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求助 跨内含子的 Real-time 的引物设计问题 ,最后有一个流程 [复制链接]

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金话筒 优秀会员

楼主
发表于 2010-6-8 08:41 |只看该作者 |倒序浏览 |打印
求助 跨内含子的  Real-time 的引物设计问题 ,最后有一个流程。9 A7 N! |/ ]$ J; e, J
/ Z- r3 c- u3 i
不是太懂 ,尤其下游需要翻转的 就比较麻烦一点 。& @$ M  Y3 T( ?8 n5 q: e

- q( d! F7 m9 h6 Y. B; M我的想法是   先使用软件设计出 引物 后 ,在 基因组里搜索  两个引物的位置 是不是在 两个外显子 上 。  这样的方法不知道可不可以
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金话筒 优秀会员

沙发
发表于 2010-6-8 08:42 |只看该作者
其实也是做oCT 3/4,nanog ,sox2 的  表达   量分析 。) e" d1 L' Q- c" s  H
$ G( H8 \& h) [3 m
欢迎大家多提建议

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藤椅
发表于 2010-6-8 09:42 |只看该作者
楼主说的方法应该是可以的。
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板凳
发表于 2010-6-8 13:59 |只看该作者
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你是用探针法还是用染料法呢?
  C: F/ C0 K4 Q0 v  I2 h其实染料法的话,就是注意扩增片段在80-200之间,TM值设置为60,一定要注意不能有发夹结构和特异性!
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