基因组标签计划GTP计划将由我国科学家主导

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基因组标签计划GTP计划将由我国科学家主导) U& b" @( ]+ c+ D& c. a& V
来源：科技日报 2019-05-24 12:44
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国际合作的人类基因组计划（HGP）耗时13年、花费30亿美元通读了人类遗传“密码”，但很多生命问题仍然无解。例如基因组相同，细胞却分化为不同器官，里面发生了什么？癌症发生的前、中、后期，细胞发生了哪些变化？……; m. Y# P! ?5 ~- b8 \
这些动态的生命“程序”有没有可能被读通？5月23日，香山科学会议在上海召开以“基因组标签计划（GTP）”为主题的学术讨论会，建议启动由我国科学家全权主导的基因组标签计划，协作完成复杂的生命程序读通工作。
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“生命是一个动态程序。基因组解码是静态的，难以体现生命实质。而后基因组时代，人们开始探索生命过程中生物大分子的相互作用以及作用程序。”中国科学院生物化学与细胞生物学研究所研究员李劲松说，但这类研究目前还处于“盲人摸象”的阶段，更谈不上掌握其规律。
4 ?. z' o# [: v基于正在发展的GTP平台，人们有可能在分子水平上，高精度、高准确度地对生命活动进行时空追踪。中国科学院院士李林表示：“我们瞄准的是重大科学问题的解决，利用：GTP平台，通过形成科学共同体的方式突破人类对生命认知的极限。同时，GTP项目的实施将带动相关科学领域的发展，如标签技术、蛋白质分析技术等，最终将有望促使生命科学研究水平的整体提升。”此外，GTP计划还有望带领人类走进生命科学研究的“不毛之地”，例如谜团巨大的脑科学领域、不明作用的“基因沙漠”等。
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HGP的启动基于人类掌握了基因测序技术——桑格测序法，GTP的启动同样基于新技术的发明，即我国科学家在“人造精子细胞”介导半克隆领域具有全球领先的技术、专利和研究。5 n* p% ~, L2 o5 B4 s: L9 C  c) u, T
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“因此，GTP计划由我国科学家主导顺理成章。”李劲松表示，目前的蛋白质分析技术难以实时反映蛋白质的生命功能。中国科学家通过发明“人造精子细胞”，把对蛋白质的研究回归到在动物活体中进行，大大提高了基因编辑动物模型的构建效率，并保证了基因编辑的准确性。“我们通过基因编辑的手段在‘人造精子细胞’中将特定的标签序列整合到某个编码蛋白质基因序列中，其基因操作将准确地反映到半克隆小鼠中。”李劲松表示，在动物活体中研究蛋白质，实现了在体、原位、实时、动态。$ B- [$ C: v$ _
搭建平台，瞄准重大科学问题
" ^7 e- \/ l0 c& M* q“这是一个整体项目，因此必须在开始时就统一标准，保证数据的一致性。”李劲松介绍，GTP先期获得中国科学院战略性先导B类专项和上海市科委项目的支持，目前已经成立了生化与细胞所GTP研发中心，制定了标准操作程序。目前，GTP研发中心已经获得500余株标签“人造精子细胞”系和140余个标签小鼠品系。
, q" B7 p0 g9 e0 C' ]+ B千里之行，始于足下，GTP计划从搭建平台开始做起。“我们计划5—10年内，针对基因组范围的蛋白质基因进行标签，获得基因组（约2.5万个基因）的‘人造精子细胞’库，并获得5000余种与人同源的重要蛋白质的标签小鼠，形成有国际影响力的实验动物研发平台。”李劲松说。
" T( _+ n' [, Z) C9 P, I! r( `“目前我们已经开展了相关的合作，也包括一些国际合作。”李劲松说，GTP研发中心也正在筹备相关网络平台的建设，科研团队不久之后就可以通过网络申请提请合作。生命科学家能第一时间利用这一平台开展大科学研究计划，如描绘精准的发育过程中的蛋白质图谱、探究肿瘤或其他疾病发病的相关蛋白质，为其精准治疗提供药物靶点和新型诊疗方式等。/ ]* Q: Q3 }5 d& X+ O# r$ ~2 H6 Y
任务庞大，创新与协作将贯穿始终
1 R% L! }; m% |& h9 ^著名的“冰山理论”非常适合描述GTP的工作任务体量。李劲松解释道，如果说2.5万个功能基因是浮出水面的“冰山”，那么其对应的蛋白质、蛋白质构象的变化、蛋白质调控通路等更多的研究任务则是水面下更大的冰山，体量很可能是露出水面的上百倍。/ C; Z- l5 Q( g* G9 w' Y
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尽管为了推动GTP，中科院生化与细胞研究所专门建立了GTP研发中心，但是，“整体工作的体量，不可能是一家单位能够完成的。”李劲松说。* g; e& z1 ]& v4 {  Q! L, @
此外，向冰山下的延伸还需要“知识基础”，对某一条细胞通路或蛋白质特性进行过深耕的研究组，辅以新技术的“加持”，将会“如虎添翼”，因此GTP计划需要有生命科学研究基础的科研团队，当然也会有一定的进入门槛。
8 w' f! u  y# a6 R! L9 j5 u  \) U' w“新技术也会随着计划的开展不断创新。”中科院生化与细胞所研究员李党生说，例如，GTP2.0时代或将探索荧光标记的使用，最终实现蛋白质表达的可视化，科学家不必在条带中确认蛋白质的表达量，甚至可能通过荧光定性定量。
, V. s$ B' O  j4 M) s& _8 j7 e届时，展现在人类眼前的将不仅仅是人类2.5万编码蛋白质基因的表达和翻译，还可能直击蛋白质表达的“时序”，甚至观看到生命由受精卵长成中生命进程“路线图”的动画版。(生物谷Bioon.com）7 e2 W+ z: e. e% i( o$ [