microRNA名称后星号的含义是什么？

ambassador

请问，microRNA名称后星号的含义是什么？比如：hsa-mir-124和hsa-mir-124*，是同一家族的不同分子吗？如果是同一家族，但它们不仅序列不同，而且hsa-mir-124*中不含有hsa-mir-124的seed sequence，而用TargetScan也无法预测hsa-mir-124*的靶基因，请高手给予解答。

wuxiao101325

miRNA* 是 pre-miRNA 上的一段 RNA，其位置恰好与成熟的 miRNA 相对。虽然 Dicer 在对pre-miRNA 的加工过程中能够产生RNA 双链中间体，但是这种中间体通常寿命比较短暂而不易被探测。不过，如果大量的前体均可产生并只产生一种 miRNA，则其双链中的星号链也可以成为成熟的 miRNA。

wuxiao101325

最早出处：mmu-miR-28a* is a mature microRNA annotated in miRBase. The star represents that a mature microRNA is expressed from both the 5'-arm and the 3'-arm. In this case the hsa-miR-28a is expressed form the 5'-arm and the mmu-miR-28a* is expressed from the 3' mature sequence

ambassador

miRNA* 是 pre-miRNA 上的一段 RNA，其位置恰好与成熟的 miRNA 相对。虽然 Dicer 在对pre-miRNA 的加工过程 ...) c. s7 X/ |5 ?
wuxiao101325 发表于 2010-5-27 16:57

, T% ]; ^* D1 Y

/ i& A4 u' o- n4 z. Y
7 s1 N3 b: m& K& c    谢谢！有朋友在miRbase中查了下，说是针对同一个microRNA的不同序列 。
6 P2 e( s9 E" ~% ~9 K" o/ b, g$ ]- f2 `$ S! e3 z1 U6 Z7 f0 C
随便举例子：比如miR-？是针对4-16，miR-？*是针对46-60 。
6 U! M4 Z  Z$ }: h3 J7 V
4 G' ~* y/ O9 L8 v" H0 ?和你所说的是同一个意思吗？

wuxiao101325

回复 4# ambassador : e1 x" ]% C8 F, T- O6 t; R" g
其实我也不是很懂，不过这篇综述应该对你有所帮助
' J- O& T7 s; [http://www.stemcell8.cn/viewthread.php?tid=21949&extra=

ambassador

回复  ambassador
7 }0 m6 Q# e" I3 Z9 j3 M( [其实我也不是很懂，不过这篇综述应该对你有所帮助. z* d* }2 s" a+ H! F6 i( Z
wuxiao101325 发表于 2010-5-28 07:33

2 N3 Z" x; i5 D" N, D" D

5 W2 w7 T* ^, q. L8 R
. d9 U3 ~1 ]! m- U1 n) O+ N( l/ X5 z0 ~    谢谢！正好前两天实验室听了陈润生弟子朱小蓬老师的一个报告，关于microRNA及Noncoding RNA的，复习一遍！

hljzyydx

很简单，就是所谓的星链（我们是这么叫的），其实所谓microRNA及其miR*是相对的，microRNA经过加工后是两条链的，但是在沉默复合体中有一条是有作用的，我们习惯上叫它microRNA，而另一条叫miR*，但是有一点希望你注意，那就是miR*与microRNA并非完全匹配。。所以你根据microRNA的互补链的得到的序列不一定是miR*（个人观点）

ambassador

很简单，就是所谓的星链（我们是这么叫的），其实所谓microRNA及其miR*是相对的，microRNA经过加工后是两条 ...
* U: x$ m! S4 r4 N2 O& W; w7 H' thljzyydx 发表于 2010-6-3 16:17

3 |( Y3 ^' g/ a; H7 b
$ n1 L3 O" s6 R# S: `6 ~
6 f' R$ l4 K  Z1 e: I    哦，谢谢啊~这又是一种解释！！！. @9 c& s- _. V
到底哪个是准确的呢？前阵子听了国外一个牛人的报告，麻州大学的翁志萍，讲的就是microRNA*，晕乎乎，整理中！有没有原文献啊~亟待解决中！

hljzyydx

回复 8# ambassador 5 N# n, a" l9 z
& v; ^, q. G$ X- W- w
; Z5 z5 D, ]; C% a- }
    呵呵，你可以简单的理解为互补链，因为MIR加工出来是两条链，传统认为一条是有意义的，我们叫MIR，另一条是无意义的，我们称星链，但是近年有报道MIR起作用有一些其实是通过星链起作用，而不是传统意义的MIR，所以这个话题现在才这么多人研究！就像我之前说的，星链和MIR不是完全互补的（我记得是这样，但有点记不清了）。

siyue13

很简单，就是所谓的星链（我们是这么叫的），其实所谓microRNA及其miR*是相对的，microRNA经过加工后是两条 ...; O! K0 Z; j: [& k& l
hljzyydx 发表于 2010-6-3 16:17

5 d2 c' o5 b" A$ h9 Z: ?2 H, T$ A: Z
) H; w. E5 l& V  Egood