H7N9禽流感病毒有何不同？

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SARS冠状病毒和H7N9禽流感病毒都会引起重症肺炎，为什么SARS在人与人之间快速传播，而没有发现H7N9禽流感在人与人之间传播？
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H7N9禽流感病毒：属正粘病毒科甲型流感病毒属。禽甲型流感病毒颗粒呈多形性，其中球形直径80～120nm，有囊膜。基因组为分节段单股负链RNA。依据其外膜血凝素(H)和神经氨酸酶(N)蛋白抗原性不同，目前可分为16个H亚型(H1～H16)和9个N亚型(N1～N9)。禽甲型流感病毒除感染禽外，还可感染人、猪、马、水貂和海洋哺乳动物。可感染人的禽流感病毒亚型为H5N1、H9N2、H7N7、H7N2、H7N3，此次报道的为人感染H7N9禽流感病毒。该病毒为新型重配病毒，其内部基因来自于H9N2禽流感病毒。
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传播途径：经呼吸道传播，也可通过密切接触感染的禽类分泌物或排泄物等被感染，直接接触病毒也可被感染。现尚无人与人之间传播的确切证据。$ E6 N7 ]. Y3 x- u2 o; Y

' Y$ r( M8 Q; y% K/ H7 ^4 ?/ _, u临床症状：患者一般表现为流感样症状，如发热，咳嗽，少痰，可伴有头痛、肌肉酸痛和全身不适。重症患者病情发展迅速，表现为重症肺炎，体温大多持续在39℃以上，出现呼吸困难，可伴有咯血痰；可快速进展出现急性呼吸窘迫综合征、纵隔气肿、脓毒症、休克、意识障碍及急性肾损伤等。 3 ~+ H# F2 f& m* O; T8 r1 Y5 X

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7 y2 C8 j4 t5 k$ QSARS冠状病毒：其核酸为非节段单链（+）RNA，长27-31kd，是RNA病毒中最长的RNA核酸链，具有正链RNA特有的重要结构特征：即RNA链5’端有甲基化“帽子”，3’端有PolyA “尾巴”结构。6 B- z( g3 \8 ]6 i) {6 n4 T7 c
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传播途径：主要通过短距离飞沫、接触患者呼吸道分泌物及密切接触传播，并通过空气飞沫传播，感染高峰在秋冬和早春。4 _4 h" E  e/ ^- ^/ M
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临床症状：临床上以发热、头痛、肌肉酸痛、乏力、干咳少痰为特征，严重者出现气促或呼吸窘迫。 5 Z, M& _+ Y' K! Y0 L2 ]& G9 O* u
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学习了，非常棒的内容。

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农业部：不排除更大范围检出H7N9

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2013年4月6日H7N9疫情分布

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●H7N9病毒在活禽市场检出率最高，在养禽场尚未检出，目前主要集中在上海，但不排除在更大范围内检出的可能性。——农业部
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●H7N9是一个新的病毒，目前怀疑病源是鸟类，比如鸽子。目前没有人传染人的证据，但我们要密切关注。——世卫组织驻华代表蓝睿明
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截至昨晚，上海新确诊2例人感染H7N9禽流感病例，安徽新确诊1例。至此，全国共报告21例确诊病例，其中死亡6人。
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3 n# U  q- S* [. ?9 k/ @/ t目前，全国共报告的21例确诊病例分布于上海(10例，死亡4例)、江苏(6例)、浙江(3例，死亡2例)、安徽(2例)4省市。报告的确诊病例间未发现流行病学联系。所有病例的密切接触者均已采取医学观察措施，未发现异常。
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上海市卫计委介绍，截至昨天（4月7日）下午，疾控部门累计共对10例确诊病例的194名密切接触者开展了医学观察。所有密切接触者中，累计出现发热伴咳嗽或咽痛等症状的有2人，目前2人在上海市公共卫生临床中心治疗，实验室检测均已排除H7N9禽流感。
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昨天下午，国家卫生和计划生育委员会相关负责人表示，尚未发现疫情人传人的情况。& j$ W% l. ]4 }$ ]

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SARS疫情分布

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[p=25, null, center]新H7N9甲型禽流感的起源和基因组进化

[p=25, null, center]贺建奎，宁绿文，童寅

[p=25, null, center]南方科技大学生物系

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[p=25, null, left]前言/摘要

[p=25, null, left]新H7N9甲型禽流感自4月1日国际卫生组织正式公布以来，截止到4月7日，中国已经有18例确诊。大部分确诊的病例的病情严重，6人已确认死亡。目前尚未发现人与人之间传播，并且确诊的案例彼此并无关联。然而，我们对这个新的病毒的许多方面都不了解，包括它的传播性，致病性和起源，因此，导致了我们在判断这个病毒是否会造成瘟疫时存在不确定性，以及我们的公共健康管理部门应该如何正确的应对。本文报道了我们对新H7N9甲型禽流感的起源和基因组进化的研究，初步的结果表明这个病毒是一个全新的病毒，是由三个病毒重组后产生的(H9N2, H11N9,和H7家族)。同时我们也发现这个病毒已经开始产生新的变异。

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[p=25, null, left]研究结果

! a( d* B9 E/ k$ S& G[p=25, null, left]一，一个全新的病毒

[p=25, null, left]中国杭州疾控中心和WHO中国流感中心共采集，分析了4个新H7N9甲型禽流感的基因组，并在GISAID数据库上公布。我们用这4个基因组以及1193个已知的流感各亚型的基因组，做了一个全面的系统生成树和进化分析。我们的结果表明，在新H7N9甲型禽流感的8个基因中，表面血凝素haemagglutinin蛋白基因来自于H7亚型病毒;神经氨酸酶neuraminidase基因来自N9家族禽流感，目前尚不能断定是H11N9还是H7N9; 其余6个内核基因都来自H9N2。也就是说新H7N9甲型禽流感是由这三个病毒的基因重组产生的一个全新的基因。（见图一）

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$ \! f: X, \5 n' r) _[p=25, null, left]二，病毒开始变异

[p=25, null, left]我们用系统生成树方法研究了4株新H7N9甲型禽流感的表面血凝素haemagglutinin蛋白基因，发现有一株有明显的相对其它三株的变异（见图二）。我们在haemagglutinin全长560个氨基酸中，发现了A/Shanghai/1/2013病毒有9个变异。这说明新H7N9甲型禽流感有很强的变异能力。由于表面血凝素haemagglutinin蛋白是病毒用来吸附感染动物细胞的，它的高变异能力可能导致它传播感染能力和治病能力的变化，这需要引起我们的特别注意。

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[p=25, null, left]三，新H7N9甲型禽流感不是由经典的H7N9进化而来

[p=25, null, left]H7N9早在1999年就已经开始在文献中报道了，我们将此前报道和发现过的H7N9称之为经典H7N9. 我们将2013新H7N9以及经典H7N9等做了系统生成树研究，发现新的H7N9和经典H7N9的相似性远不及H9N2, H11N9和H7N3.这说明2013新H7N9不是从经典H7N9进化而来。

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[p=25, null, left]四，基因重组的地点可能在江浙一带

[p=25, null, left]我们通过序列比对和blast的结果发现，与新H7N9禽流感病毒最接近的病毒多为江浙地区的家禽和野禽。这个此次人感染的地点重合。尤其是H9N2在东亚地区已经传播多年。因此我们推测本次基因重组的地点可能在江浙一带。: O+ f0 ]9 K" M0 K* L( O$ V

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[p=25, null, left]注一：本文的英文原文已经于2013年4月7日在arXiv.org上发布,题目” Origins and evolutionary genomics of the novel 2013 avian-originH7N9 influenza A virus in China: Early findings”。本文为英文原稿中的部分内容。

[p=25, null, left]注二：本文原作已经提交至杂志，版权所有。

[p=25, null, left]注三：联系人:贺建奎， email: he.jk@sustc.edu.cn, 电话：0755-86245720

[p=25, null, left]注四：本文为基础研究，只可作为专家研究交流之用，不可作为医学，临床用途。流感疫情，预防，治疗等方面的信息请以国家疾病控制中心为准。

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+ _, H6 x0 j! u) L[p=25, null, left]实时新H7N9甲型禽流感Google地图在：http://goo.gl/maps/ZsVW8

1 @9 {2 S& V5 ^7 p5 f" y[p=25, null, left]致谢：我们非常感谢杭州CDC和WHO中国流感中心提供的基因序列。

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本文引用地址：http://blog.sciencenet.cn/blog-514529-678002.html

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专家详解H7N9病毒和SARS病毒三大不同

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初春时节遭遇H7N9禽流感来袭，人们不禁会感到内心的丝丝恐慌。这种情绪很大程度上来源于10年前也是在这样的季节，人们对于SARS抹不去的记忆。
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: Q- Y* z0 {3 u“H7N9病毒和SARS病毒有怎样的区别？”带着这个问题，本报记者专门采访了中国疾控中心病毒病预防控制研究所病毒病应急技术中心主任谭文杰研究员。
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2 _( w5 {% l+ X; Q# P" z“我们对流感病毒的认识，比对SARS病毒认识的历史要长得多，这是两个完全不同的病毒。”谭文杰提醒公众“不必过分恐慌”。他将H7N9病毒和SARS病毒的不同之处，归结为三点——“分类不同”、“宿主不同”、“传播能力和变异能力不同”。/ p  R, K6 N' Z; w' v  @
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区别之一：“分类不同”
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6 y6 I9 Q) ^9 w7 ~, K“首先是分类不一样。SARS病毒是一种新型冠状病毒，不是流感病毒；而H7N9病毒是流感病毒的一种。”$ l% c! U- F% o9 C# g! B" V
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谭文杰说，流感病毒有两个蛋白决定它的特性，一个叫水凝素蛋白，一个叫神经氨酸酶蛋白，整个流感病毒的种类，水凝素蛋白目前发现有16个，神经氨酸酶蛋白有9个，16个和9个，像搓麻将一样一洗牌的话，可以洗出很多种花样来。所以，理论上来说流感病毒有140多种花样，现在已经确定存在的有130多种，H7N9病毒就是其中的一种。+ m) V* p& u) ?; ~# J' l; x- m

5 y% S- _- V: l9 Q/ R% z% ]区别之二：“宿主不同”
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# m1 f, V6 |' V7 |; y“其次，两者的宿主不一样。”谭文杰解释道，H7N9病毒和SARS病毒离得很远，两者的祖先不一样。流感病毒的主要动物宿主是禽类，而从禽到人，可能经过了一些中间宿主，比如通过猪、马来传给人，也可能是禽直接传到人。
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8 G- I1 l. X; z“对于SARS这样的冠状病毒，现在科学家认为其宿主很可能是蝙蝠，但蝙蝠又怎么传给人的？有研究人员分析，SARS病毒可能是通过蝙蝠传给果子狸，然后果子狸再传给人。但是目前还不能完全就断定，果子狸或者其他家畜就是它的中间宿主。所以，关于SARS病毒的很多问题，目前科学上还不能给出明确的答案。而对于流感病毒的认识，我们人类已经比较清楚了。”
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区别之三：“传播能力和变异能力不同”0 E  E/ k& a( q7 ?4 C6 u) B% V( S

4 E8 u( c/ K5 K2 C7 P“第三个不同，就是H7N9病毒和SARS病毒的传播能力和变异能力不同。”谭文杰告诉记者，虽然两者都是呼吸道感染病毒，都是通过飞沫和直接接触来传播，但SARS的传播能力比H7N9要强得多。然而，由于日常生活中禽和人接触的机会，远比蝙蝠和人接触的机会要多，所以流感病毒发生变异、不断冒出“新东西”的机会也比SARS多，所以流感年年有，流感年年“新”。
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- U$ S6 q* H  ]0 f$ a5 U那么，SARS病毒以后有没有可能重新回来呢？“这种可能性不能排除。”但谭文杰同时又表示，我国目前的科研能力、经济水平、健康教育水平，和十年前相比，已经不能同日而语。疾控部门对SARS病毒的研究、包括检测手段等各个方面，都有所储备。
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2 I  P8 }4 n/ O; X$ j# x( U. T“大家完全没有必要恐慌。即使来了，我们也能很快‘捕捉’到它！”谭文杰说。% g& O8 A; Q; s/ _8 b
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作者：胡其峰 来源：光明日报 发布时间：2013-4-11
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H7N9病毒能引起人流感大流行吗？

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本文引用地址：http://blog.sciencenet.cn/blog-347754-685973.html
0 C* Q+ r7 b, N4 E. G- ?% E1 f许多流感专家都认为，包括H5N1和H7N9在内的禽流感病毒能引起人流感大流行的可能性非常小。# o4 {* j2 s+ T
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这种可能性迄今一直仅仅只是某些专家的猜测而不是事实：迄今为止，人类历史上从未发生过禽流感直接引发人流感大流行的事实。
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: j+ J! ^1 p3 o8 h一次严重的流感大流行，至少必须同时满足三个条件：
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2 P6 y' k+ U$ {# o1）　病毒具有易于在人与人之间传播的能力；
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5 P& F4 f6 a! I% z" f! g/ V3 Z2）　病毒保持对人有很高的致死率；; r# w3 H1 V1 @- m  Z( X! M0 x& E
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3）　人群普遍缺乏对该病毒的免疫力。
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: h$ y- ?( `/ ~, \* }. N而要同时满足这三个条件是很不容易的，所以严重的流感大流行发生的概率是很低的，说它“千年一遇”是有道理的。" n$ r) {8 o" q# Y
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－1 W% n" d4 I. o7 T& d1 X2 t

& C: E2 G+ \8 E推测禽流感病毒引发人流感大流行的概率很小的若干依据：
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1.            流感病毒类型（亚型）的限制：- D3 t: g. J! N  Y4 X0 r6 m6 v7 B
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历史上只有H1、H2、H3亚型的流感病毒曾引起过人流感的大流行，其他如H5与H7亚型则从来没有。
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" N' E" U" Z! L$ k% X/ {2.            宿主的物种屏障：/ N+ C- i8 r" n# t- F; \* O
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流感病毒要跨越物种界限也受到严格限制。流感病毒如未发生人（或猪）病毒与其他动物病毒间的交叉重组，则很难突破宿主的物种屏障，变得能感染人类，更不大可能变得能在人与人之间持续传播。
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# e- u3 }7 S) i) {% _. m0 |来源于其他动物的病毒与人（或猪）病毒基因的交叉重组可能是引发人流感大流行的前提条件。
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2 z: Y- _; S1 k只发生了来源于同类动物宿主的病毒间的重组，或只发生了部分基因上的部分位点的突变，则通常只可能引起新的季节性流感的流行，而不大可能引发新的大流行流感的流行。
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今年的H7N9病毒的全部基因都来源于禽类病毒，不含人源病毒的基因，可推测其能引发人流感大流行的概率较低。1 a4 A/ H6 [- t

* w, w1 ~+ x2 _# J- L' [3.          人流感的大流行必须先有猪作为中间宿主：
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  k% `. ?  B  a* e近100年来人类经历的4次流感大流行（1918年、1957年、1968年和2009年的流感），都是由直接来源于猪的流感病毒引起的。猪病毒较容易实现人际间传播。
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" v  L3 D- f( s* K( v/ T禽流感病毒通常不能直接感染人。科学界迄今从未证明禽流感病毒能在人际间传播。在禽流感病毒跨越物种的界限达到感染人的进化过程中，猪常起重要的媒介作用。能引发人类大流行的病毒的直接源头通常只能是猪。- h0 |  [3 l; s4 x, P

7 T& d8 {1 q& [: q禽类与人类在生物学上是远亲，而猪和人是近亲（同属哺乳动物），所以猪身上的流感病毒和人身上的流感病毒更容易重组；禽流感病毒在猪体内多次传代后，可产生类似人流感病毒的特性。
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1 b* y( x- E4 a: s; x, C猪可以同时感染源于禽、人和猪三类动物的流感病毒，成为病毒的“混合器”和新流行毒株的“孵育器”。不同来源的流感病毒在猪体中可以发生重组，产生能感染更多动物的病毒。
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9 S& P; B! R/ O2 o; t8 [  v3 mH7N9病毒的全部基因都来源于禽类病毒，与猪和人都无关。这提示该病毒对人类的风险可能较低。  P+ e9 [6 W/ W7 O" z# Q: w
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4.          H7亚型病毒存在的时间已超过半个世纪，并不曾引发人流感大流行。
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H7亚型流感病毒最早是1956年从马身上分离出来的。H7N7病毒在马群中流行了很多年，直到上世纪70年代以后才慢慢趋于消失。此类病毒在今年以前几乎从未在人群中引发严重疾病。
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+ B, J6 [9 ~* l& y/ I目前距离人感染H7N9病毒的首个病例的发现已有两个多月的时间，目前仍停留在与H5N1病毒相似的零星散发状态，严重感染的人群平均年龄在60岁左右。至少两个月没有发现该病毒能稳定适应人体的事实，验证了宿主的物种屏障的强大作用。目前还没有令人信服的证据能够证明该病毒可以持续地在人与人之间传播。: x0 e& y1 K; O+ M
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5.          转换宿主后，病毒的毒力通常会降低。
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) u& w5 R7 T  F; K) r; U在不同的宿主中对病毒进行传代，是降低其对人类毒力的常用战略之一。为了选育出毒性较弱（减毒）的病毒，可以在非正常宿主细胞中或在非生理温度下繁殖病毒来实现。采用此项技术，有很大可能获得比亲代致病性更弱的减毒株。. E" {+ T! [4 d- O' x

2 R. w" a+ d" @1 z" g最近一年多以来，有关可在雪貂中传播的人造H5N1禽流感病毒的实验曾引发激烈争论。该项实验的结果恰好也证明，这些人造禽流感病毒在雪貂中的传播能力并不强，而且这些能通过空气传播的人造禽流感病毒对雪貂的致病性变得很低，致死率则变为0! 该实验同时还证明：早先曾暴露于季节性流感病毒的雪貂对H5N1病毒也有完全的免疫力。所以该人造病毒其实并不象原来预想的那么可怕。" n$ k7 o9 a9 z$ d

: w1 I8 A1 y# EH7N9禽流感病毒即使能实现在人与人之间的传播，如果它对人的致病力也显著降低（这种可能性相当大），则它对人类并不构成特别大的威胁。
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6.      　当代全球人口普遍对流感病毒有一定“群体免疫”力。
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- Q% A# E. s+ `1 U4 z( m5 P- c曾有些与世隔绝的人群原来从未接触过流感病毒，这些人群在接触流感病毒以后，会引发严重的疾病，造成极高的死亡率。. F2 b: {; k2 U9 |6 E% v" `

% @+ W  ~9 L" N反过来也可认为，现代几乎不再有与世隔绝的人群，世界各国的人群的交往越来越密切，几乎所有的成年人都多次自然感染过多种类型的流感病毒，所以都对流感病毒有一定的交叉抵抗力。虽然这种免疫力可能不足以防止患病，但很可能能降低病毒引起的死亡率。由于人群中这种“群体免疫”的存在，即使出现类似1918年H1N1的病毒，它也不大可能引发特别严重的后果。4 a- F& N3 _9 @+ M( Q2 c

4 i: P# u4 f4 n+ c7 .世界各国的流感疫苗和抗流感药物的技术平台已显著改善。& z  t, J" h# _* [
正如应对2009年的H1N1流感大流行所初步证明的，目前全球流感疫苗和抗流感药物的技术水平和生产能力都有长足的进步，必要时再进行更广泛的动员和协调，预计能基本满足应对流感大流行的需要，可有效扼制各种类型流感的发生和发展。
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结语
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! `+ b. h5 y# ^8 {& ~严重的流感大流行千年才一遇，发生的概率很低。但流感病毒是高度可变异的；在一种新的毒株实现全球传播所需的未来两年里，任何事情都可能发生。已发现H7N9病毒在对人的致病性和感染能力方面有许多令人担忧的特征。它是否会突破以往的流感病毒进化和流行的一般规律？对此不能掉以轻心，必须审慎地对待，并随时根据情况的变化而不断调整策略。; I6 C6 W. X" `+ l& x$ W
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面对未来流感大流行风险的不确定性，重要的是要保持一种平衡的心态。“在战略上要藐视敌人，在战术上要重视敌人”。人类对大流感的认识和防控能力与100年前相比已有质的飞跃。1918年流感大流行那样的悲剧不可能重演。人类积极、科学的应对完全可以将流感大流行的损失降到最小。
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