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hndxws

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楼主

发表于 2011-5-12 10:01 |只看该作者 |倒序浏览 |打印

我有个问题，如果某个shRNA的干扰效率不错，那么靶向相同序列的siRNA的干扰效果怎样呢？两者会不会有差别呢？我现在有了shRNA 的序列，因为这个都是数据库公布的，但是好像没看到siRNA的数据库，所以想借用shRNA的数据库来合成siRNA，不知会不会有什么问题。有经验的同仁们给点建议。

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沙发

发表于 2011-5-16 15:01 |只看该作者

shRNA理论上说是要比siRNA作用时间长，siRNA作为小分子，通过中间loop折叠后才会成为shRNA，其实干扰效果是一样的，shRNA最后也能通过与沉默复合物结合，形成siRNA 产生作用的，如果知道shRNA或是siRNA序列，正推反推都可以获得相对应的序列！不会有问题的！

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jiays

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藤椅

发表于 2011-5-16 15:48 |只看该作者

理论上干扰效果抑制，但是实际中并不统一

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sarah19860420

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板凳

发表于 2011-11-30 00:42 |只看该作者

回复 hndxws 的帖子# O7 a* h/ z/ ~7 [: O: x) d

想问下在哪里可以查到SHRNA的数据库

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sarah19860420

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报纸

发表于 2011-12-1 00:05 |只看该作者

回复 hndxws 的帖子

http://www.proteinlounge.com/Default.aspx这个网址有一siRNA数据库。请楼主把你的shRNA数据库提供一下吧。

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hndxws

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金话筒优秀会员

地板

发表于 2011-12-1 22:00 |只看该作者

这是几个大公司合作完成的，主要是sigma，序列可以在sigma上搜到。每个序列都有相应的干扰效率

shRNA.rar

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feynmanzzx

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7楼

发表于 2013-3-28 21:25 |只看该作者

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