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Cell论文:人造无内含子酵母颠覆基因表达常识,开辟进化研究新天地% a3 U1 z8 Z% I$ z5 l
来源:生物谷原创 2026-07-29 14:16* G# d% _5 q t. ]
这项研究不仅改写了教科书中的“剪接体必备”教条,更以其“减法”策略为基因组工程、精准医学和进化生物学打开了充满想象空间的大门。
- K J& P& X1 I4 ]& Q在真核生物(包括人类、酵母、植物等)的基因中,编码蛋白质的序列(外显子)常常被非编码的“内含子”打断。基因转录产生的前体mRNA包含这些内含子,必须通过一个称为剪接体的巨大核糖核蛋白复合体将其精确切除,并将外显子连接起来,才能形成成熟的mRNA并翻译为蛋白质。剪接体由5种snRNA(U1、U2、U4、U5、U6)和上百种蛋白质组成,其组装和催化过程高度动态且耗能。) B9 g4 i' ]' ^! b5 ?0 w
长期以来,科学家认为剪接体是真核生物生存不可或缺的机器,因为绝大多数真核基因都含有内含子。然而,内含子是否在本质上“必需”?还是仅仅由于进化历史而难以消除?一项新的研究给出了颠覆性的答案。
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通过利用合成单染色体酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)中不依赖Spo11的减数分裂,研究团队成功删除了所有300个剪接体内含子,获得了无内含子菌株SYNE27α。全基因组测序证实了精确切除。出乎意料的是,剪接体组分(全部5种小核RNA(snRNAs)、Prp8、Prp9、Prp19、Yhc1和Luc7)不再为生存所必需——这表明真核细胞可以完全独立于剪接体功能而存活。U3小核仁RNA(snoRNA)的剪接绕过了Yhc1、Luc7、Prp9和Prp19的需求,揭示了其与前体mRNA剪接在机制上的差异。累积的内含子丢失通过核糖体调控紊乱导致生长减慢,但SYNE27α仍保持遗传稳定性。在二倍体中,这种适应性代价完全呈隐性,证实内含子丢失是主要的驱动因素。这些发现确立了一种无内含子、不依赖剪接体的真核生物,解决了剪接体功能必需性的核心问题,并为基因组进化的极简系统研究铺平了道路。
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) r; H& w' H4 n$ T酿酒酵母是研究真核生物的模式生物,其基因组中仅含约300个内含子(远少于人类的上百万个)。即便如此,完全消除它们也被认为极难实现,因为内含子可能参与基因调控、非编码RNA加工等过程。本研究通过巧妙的遗传策略(利用人工合成酵母和特殊减数分裂)首次做到了这一点,证明内含子并非生存“必需品”。既然无内含子酵母无需剪接体便可存活,说明剪接体的唯一“绝对”功能就是剪接内含子。这结束了关于剪接体是否还有其它生存必需功能的长期争论。$ V% U0 o' t: \& q
有趣的是,U3 snoRNA(参与核糖体RNA加工的分子)的剪接对某些剪接体蛋白(如Yhc1、Luc7等)不敏感,说明不同类型的RNA剪接可能采用不同的“备选”机制,这为剪接体进化和功能分化提供了线索。
) G5 b6 {8 X/ }! @% }虽然无内含子酵母可以存活,但生长较慢,且这种缺陷在二倍体中不表现(隐性),表明内含子的存在可能与细胞“健康”有关,但其丢失带来的负面影响可以被掩盖,这也为进化生物学中的“遗传负荷”理论提供了实验支持。! G. h! K3 |: H" o ~
总之,这项研究不仅改写了教科书中的“剪接体必备”教条,更以其“减法”策略为基因组工程、精准医学和进化生物学打开了充满想象空间的大门。(生物谷Bioon.com)
' v' _8 ?+ q+ y参考文献:
) {8 w; a. E, w9 t# \Xin Man et al, A spliceosome-independent eukaryote generated by complete intron removal, Cell (2026). DOI: 10.1016/j.cell.2026.05.033.
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