大家一起补充ips的发展历程

lorey

大家好，本人是新人，刚学习了一个月的ips，自己总结了一些ips研究进展方面的知识，水平有限，大家一起补充啊！谢谢了！5 y, }. {3 M6 e3 ?" X
3 H, z! L; D. D& i: r* S
$ [3 |8 O) B! R. A
重编程的方法中，有一种是说将分化的体细胞和干细胞融合后，体细胞变成干细胞，由此可以推断，干细胞产生某些物质，使得体细胞能够重编程，为ips的产生提供了一定的依据（这纯粹是本人自己的推断，也不知道是否有道理，文献还没找）( I$ h% ]$ Z) _2 b
一、        第一次产生：
6 c" n7 ~- t) E9 L0 O4 J- s作者：Shinya Yamanaka's team at Kyoto University, Japan in 2006：
. t- v! p  R5 _) T因子：Oct-3/4, SOX2, c-Myc, and Klf4。
" ^1 r% |. d' A. B5 T载体：retroviruses
) ^9 \* t- G; O+ x7 B- ~0 U细胞类型：mouse fibroblasts
6 P, M. a) {# E' Y二、        技术改进：6 ]7 \  U; j* c
1、        因子数目：  I0 D  _) R1 J
三因子——去除c-myc    Generation of induced pluripotent stem cells without Myc from mouse and human fibroblasts# l& F% o0 s, ]6 {
二因子   文献：Induction of pluripotent stem cells from primary human fibroblasts with only Oct4 and Sox2（不知道是不是第一篇两因子的）  m( [: w: i' K
单因子   文献：人的Direct reprogramming of human neural stem cells by OCT4
4 ]/ e. @# w: W: l               鼠的Oct4-induced pluripotency in adult neural stem cells * a6 ?8 c: `# [6 v; d  m$ I
2、        加入小分子
* w& y( F( i8 }# t- |$ o0 t1 q4 J第一篇加入小分子的文献是：Induction of pluripotent stem cells by defined factors is greatly improved by small-molecule compounds
5 c# x- X" ^( @+ h7 E; m( G+ P3 Y同样加入小分子，减少因子：Induction of Pluripotent Stem Cells from Mouse Embryonic Fibroblasts by Oct4 and Klf4 with Small-Molecule Compounds8 O# V9 G$ y  [# Q: h2 s
3、        转导方法方面：
) G* t7 h6 ]4 m% E反转录病毒：最初的均是 yamanaka的第二篇文献：Generation of germline-competent induced pluripotent stem cells
, \5 p8 d! x3 w1 C% ~) V慢病毒：不是很确定，文献也没找
3 r9 J! I& U7 i! v腺病毒：Induced Pluripotent Stem Cells Generated Without Viral Integration2 `) V! k. ~  ~, P: g$ m, L" t. L2 H
质粒：Generation of Mouse Induced Pluripotent Stem Cells Without Viral Vectors——yamanaka 用两个质粒载体
: \5 g- z* u- F/ U+ ]& Q) L; H; @Piggyback： piggyBac transposition reprograms fibroblasts to induced pluripotent stem cells ——使用PiggyBac，安全性高，效率高
1 b4 }% Z- A, [- m; D蛋白诱导：Generation of Induced Pluripotent Stem Cells Using Recombinant Proteins——第一篇使用蛋白诱导
" w' S" n5 B* I3 O$ o! R化学方法：A chemical platform for improved induction of human iPSCs——效率提高了100倍. J! X3 G2 f0 F) U' O9 a
4、        细胞类型：
# @; g# t9 z. N4 l: O  t最初都是成纤维细胞* \5 n) b, Y/ g4 j' A. e( `
脂肪干细胞 ：Feeder-free derivation of induced pluripotent stem  cells from adult human adipose stem cells, Q8 r; t" A* v4 t- u3 E
肝细胞和胃细胞；Generation of Pluripotent Stem Cells from Adult Mouse Liver and Stomach Cells
( M2 f- p9 l3 O) D  应该还有其他细胞类型，只是我还没看到" p8 y: M* S, F' I+ M
5、        生物物种：6 r: Y8 i" U4 h8 Y5 s9 J
小鼠：最初的文献均是小鼠的
- p( n- E) O% M" Q$ @人  ：2007年James Thomson和Yamanaka小组同时成功7 s- G/ H0 j$ p1 Q5 Z
          Yamanaka：Oct3/4, Sox2, Klf4, and c-Myc with a retroviral system' |# B" k! `& |2 n: q7 w
      Thomson used OCT4, SOX2, NANOG, and a different gene LIN28 using a lentiviral syst  X3 O. }2 }- l3 I! ^* }
大鼠 ：Generation of Induced Pluripotent Stem Cell Lines from Adult Rat Cells: j: [$ C; \# k5 h+ |* |( A
猪：generation of induced pluripotent stem cell lines from tibetan miniature pig
! l9 T+ M9 y: }8 `猴：Generation of Induced Pluripotent Stem Cells from Adult Rhesus Monkey Fibroblasts3 d  k0 _, e2 o9 y3 r. v9 z7 M* c4 N
   其他物种的还没看到
6 q  L8 s+ d, w" J6 |6、培养条件：
% F, f/ }5 f& ?/ A$ w   只看了一个方面：Hypoxia Enhances the Generation of Induced Pluripotent Stem Cells——低氧有利于形成ips/ K8 o/ e* ^0 Y3 s
三、        ips特点方面的研究
( p' E9 ]& j3 a/ V1、        人类IPS带有供体细胞某些特征：Transcriptional Signature and Memory Retention of Human-Induced Pluripotent Stem Cells/ \/ J8 T9 D5 Z! U& [
2、        Ips可以产生活体小鼠：iPS cells produce viable mice through tetraploid            complementation——周琪
" X$ d) d1 A" H5 r5 F: G   Adult mice generated from induced pluripotent stem cells
/ B3 E4 w& z) \* a) l   其他的请大家补充了1 O4 k) D) H: |1 c3 ?3 |
四、        现阶段研究重点：5 f$ p9 \/ A& `* ?- d
我认为应该是侧重于三个方面：机制方面（如p53通路等的研究一次性就出现五篇nature，还有不断有人提出某些基因或物质对重编程的影响）
) |# C; Z6 ~( C* U  `  h+ |$ \; z                             安全性改进（如从病毒载体一直进化到化学方法，piggyBac也是重编程后马上切除外源基因）) f1 K; a+ b8 J0 W
                             应用方面：安全评测完毕后，主要应用于疾病治疗了2 s% \8 r0 [( e$ Z
/ ]4 Z1 }, P. |  y- U% H$ ^

; |0 i7 x* l% t8 D$ u
# M8 o& _4 c/ @8 ?; }9 x2 o# W我认为，随着技术的进步，每种方法的效率提高程度怎样也是很重要的，只是本人看得东西太少了，还未总结出来！

lorey

文献太多，没有都传上来！

细胞海洋

支持原创，继续努力

托斯卡纳教父

很不错，加油。提点意见：应用方向还不是研究重点。因为谈应用还为时尚早。

刘实

好像有一段时间CNS没登IPS原创新发现了吧？是不是要熄火了？

芷瞻

好像有一段时间CNS没登IPS原创新发现了吧？是不是要熄火了？' H( g3 G5 q' f/ U, M6 P( F
刘实 发表于 2009-10-28 17:43

6 m( B0 Y3 B! E; R( T
. n) ]  @; M3 k: p5 ?2 S, z
8 S# \" r9 e' E9 f& q: y2 R
^_^，都是您（宇宙第一高人）推动的结果，赞你的卓越远见！

zisefuping

楼主已经总结的很全了，我也要开始做ips了，不知道进程是否会顺利。

hjc1988

支持原创