RIKEN（日本理化研究所）着手调查1月份发表在Nature上的STAP研究

incosc

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( l2 _; U* @4 D7 a《华尔街日报》报道：日本理化研究所于2014年2月13日，周四，开始着手调查小保方晴子等人1月份发表在《Nature》上的关于STAP细胞的研究成果。有学者发现，该文章中的一些图像似乎在不同部分被重复使用，并且把这个问题报告给了日本理化研究所官方。5 g* R8 M1 j9 H+ |6 _7 I, p
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原文作者：Alexander Martin       邮箱：alexander.martin@wsj.com! f) {8 c) W4 P' {1 L$ Y
A Japanese government-funded science institute said it has opened an investigation in response to questions raised about images in a groundbreaking study on stem cells.
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The Riken research institute said Monday that it began the investigation Thursday, following allegations of irregularities in images used in two papers published last month in the British journal Nature.
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The research, carried out by an international team led by Haruko Obokata of the Riken Center for Developmental Biology, found that mouse stem cells could be created by putting blood cells in a mild acid solution. If confirmed and extended to human cells, the technique could offer a safer and more ethical way to create stem cells and potentially help doctors use patient-specific stem cells in treating diseases. The Nature publication gathered global attention.
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Riken said the images in question include a photo of a placenta that the authors said was created from the new kind of stem cells, which they called STAP cells, for stimulus-triggered acquisition of pluripotency. On Internet forums such as PubPeer, a post-publication peer-review platform for scientists, some commenters said the same placenta image seemed to be used multiple times.  \* _1 L' q1 P- x
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Riken declined to offer more specifics regarding the assertions and said it started the investigation after an outside expert brought the matter to the institute's attention.
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7 r5 z# L$ D+ F: e7 |7 |8 E) F( QA spokeswoman for Riken said a team of internal and outside experts is looking into the matter. She said they believe the Obokata team's findings remain valid. She said Ms. Obokata and other team members have been questioned and the results of the inquiry should be announced next month.5 C' s; v! M9 L! \& c) E1 A

3 `( C/ I. n' K- V; {) qMs. Obokata couldn't be reached for comment.. W7 Y) P+ M$ j# @
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Ms. Obokata has received extensive publicity in Japan since the publication of her team's findings on Jan. 29.
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Stem cells are unspecified cells that can produce any of the specific cells in the body. Scientists hope that research on stem cells could lead to work on organ regeneration and treatments for conditions including blindness and diabetes.

hohu

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& i3 E$ L% E) x7 o  D( @) X2 o5 ~- J小保方使用的酸性溶液酸度橙汁相似，那么PH差不多3.5左右，而女性怀孕后生殖系统产生分泌物PH值也会从4.5降到3.5，一定程度环境存在相似性

incosc

; |6 r9 J4 z  d4 ?7 o7 q 呵呵，没有那么酸，PH 5.7 而已。 希望实验能被重复出来。# y+ D2 v" x" N8 X% a3 }" v  ]: H

  Z" e" T9 f: O6 Q  B+ p% Z原文：CD45-positive cells were sorted byFACS Aria (BDBiosciences), and treatedwith low-pHHBSS solution (pH5.7 for 25 min at 37 uC), ......

bioon

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引用科学网关于《酸诱导干细胞论文遭质疑》之评论：
# G9 ^9 \: y1 ]: F, K7 r! S该文章报道了大约20%的转化成功率，这是一个非常非常高的比例！而且后面的实验要用到大量的“逆转细胞”来继续运行，这绝不是“瞎蒙”一两回“逆转”就可凑乎着出文章的研究。; Q7 M2 F* b! T6 Q9 |3 q
   建议试图重复该研究的实验室在加了柠檬酸的“逆转培养体系”中，要严格防止氧应激和糖应激导致的“羰基应激”，因为毒性羰基物质（如丙二醛）会在表观遗传位点（赖氨酸）上捣乱，窒息甲基化位点，导致甲基化错乱，以至细胞失控......% D) E$ x% V, n  U. ]/ }1 g/ R

incosc

回复 bioon 的帖子9 n0 i6 P! z  u( I: @. Z# ~
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+ V, _, {( Z1 q1 r# g  |7 M% }
呵呵，bioon可以去科学网上回一下那个评论：
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* H* Y9 X/ k7 v请问楼主在哪里看到小保方晴子她们用柠檬酸了？* X$ l/ {- ^) J' t& ^6 g

bioon

回复 incosc 的帖子
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8 R& W) V3 c- u4 Y# \0 }, F: N抄来的评论，柠檬酸肯定不能用。
9 o; _4 j2 d/ n是不是小保方晴子还用了啥蛋白啊。
* d+ h  V8 u2 O) N$ V8 V“【iPS诱导新发现：组蛋白亚型TH2A/TH2B增强诱导效率】众多研究都在寻找增强iPS诱导效率的方法。而今研究者又有了全新的发现，两种在卵母细胞中高表达的组蛋白TH2A/TH2B可显著增强iPSC的诱导效率，在这两种组蛋白存在的条件下，单独表达klf4或是Oct3/4都能成功的制备出iPS细胞。”$ K1 v, d9 s- i5 F, D: M6 d
这所谓的物理因素会不会像磷酸化不同位点一样调控细胞状态？
4 H8 M$ \5 m" m0 G“[兼唱红脸黑脸:CamKII磷酸化GluA1不同位点调控LTD和LTP]红脸黑脸集于一身，CamKII便如此全能:强而短暂的刺激条件下，CamKII会磷酸化GluA1的S831位点参与LTP，但弱而久的刺激后，CamKII则磷酸化S567位点参与LTD。这真是黑白两道通吃啊 。”* t  M4 e" k- O7 A7 M& C' p6 S0 j' ~

incosc

回复 bioon 的帖子1 X! @( p/ h  ?. M5 l

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. n' _% {, h% g# u" J% Ybioon，俺知道你是转的别人的评论。呵呵。
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没看到那篇文章里特别说明用了什么蛋白。# b+ c1 s  C) A, |& t7 Q! y
明确说了使用了加入LIF和B27的DMEM/F12培养基，2-7天时间段要补充LIF。

bioon

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回复 incosc 的帖子
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0 h: V% B; N5 B2 B/ u5 WPaul在自己的博客上专门开了个贴，专门转发其他研究组的验证结果 [13]。截止到现在，共有10位学者或研究组给出自己的研究结果，其中重复不出来的8个，正在做的1个，能重复的出来的1个 [13]。截止到现在，共有10位学者或研究组给出自己的研究结果，其中重复不出来的8个，正在做的1个，能重复的出来的1个 [13]。并且能重复出来实验的学者Yoshiyuki Seki在2月13日写到："...In B27 + LIF medium, we can’t detect GFP-positive, while we can detect weak-GFP positive cells in serum + LIF. However, we observe many dead cells in GFP-positive clump." 也就是在B27 + LIF细胞里验证不了结果，但是在serum + LIF里可以检测到微弱的信号，但是还存在很多死细胞，所以这个重复的出来也是有限的重复。, G) |& ]' l. `8 u
Andres Bratt-Leal Jeanne Loring实验室的斯克里普斯研究所的9个月。 到目前为止Bratt-Leal说他没有成功,但是并没有放弃。 他尝试在人类细胞的方法,这将比老鼠更困难。 他说,该研究的作者也有可能在他们的报告中漏掉了一个至关重要的细节,无论是故意还是偶然。
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