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miRNA样本表达量比较问题? [复制链接]

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包包
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金话筒 优秀版主

楼主
发表于 2013-12-2 15:56 |只看该作者 |倒序浏览 |打印
miRNA,大家都比较熟悉了,它的作用是与靶基因的3’UTR区域互补,从而达到调控靶基因表达。我现在有这样的疑惑:我做了两个样本的RNA-seq 和Microarray(既一个样本的处理前和处理后),得到了两个样本差异的miRNA和mRNA,现在我要联合分析这个结果,如果一个miRNA在处理后表达量下调,是不是说明这个miRNA在处理后的样本中产生功能,与靶基因3’UTR区域位点结合,导致这个靶基因表达下降。不知道我这样理解对不对?各位大虾多多指教!
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沙发
发表于 2016-9-28 08:33 |只看该作者
miRNA↓导致mRNA↓这个推导没问题,但前提是确定miRNA的结合位点,二级结构,只有调控机制确定,才能得出前面的推论。
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藤椅
发表于 2017-3-29 15:35 |只看该作者
得到了两个样本差异的miRNA和mRNA,现在我要联合分析这个结果,如果一个miRNA在处理后表达量下调,是不是说明这个miRNA在处理后的样本中产生功能。对于这句话,miRNA不一定只在处理后的样本中产生功能,可能在样本处理前也产生功能。只是样本处理的方式使某些miRNA的表达水平降低而已。
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