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楼主: gh2010
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[请教] RNA提取出来了,2次2种方法,但电泳都没有条带,抓狂~~   [复制链接]

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发表于 2011-10-10 18:48 |只看该作者
你的说法应该是RNA降解了,一点条带没有了  含蛋白也会很低,但一般很难出现1.45的   有蛋白污染  电泳会看到条带的
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发表于 2011-10-11 00:31 |只看该作者
我一般使用Trizol裂解收集RNA,提取的步骤也没什么特殊就是按照说明书上的protocol来做的,测浓度最好是在0.3-0.8ug/ul比较好,OD260/OD280最好是在2.0附近比较纯。
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发表于 2011-10-12 01:56 |只看该作者
RNA的浓度是多少?single strand本来就不易染色,要150ng以上才必较明显* f7 i# g6 C6 j) I
而且你的260/280及260/230都不好,我们实验室就要求260/280要1.9-2.0, 260/230要2.0以上( ~2 k; |# S2 V" {* I& Y
最大的问题应该是你的样本很少,就算RNA degradation也会有残留; m1 y5 M$ b' Y
一点意见供你参考
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发表于 2011-10-12 13:08 |只看该作者
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是不是RNA酶污染了,而且nanodrop 的数据有时候是不太准确。
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发表于 2011-10-13 01:21 |只看该作者
凭个人经验,估计是降解了,加完氯仿,离心取上清的时候千万不能贪多,否则蛋白层会污染水相的。
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发表于 2011-10-16 18:05 |只看该作者
兄弟,你细胞果真忒少点儿了,,,trizol按100ul量来加,异丙醇注意混匀,,,最后用不超过5ul去溶解,,,用1ul跑胶,0.5ul测浓度,,,有东西并符合条件就赶紧RT了,,太少了细胞
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发表于 2011-10-18 11:30 |只看该作者
细胞量太少了吧?你的260:280的值太低,看样子肯定有蛋白污染。你也没有给出浓度值,所以不知道你最后跑胶用的多大RNA量,不好评价是不是RNA太少。建议你下次RNA电泳前槽子里的水都重新换过,可以电压稍高一点,时间跑短一点,这样也可以降低RNA在跑胶过程中降解的可能性。
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发表于 2011-10-21 02:47 |只看该作者
如果连rRNA的条带都没有,或者弥散一片,应该是降解了。注意溶剂、离心管是不是RNase Free的。RNase非常稳定啊
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发表于 2011-10-21 11:10 |只看该作者
细胞数量好像有点少,试剂盒提取的话说明书上应该有细胞数的说明的。你提出来的RNA浓度是多少?A260/A280有点低,可能是蛋白质污染了,可能有RNase污染,RNA降解了。操作时要注意能少说话尽量少说,最好戴上口罩。另外要确保用的东西都是RNase free的。
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发表于 2011-10-21 13:48 |只看该作者
我也觉得讲解的可能性比较大
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