关研究结果于2018年9月12日在线发表在Nature期刊上,论文标题为“Accurate classification of BRCA1 variants with saturation genome editing”。+ e! P" {" g# e8 J& |  x

7 _! h6 D% d  v$ P6 @+ o图片来自Nature, doi:10.1038/s41586-018-0461-z。
9 W' u5 N8 Y; i
+ N. Y/ Q  ~2 ~3 b. b3 Q' ^- f8 ]美国宾夕法尼亚大学肿瘤学家Susan Domcheck(未参与这项研究)表示,“这项研究真的是非凡的杰作。”4 a. @8 U& X, J1 h, T+ j

, b7 `) X3 l- [1 w7 Y9 _, B据Nature期刊介绍,数百万人接受了BRCA测序,但许多BRCA变异体的影响并未被医生很好地理解。- |4 |, v) E7 U" W5 c9 f

$ e0 C8 z8 W/ l* K9 Y通过使用CRISPR,这些研究人员获得了BRCA1基因的3893种变异体,并将它们整合到经编程后如果非功能性BRCA1存在时就会死亡的单倍体人类细胞系中。这有助于他们观察哪些序列让细胞存活,以及哪些序列会杀死这些细胞。已知是良性的或导致肿瘤的BRCA1变异体的研究结果在临床上与它们的数据存在关联。% p: Q( r' `6 R$ \  z; x: J

( M0 }: z( ?: s8 ~  p% H  J美国哈佛医学院的Heidi Rehm认为这些结果“得到了充分验证”,并提出临床医生“应该权衡”针对这些新描述的BRCA1变异体的数据对他们作出的医疗保健建议的影响。
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; L2 e4 b0 M# R* S( m, P8 C其他人提出这些数据可能需要在体内进行测试。在针对这项研究作出的评论中,美国国家卫生研究院(NIH)的Stephen Charnock表示,“体外数据独自不能作为提出医疗建议的基础---至少要到这种方法在临床上得到验证为止。”- o( r* W# Z$ R1 h7 h
1 {; O; e- S3 ~" z% \" R
论文共同通信作者、华盛顿大学的Lea Starita指出,“我们希望这个基因变异体数据库将继续增加,并将成为指导对可靶向的基因变异体进行解释的中心点,这是因为它们最初是在女性中观察到的。”(生物谷 Bioon.com)
$ g3 r+ W  P( A0 P/ O; V
7 V0 }* U) [; q6 H) x' [参考资料:
; S8 l1 l; y' u- R/ [2 X! p8 Y( J/ w0 Q0 {4 ^
Gregory M. Findlay, Riza M. Daza, Beth Martin et al. Accurate classification of BRCA1 variants with saturation genome editing. Nature, Published Online: 12 September 2018, doi:10.1038/s41586-018-0461-z.% l5 I% p7 q' a# I4 U

" _  f, P, s  s2 T/ }Stephen J. Chanock. Gene editing reveals the effect of thousands of variants in a key cancer gene. Nature, Published Online: 12 September 2018, doi:10.1038/d41586-018-06022-y.
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