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双向逆变式标记物验证流程

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优秀版主 金话筒 优秀会员

发表于 2014-10-5 19:18 |显示全部帖子
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双向逆变式标记物验证流程(Bidirectional inversion biomarker discovery process)是一种生物标记物临床验证策略。目前的临床生物标记物开发在高密度芯片平台和高通量测序技术的推动下,获得了前所未有的快速发展, 样本在100-1000左右的全基因组表达数据或全基因组甲基化芯片已经在一些实验室出现,用于开发临床诊断标记物,临床预后标记物,药物靶标开发等。高 通量及全基因组生物标记物数据有利于筛选最优的生物标记物组合以获得最佳的诊断或预测模型,大样本可以保证预测模型的稳健性和外推性。但是对于异质性较高 的肿瘤诊断及预后预测等,1000的样本量可能仍然不能保证各种模型的稳健性。需要将全基因组水平获得的生物标记物在更大的样本中进行验证。在这个过程 中,可以采取双向逆变式标记物验证流程,原理就是首先选择一批最有希望的生物标记物,在一批样本样本中进行测试,然后选择其中最优的一批标记物,在更大的 样本量中进行测试,依次类推,随着标记物数量的减少,样本量的不断增加逐渐使得由标记物组合构成的诊断或预后模型逐渐稳定,并逐渐接近临床应用标准。
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