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MiRNA芯片7 v' E, l) }3 b: h1 s- s
Exiqon; x0 }+ l$ u( X% y
microRNA人，小鼠，大鼠芯片
8 a2 e3 v# l9 y* 覆盖miRBase 数据库人，小鼠，大鼠三物种全部microRNA，人（约847条），小鼠（约609条），大鼠（约351条）
, P8 H. V# ?: S! v& n+ L9 k e7 h+ c* 覆盖与上述三物种相关的所有病毒的microRNA0 U) J- }/ W6 Q6 m% ]8 R+ k% h
* 428个Exiqon特有的miRPlusTM捕获探针，提供miRBase 数据库之外的microRNA预测信息。miRPlusTM捕获探针对microRNA预测的准确性高，在现有的miRBase 数据库中，有30%的microRNA与miRPlusTM探针所预测的序列一致, ]+ X) s( d( G4 k7 n1 [' }
* 芯片内超过1700个miRNA捕获探针，并且每个探针重复4次3 V: H# \% h0 T. d
* 8个阴性对照探针，26个小核RNA阳性对照探针
! {# }2 ~7 [, A! M
5 E) g- D. `( u7 NmicroRNA全物种芯片 i0 h# ^4 r' z/ ~6 I
* 覆盖的miRBase数据库内除人，大鼠，小鼠及其相关病毒之外的全部物种（包括脊椎动物，无脊椎动物，植物，病毒等）的所有microRNA
! L0 G8 _* X% G" o* 芯片内超过2500个miRNA捕获探针，并且每个探针重复4次6 \! p% }! l0 M( c/ |0 a9 D" \
* 8个阴性对照，26个小核RNA阳性对照探针
9 X9 p( O+ @; f) B
6 x+ U/ U8 s( l联川6 r* k+ G% ~8 @; U, K
100% Sanger microRNA 14.0版探针信息 . j( k; z" t9 ~& M7 s; m' T
全球首家提供最新Sanger 14.0版microRNA微阵列检测服务。我们的标准microRNA微阵列芯片可对最新版数据库报道的包括人、大鼠、小鼠、斑马鱼、鸡、猪、水稻、玉米、拟南芥、病毒等在内的所有单个物种或是同类物种组，如哺乳动物、植物等，microRNA进行检测，并提供完整的数据分析。 [! v- Y- Z( [+ E( f' m) P9 `( h
4 Z# M5 l& Z' H p) u, D高度灵活的探针序列
_: x: e2 y. A- [基于创新的µ araflo® 芯片合成技术（原位合成），我们能够完全按照您的要求进行阵列合成。在我们的标准 microRNA微阵列上，您可以免费添加100条定制序列探针（长度≤25nt）。我们也提供完全定制微阵列服务，满足您进行预测序列验证，新型small RNA发现等研究的需求。
6 U7 b; W( t3 U1 N4 y7 M9 t- ~& u( T" ^; L9 Q
微流体微阵列平台
- L7 T# Z: M' c+ j, l1 g6 R, U创新的μParaflo® 技术将高通量并联合成技术，微流体技术以及数字光化学合成定制阵列技术融为一体。凭借此项技术，我们可提供双色标记微阵列芯片（2个样品/芯片）和单色标记微阵列芯片（1个样品/芯片）以满足您不同的研究需求。不仅如此，运用这一领先的微阵列平台，我们可为您提供相比于传统点样阵列更为可靠更为优异的实验结果。 * ]9 l% |" H2 d3 [3 b
, h7 p% O+ u$ l% G* Z0 J# D" `严格的质量控制标准 5 ?; f0 Z5 l' q" y2 z" _# ?
运用μParaflo® 技术进行原位合成芯片，可确保合成高质量的探针，并可进行高严谨性的过程控制。运用此项技术获取的微阵列实验数据是高度可信并且是可重复的。您可采用Real-time PCR和Northern Blot进行验证。 ' F M* _, r- d- w: B+ k( t
4 s3 C8 c) O8 ~8 x% T# f高质量的数据结果
* [$ h. Z$ c3 q; a# y, |6 N( Y, W: j我们的阵列平台性能优异，噪音信号被控制在极低的水平，因而可揭示出样品中真实的生物学差异。我们服务的客户已发表了大量的高水平文章。截至目前，客户已发表73篇论文，其中Nature4篇，Science1篇。
6 i8 v$ Z' l: p1 j! R4 C E8 } O$ _9 ]
高效经济的“一站式”解决方案 6 ?* ~1 u! h) ]$ r0 E f" w4 X( K1 u
全方位的microRNA表达谱分析服务包括从总RNA到数据报告的一站式服务，为你节省大量的时间、精力和实验材料。
& s+ s+ E% A* c2 [& N/ _1 t' c+ s# o. H k" b ]$ U
--------------------------------------------------------------------------------7 B7 L. b2 @4 @7 u
" U3 v( S9 G4 K' c/ A) O* \
2009年3月9日，Sanger microRNA数据库(miRBase)升级至14.0版。/ O3 H# f3 y+ N) {, h+ S; C) e
; m3 u Z5 B( ^8 ^; W5 p2009年9月15日，Sanger microRNA序列数据库(miRBase)升级至14.0版。随着1580条新的成熟miR和miR*序列的加入，miRBase数据库中收录的microRNA序列信息已超过10,000条。新版本共收录10,581条成熟miRNA序列信息，通过验证的microRNA发夹前体从9,539条增至10,883条，共涵盖115个物种。 1 v6 F: N8 k# H; T" s7 Y
$ n9 A! u4 U6 l' {6 |" a; \新增microRNA序列主要集中在以下物种：3 A) P9 G/ f3 T% \4 G
9 |! X8 q; c" p; L5 g9 s
1. 模式生物－Homo sapiens (人，新增15条，共721条)，Mus musculus (小鼠，新增32条，共579条)，Rattus norvegicus (大鼠，新增39，共286条)，Danio rerio (斑马鱼，新增24条，共360条)，Drosophila melanogaster (黑腹果蝇，新增5条，共152条)，Bombyx mori (家蚕，新增36条，共91条)，Caenorhabditis elegans (秀丽隐杆线虫，新增19条，共174条)，Arabidopsis thaliana (拟南芥，新增3条，共190条) 0 W! A/ K9 X; n/ P7 g# ]) j) f
( u4 A, s3 I/ B, Z( Q2. 重要的农业作物(共新增280条miR序列)：Arabidopsis thaliana (拟南芥)，Glycine max (大豆)，Oryza sativa (水稻)，Zea mays (玉米)，Sorghum bicolor (高粱)，Medicago truncatula (蒺藜苜蓿) ) R( Z, U2 \5 O- h; ]- S
& q+ V3 j: ]6 [8 x3. 病毒(新增30条miR序列) & L8 Y3 g# ~$ D, F3 i3 t9 A% K
" `2 m) [( w) J" p5 w
除此之外，新版microRNA数据库第一次报道了10个物种的microRNA信息，它们是：Equus caballus (野马)，Daphnia pulex (蚤状溞)，Phaseolus vulgaris (菜豆)，Malus domestica (苹果)，Brachypodium distachyon (二穗短柄草)，Aquilegia coerulea (洛矶山耧斗菜)，Populus euphratica (胡杨)，Herpes B virus (乙型疱疹病毒)， Infectious laryngotracheitis virus (传染性喉气管炎病毒)，Herpesvirus of turkeys (火鸡疱疹病毒)。- c) ]( |2 J% h0 o
4 [& Y8 }9 Z' j# ?6 F: p8 b: U3 I
Affymetrix
4 h# v9 R! r/ g8 A, P. H( j3 bAffymetrix miRNA芯片在一张芯片上覆盖了多个物种，包括拟南芥、水稻、玉米等重要植物模式生物，序列信息源于sanger miRNA数据库v11.0及小分子RNA2 h! k: h2 F) i# G: O% p; [4 _9 g
- n8 |* w: A8 z) v N5 @安捷伦
& K( T9 k; c) m0 V) @Agilent microRNA芯片技术特点
) m) H3 }( {) M" A9 M8 T. Y, ^5 l, p% H
1、唯一能区分成熟miRNA和miRNA前体的芯片平台；
7 p3 O4 G/ b2 W" M h7 }( C2、无需分离miRNA，直接用Total RNA 进行实验；) E- Q% V4 o; F8 Z$ P
3、只需100ng的Total RNA 即可用来进行标记实验(不含质检所消耗的量)， 避 免了分离、富集、放大等过程带来的影响； - G5 M6 W. u7 Q
4、样品适用范围广：组织、血清、血浆、FFPE、冰冻切片组织、脱落细胞等均可进行实验；
, k+ d. x$ A6 r: r5、高特异性：特殊的专利探针设计能区别一个碱基的差异；
- }& D# ^. w. ?& y9 l6、高灵敏度：检测丰度跨4个log，最高可达6个log，只要存在6000个拷贝的分子就可以检出；
6 x3 z4 q! f5 ~6 M: x7、数据来源于Sanger 13.0版本，并方便及时更新； 6 R# s# B5 ^+ a2 Y( v
8、人、大鼠、小鼠之外的物种，可以方便的通过earray进行个性化定制。/ v. ~% w* [- J" D- W1 u- B
% H4 R( N/ u7 j% tIllumina/ y% N `; ?* S% ~% P9 A0 U
Illumina microRNA表达谱基因芯片特点：4 ?' V: U4 r7 V$ i# A* e
*样本量低：单次反应仅需200ng总RNA；
) P6 C7 w4 J. k*高通量：一次可进行12个样本或者96个样本的芯片试验；
. R& @% e. l! a0 o" S/ A. c*最低检出限度：1*104分子；
; o- c4 W$ r }% ~2 t6 R*表达差异检测范围：≤1.3倍；
+ u* i5 r2 V z9 _2 c, K*通量范围：〉2.5logs；
- W/ f* J- E- O. P*重复性指标：R2≥0.97。" c' f. b1 S' @7 w r" T
人microRNA基因芯片 小鼠microRNA基因芯片
7 W: B, n8 I' j0 h$ H; S5 j- c1 l0 EmicroRNA 基因数量 1146个基因 656个基因3 q" J% M( V$ R0 s/ o5 Z
信息来源 sanger miRBase,V 12.0.Febraury 2007 release sanger miRBase,V 12.0.Febraury 2007 release
6 |* @2 p6 ?6 i; t, W% t. o样本数量 12或96个样本 12或96个样本& M$ }9 D1 r- l$ e7 @0 Y$ C" h
芯片重复性 ≥97% ≥97% |
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总评分: 威望 + 2
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发表于 2010-11-18 16:32
