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[其他类别] Realtime结果异常是SYBR不好么? [复制链接]

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包包
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楼主
发表于 2012-12-20 17:00 |只看该作者 |倒序浏览 |打印
这几次做的Realtime PCR实验,一开始用的是TAKARA公司的SYBR并以GADPH的引物实验,结果有Ct值是4或6的情况。但用了Bio-rad公司的试剂再重复就正常。如果用的是Actin B引物那不管用哪个公司的SYBR都有Ct值异常现象。请问大神是啥原因?
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沙发
发表于 2012-12-21 09:28 |只看该作者
回复 wuzhoulingxiao 的帖子, A7 {8 U* E2 I+ k+ I
0 {- _0 A/ [9 b% Q) u
你的异常是指Ct过早吗?是不是引物的问题呀,多做几套引物的比较一下呢?或者把模板稀释下
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藤椅
发表于 2012-12-21 16:17 |只看该作者
回复 86964109 的帖子& ?& f! }; [9 t+ Q) ]4 |

$ s: i7 H/ ~; ?模板正常,因为每个样都做了2个重复,一个正常,一个异常。
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板凳
发表于 2012-12-24 08:14 |只看该作者
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本帖最后由 86964109 于 2012-12-24 08:15 编辑
" B0 S9 l4 X, i3 z# h
  ?( R4 M2 C( c1 D8 l! D回复 wuzhoulingxiao 的帖子
2 Q# c% a3 M3 y; \# o9 d9 |5 ?; ^7 L- L: F0 H% a! ]+ }# o) p
你的模板是怎么加的?1μl的加还是稀释5倍后再加5μl?PCR重复性不好有可能是模板体积小,分布不均匀所致,不知道你的是不是这个原因。还有你的SYBR试剂都多久了,如果是新的应该没有太大问题才对,除非被污染了;另外仪器有校正过么?9 h2 H* T8 v3 Q5 Q
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报纸
发表于 2012-12-24 11:51 |只看该作者
回复 86964109 的帖子
! C8 {2 s1 e* l+ {& @5 W; P8 q1 M2 ^8 h
我的模板是按经验稀释20倍的,加1ul。SYBR是新到的TAKARA的,而且新开封,没有污染。
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地板
发表于 2012-12-24 15:15 |只看该作者
回复 wuzhoulingxiao 的帖子
$ P, s0 N- x' {# `% `! V  [
4 @$ k5 j* G( k8 S& d* R我不知道这种操作对你们来说是否是已经成熟的,不过仅就我的经历来说,即使我们拿2μg质量很好RNA逆转录出来的模板,直接稀释20倍取1μl去做PCR,结果也多是很不稳定的,模板中小分子团混的是否均匀,移液器的误差等等...
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发表于 2012-12-25 16:08 |只看该作者
可以尝试不稀释试一试,也需要确认是不是仪器的问题,有的孔可能有问题
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发表于 2012-12-26 17:10 |只看该作者
个人觉得罗氏的染料比较好
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