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[请教] 有人做过intracellular staining吗? [复制链接]

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包包
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楼主
发表于 2010-10-2 13:30 |只看该作者 |倒序浏览 |打印
大家好,我想问一下有没有人做过intracellular staining,是针对非cell surface marker 的一种流式细胞仪的染色方式,进行intracellular staining之后可以进行与cell surface 相似的流式细胞仪分析或分选,但是我现在想回收一下分选细胞的total RNA ,不知可否,不知intracellular staining是不是会损坏细胞内的RNA ,毕竟RNA 易降解。
# g+ H# k6 V" o* |谢谢 !
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专家 优秀会员 金话筒 新闻小组成员

沙发
发表于 2010-10-5 12:37 |只看该作者
to chumin战友:
4 C  V/ x0 _/ p1 a5 z9 Y+ v
6 |/ Z& f3 Z4 @) q& f   标记细胞内抗原后进行细胞分选是绝对可以实现的,但是确实会对细胞内的RNA造成损失,比如说RNA的丢失,RNA的讲解。我尝试着查找文献,但是没有找到。
# {7 g2 T- ?7 \6 w, e, C: Z$ w* t# O
   这样做在理论上是可以实现的,如果你确实需要的话,完全可以自己尝试。, }/ W  F3 n* j( S9 e2 l3 f2 p
) Y% Y) k: K- V1 C; e" ]
   据我的经验有以下几点需要注意:7 W; ]2 j0 a" ^" j; W' i

9 V  _9 r& q* n( ~+ F. g* @   1.要做胞内蛋白染色,还是需要把细胞固定后再做染色。不然的在细胞穿孔过程中会有蛋白的丢失。你的抗体能进入细胞,细胞内的蛋白当然也能跑到细胞外。
  E: m6 A+ F$ J
5 Z. x- {( k) x; c( t' D+ J, \0 z   2.细胞穿孔时,尽量应用Saponin这样的可逆性穿孔试剂。8 Y1 u+ n- v5 K; w2 p

6 }  L) Y2 d0 I+ R) G2 ^" s+ H   3.无论如何,只要你能把实验的过程完成,就一定能发现你分选出的细胞之间存在RNA表达谱的差异,但是应该会是高丰度RNA的基因,低丰度估计就要难一些。如果你是广泛的筛选实验的话,当然一定会有数据。但是如果你只想知道你感兴趣的基因是否有差异,那还需要一定的运气。+ v* ^! a9 `/ b# P7 I* V5 t+ |
! Z/ w& e( T, ]7 f
   4.为了防止RNA的降解,你所有的液体和试剂还是要尽量避免RNase的污染。比如,所有的水都使用milli Q纯水,最好是出水口带有Biopak处理器的那种。所有的枪头都用DEPC处理。
, t$ L) B. _  M; _! i: c+ }* d" M3 l- M5 z+ F  O; ^; _
   5.还可以考虑在你配置的液体里加入RNase抑制剂或者RNA保护剂。
! A% L4 {! `5 @; b3 E) \+ u  u  q" z6 K) {: M
    但是一切都需要你摸索。你也需要考虑成本效益原则。
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藤椅
发表于 2010-10-5 15:39 |只看该作者
真的太感谢了,讲的很明白,谢谢!
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