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求助一个问题(简单的酶切问题) [复制链接]

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包包
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楼主
发表于 2012-7-11 23:12 |只看该作者 |倒序浏览 |打印
坛友们好,
9 I4 W7 `( I- q$ p请教大家一个问题,我做pcr产物酶切,但是总是且不完全,PCR产物长500bp ,HindIII酶切后应该是200bp+300bp,但是总有500bp的遗留,我找了酶的用量和pcr产物量,但是还是不行。而却我还确定,在500bp的HindIII位点没有SNP。请问大家是什么情况引起这个问题?谢谢啦
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金话筒 优秀会员

沙发
发表于 2012-7-12 08:24 |只看该作者
如果是部分切了,部分没有切开,那是酶的效率的问题吧?NEB的酶37度切1-3h好像很好啊,再说你也可以纯化了直接往后做连接、转化什么的 啊
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藤椅
发表于 2012-7-12 08:51 |只看该作者
你可以延长一下酶切时间,不知道你是哪个公司的酶 我们用Fermentas的快酶切四个小时 一般切的都很干净
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板凳
发表于 2012-7-12 09:04 |只看该作者
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延长酶切时间,找到合适的酶切温度
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优秀会员 金话筒 帅哥研究员

报纸
发表于 2012-7-12 09:30 |只看该作者
酶切不彻底应该是酶的问题吧,不过一般按照说明书来的话很少有问题,HindIII酶切3个小时应该足够了吧,你试着延长一下酶切的时间和改变一下温度再试试看吧。
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地板
发表于 2012-7-12 10:47 |只看该作者
适当加大酶量,延长酶切时间(如果时间长了没有星活性的话)
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优秀会员 金话筒

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发表于 2012-7-12 11:20 |只看该作者
过夜酶切应该没有问题
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发表于 2012-7-13 01:08 |只看该作者
坛友们,可能还还没论述详细,NEB,TAKARA 的都试过,时间2h 4h 过夜都是试过,回收量100-300ng 酶量0.5ul-2ul  20ul体系 温度37
( P5 q/ e$ v- v9 ]% I) x. V* B
5 b4 V& K9 i" k' D" b5 P; \但是就是不行
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