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trizol法同时提取RNA/DNA:方法如下6 H* Z' y/ _- j5 J$ B( h
先提取RNA8 e7 v( V( o( x( r8 ?9 C
每使用1ml Trizol加0.2ml氯仿,盖好管盖,剧烈震荡15s,室温放置3min。& E% Z; F: \. X# W0 D# c2 x. B
如不能涡旋混匀,可手动颠倒混匀2min代替。
4 [) ~+ m0 u+ c6 n' E1. 4 ℃ 10 000rpm离心10-15min,样品会分成三层:黄色的有机相,中间层和上层无色的水相,RNA主要在水相中,把水相(约600ul,约为所用Trizol试剂的60%)转移到新管中。(如要分离蛋白质和DNA,可保留黄色的有机相)
0 b7 `* r( p0 d; u2. 在得到的水相溶液中加入等体积的异丙醇,混匀,-20℃ 放置20-30min。' f) \" V- ?$ b
植物或动物组织RNA提取中,容易沉淀出大量的蛋白等污染物,导致电泳检测时看不到RNA。可以按以下步骤操作减轻污染:在上清中加入1/2体积的异丙醇,1/2体积的RNA助沉剂,然后进行以下操作。
9 x d# j' e$ t V2 B3. 4 ℃ 10 000rpm离心10min,去上清。
) s" M) R# g% }2 z9 u2 [7 y/ S$ ?. E 离心前RNA沉淀经常是看不见的,离心后在管侧和管底形成胶状沉淀。/ @4 W% f7 t+ R9 n' P% }- ~
4. 加入1ml 75%乙醇(DEPC水处理过的水配制)洗涤沉淀。每使用1ml Trizol至少加1ml乙醇。) J# }6 d% {+ U' s& m; A
5. 4 ℃ 10 000rpm离心2min,弃上清;短暂快速离心,用移液器小心吸弃上清,注意不要吸弃沉淀。4 L3 g# S+ e( J1 t- ^9 @
6. 室温放置晾干(不要晾得过干,RNA完全干燥后会很难溶解,大约晾干2-3min左右即可)。加入适量DEPC水(根据实验需要,可加30-100ul水)或0.5%SDS,用枪头吸打几次,充分溶解RNA。如RNA用于酶切反应,勿使用SDS溶液。RNA也可用100℅ 的去离子甲酰胺溶解,-70℃保存。
: b4 N1 b3 P: ^2 A. R7 l) ]+ y0 u/ b: @( f0 H* l
DNA的分离
4 |. r' P5 Y' ]! `准备试剂:乙醇,0.1M柠檬酸钠(含10%乙醇),75%乙醇,8mM NaOH
8 I0 S Y3 L7 ^( ?5 H操作步骤:# L$ f+ F9 {) V" E T4 F
1. 样品加氯仿分层后,移去上层水相,用乙醇沉淀中间层和有机相中的DNA。每使用1ml TRIzol加0.3ml无水乙醇混匀,室温放置3min,2~8℃不超过2000×g离心5分钟。 " {" B/ i/ l N& T( Y2 z
2. 移去上清,(如需分离蛋白质,可保留)用含10%乙醇的0.1M柠檬酸钠洗涤DNA沉淀。每1ml TRIzol加入1ml柠檬酸钠,室温放置30min,2~8℃2000×g离心5min,弃上清,重复一次。 ; W! c J5 C3 S9 y) H* i5 R' ?
3. 用75%乙醇再洗一遍DNA沉淀,每用1ml TRIzol加入1.5~2 ml75%乙醇,室温放置10~20min(不时颠倒混合)2~8℃2000×g离心5分钟, 弃上清。 : l6 N( w. m* j, F
4. 室温放置晾干DNA 5~15分钟,用8mM NaOH溶解DNA。
' t8 g; ~0 ~* P, [' ] 从50~70mg组织或107细胞中分离的DNA溶于300~600μl 8mM NaOH,DNA的浓度通常为0.2~0.3μg/μl。提取的DNA沉淀不易溶于水和Tris缓冲液中,建议用弱碱溶解,8mM NaOH的pH值为9,溶解DNA后可用TE,HEPES调节pH。从某些样品(尤其是组织)中提取的DNA中可能包含一些胶状不溶物可>12000×g离心10分钟除去。
7 O2 k6 y `) m( QDNA的定量:* H6 b) q, x& A
取一份溶于8mM NaOH的DNA加水测A260值。一单位A260值相当于50μg/ml双链DNA。根据DNA产量可估计细胞数,人、大鼠、小鼠1×106二倍体细胞含DNA的量分别为7.1μg,6.5μg,5.8μg。& H' ^/ ~4 y) r' V& @5 e
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