Cancer Cell：复旦大学樊嘉等为胆囊癌精准分型与治疗描摹新蓝图

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Cancer Cell：复旦大学樊嘉等为胆囊癌精准分型与治疗描摹新蓝图4 V! I6 l* B. L. i1 D3 [* B
1.        基因组测序* g4 B9 s/ k9 d& ~- c
2.        胆囊癌（GBC）
: Q: Q% m2 I) I; F3.        蛋白质基因组学图谱
2 O3 h2 y* H/ [6 k1 g来源：iNature 2026-01-14 11:27; E4 [4 ?# I8 S& Q) b9 E# Z
该研究系统描绘了GBC的突变背景、与重要临床病理特征的相关分子驱动因素以及肿瘤免疫微环境（TIME），并在此基础上构建了与预后关联的GBC多组学分型框架，为后续转化研究提供依据与数据支撑。, |8 `9 ]" C) \4 ?* ?8 O1 T9 r
胆囊癌（GBC）是恶性程度较高的肿瘤之一，起病隐匿、进展迅速，且在确诊时相当一部分患者已处于中晚期；即便接受根治性手术，复发与远处转移仍较常见，系统治疗的总体获益亦较为有限。然而，长期以来，能够接受根治性手术并获得足量GBC组织的患者数量有限，导致可用于开展系统性分析的大队列资源匮乏。7 c9 N  \1 t: G% y5 M
2026年1月8日，复旦大学樊嘉、高强、中国科学院上海药物研究所周虎、中国科学院分子细胞科学卓越创新中心高大明、上海交通大学龚伟共同通讯在Cancer Cell（IF=44.5）在线发表题为Integrative proteogenomic analysis provides molecular insights and clinical significance in gallbladder cancer的研究论文。3 Q( v! \" ^) H2 G+ s
该研究通过收集195例多中心样本，整合全外显子组、转录组、蛋白组与磷酸化蛋白组数据，系统描绘了GBC的突变背景、与重要临床病理特征的相关分子驱动因素以及肿瘤免疫微环境（TIME），并在此基础上构建了与预后关联的GBC多组学分型框架，为后续转化研究提供依据与数据支撑。
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胆囊癌(GBC)是胆道系统最常见的恶性肿瘤。腺癌(AC)是GBC的主要亚型，同时也存在腺鳞癌和神经内分泌(NE)肿瘤等罕见亚型。慢性炎症通常由胆石症和胰胆管畸形引起，与胆囊癌密切相关。2022年，全球报告的新增病例估计为122，491例，死亡人数为89，000例。因此，GBC的病死率非常高。$ W# ~' R% r" }+ q" g3 A+ O& [; m
在目前的临床实践中，只有一小部分早期患者可以通过手术治愈。对于大多数晚期病例，吉西他滨和顺铂的durvalumab仍然是标准方案，五年生存率低于10%。在临床试验中研究了几种ErbB导向的治疗方法和免疫检查点阻断，证明晚期GBC的生存率略有提高。然而，转化突破对于实现更有临床意义的结果仍然是必不可少的，这使得深入探索GBC的分子特征对于促进临床管理不可或缺。- H" E  h% b: M# W6 h2 V6 B
GBC的基因组测序揭示了包括TP53、ErbB2/ErbB3和KRAS突变在内的复发性基因改变；MDM2和ErbB2扩增；和CDKN2A/B缺失。目前只有有限数量的基因组事件可以指导GBC患者的个性化治疗。之前的研究已经建立了基于RNA测序(RNA-seq)的GBC分子亚型。然而，由于单组学技术和小样本量的限制，这些亚型的临床意义仍然有限。" w- N) h" m# U, a) F

& Q" i; X. h# U+ w0 ^3 u4 k* _6 Z机理模式图（图源自Cancer Cell）, g2 _& }/ F9 |
大量研究强调了蛋白质和mRNA表达水平之间的有限相关性。最近，广泛探索治疗性蛋白质靶点、磷酸化位点和新抗原的蛋白质组学研究为其他癌症和疾病的治疗策略的开发提供了宝贵的见解。因此，高质量GBC样本的大规模蛋白质组学分析可以极大地促进机制理解和临床转化。
4 T$ F' H: ?3 y在这里，研究人员对195名中国GBC患者进行了整合的基因组、转录组、蛋白质组和磷酸化蛋白质组分析。通过整合多组学数据和实验验证，阐明了不同临床病理表型的分子基础，表征了肿瘤免疫微环境(TIME ),并建立了临床相关的多组学分类系统。总的来说，该研究构建了胆囊癌的蛋白质基因组学图谱，为理解其生物学机制和指导未来转化研究提供了重要基础。
, ?0 U7 G& {7 y2 |# m/ `9 F复旦大学附属中山医院樊嘉院士、中国科学院上海药物研究所周虎研究员、中国科学院分子细胞科学卓越创新中心高大明研究员、复旦大学附属中山医院高强教授、上海交通大学医学院附属新华医院龚伟教授为本文的通讯作者。海军军医大学东方肝胆外科医院冯飞灵教授、西安交通大学第一附属医院张谞丰教授、海军军医大学国家肝癌科学中心陈磊研究员、上海交通大学医学院附属仁济医院李茂岚教授、复旦大学生物医学研究院徐彦辉研究员和中国科学院广州生物医药与健康研究院王茜敏研究员为本研究提供了重要支持。付子乐博士、宋远丽博士、刘分博士、陈律博士和蔡尚立博士为本文的共同第一作者。本研究得到了科技部国家重点研发计划、国家自然科学基金、上海市科学技术委员会等项目的资助。
7 t, e" |$ m4 E! H4 V% E原文链接：6 W4 D; w3 R( S( m3 V5 A
https://www.cell.com/cancer-cell/fulltext/S1535-6108(25)00548-3
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