有谁做过RNA-seq（DGE）。

hcluo

有哪位大侠做过RNA-seq（DGE），这种测序的结果是不是就不需要生物学重复了，我知道芯片是需要生物学重复的。做RNA-seq（DGE）和芯片，哪个更有优势一些，另外费用方面也得考虑。十分感谢！

xiaoheilong

RNA-seq一般不需要重复，无论从精度还是深度都优于micarray,但费用较microarray高，目前一般一个样要3-5万，芯片一张5000左右（2*5000=10000），现在又许多测序方面的综述，可以参考http://www.nature.com/subject/nextgenseq

hcluo

芯片一般不是需要3个重复吗（3*5000）？另外，现在有一种DGE的RNA-seq（只测表达的mRNA），测序的深度不是很深，据说只要1万1个样本。