研究甲基化的软件、网页

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软件：
: y1 o! t$ g2 `* A8 C. ^0 ~1 L" X1.MethPrimer -DNA甲基化CpG岛预测及引物设计在线软件
+ B: C4 p0 V2 m6 v本在线软件可以预测CpG岛，并自动生成甲基化研究的引物。非常实用方便。
9 G% p- S! N2 x' ?0 E8 h* Z0 c1 ~http://www.urogene.org/methprimer/index1.html: S9 Z6 r7 ]7 X6 f
  M- I3 t+ x# Z' }! o# }9 A4 k
2. Methyl Primer Expres-另一个甲基化研究的引物设计软件
/ P. g/ j! ^  V  V/ x3 @$ g2 d这一研究工具主要作用是辅助设计出具有甲基化 (methylation)或硫化 (bisulphite)的特殊聚合酶链锁反应的引物(primers) 。在进行DNA甲基化分析的研究过程中，许多研究人员认为最麻烦也是最花时间的过程，就属设计出具有专一性辨识能力的特异核酸引物，ABI技术人员指出，这一套软件几乎可以在短短五分钟之内，设计出合用的核酸引物。
/ [' J6 |( C5 r: k3 b' ?目前这套专利权仍属于ABI
8 r# P, |3 v& f! m1 _下载地址：! L+ a3 t. R4 I$ }" A' \
https://products.appliedbiosyste ... 21&tab=Overview
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3.BiQ Analyzer- a softwaretool for easy visualization and quality control of DNA methylation data frombisulfite sequencing.
9 o! q% r( a9 b$ s; f本软件最大的优点就是整理分析BSP测序后的数据，并能得到BSP研究结果经典的圆心黑点图。
" {% k% q2 C. H/ K; P* K5 j2 x先安装Java，才能安装BiQ.
: E6 g9 P) `  F; h  {7 ?+ yhttp://biq-analyzer.bioinf.mpi-sb.mpg.de/
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' k0 J) J5 [) |6 j3 w一些研究甲基化的网页" w! v' `$ L! d1 `% _' `/ T2 `. y2 k
怎样找到某一个基因的CpG岛序列( B8 Q* y+ `" Y* n+ V. M0 [
http://www.ebi.ac.uk/emboss/cpgplot/8 w) M5 K$ `6 \2 `+ H. c
推荐三个网站+ N6 `+ J( x0 X. T
http://www.methdb.de/' J' r4 T# w, o7 p
http://www.sciencemag.org/featur ... res_epigenetics.dtl
  W9 x! b# n. q! v" _6 ^( l/ Vwww.hopkinsmedicine.org/epigenetics+ B$ V  g% D+ H6 k3 L4 l) }
4 H) F' I1 e4 T/ I
分析该基因的promoter的CpG岛：打开http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgGateway的网站(注意选择物种) 5 W; t; A8 h, X

* h3 z2 E( f* e8 I2 o" E  ^  X甲基化基因的引物库5 k3 E8 n( z# \1 }4 D8 v
http://medgen.ugent.be/methprimerdb/index.php
, p, S$ n; d; t  i, Q
5 O; h  O  @; P( bgDNA亚硫酸氢盐处理后，用于甲基化的blast：
3 y7 `) }4 s# y- Y6 S8 xhttp://medgen.ugent.be/methBLAST/